Bakalářská práce

Development of Data Deduplication Model for National Oncology Registry

Jozef Kraus
Anotace

Odborníci Ústavu zdravotnických informací a statistiky (ÚZIS) musí ručně rozhodnout, zda zachovat nebo vyřadit více záznamů s různými kódy MKN-10 o jednom pacientovi. Tyto záznamy jsou pak centralizovány v Národním onkologickém registru (NOR). V této práci popisuji vývoj modelu strojového učení (binárního klasifikátoru), který se učí ze záznamů expertně označených jako zachované nebo vyřazené pomocí …více

Abstract

The Institute of Health Information and Statistics (ÚZIS) experts must manually decide whether to preserve or drop multiple records with different ICD-10 codes about one patient. These records are then centralized in the National Oncology Registry (NOR). In this work, I describe the development of a machine-learning model (a binary classifier) that learns from the records expertly labeled as preserved …více

Zadání práce
The National Health Registries managed by the Institute of Health Information and Statistics (ÚZIS) are a healthcare information system used for the implementation of national health policies and for medical and public health research. One of these registries is the National Oncology Registry (NOR), which is used to centralize and manage data about cancer patients. This registry is filled by a range of organizations, from healthcare facilities to health insurance companies. The aim of the work is to train a machine learning system that will enable the analysis of data in the NOR, which are provided by individual organizations, and to identify the most relevant records in overlapping entries. The system will return the most relevant record, or possibly a probabilistic evaluation of each record. The system will be trained on data evaluated by experts between the years 2019-2021 and will be verified on expertly resolved data from 2022 (to the extent possible - otherwise testing data needs to be split from the 2019-2021 data). The work will include experimental evaluation and comparison of different models using metrics commonly used in machine learning. Furthermore, the models will be analyzed from the perspective of explainability - either through their own explainability or by using post-hoc methods. The system will be implemented in a project collaboration with ÚZIS.
Práce zkontrolována:
24. 5. 2024 16:53, doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
25. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
CBMAI CERIT SC ÚVT MU

Oponent

doc. Mgr. Bc. Vít Nováček, PhD, učo 4049
KSUZD FI MU

Konzultant

doc. RNDr. Tomáš Brázdil, Ph.D., MBA, učo 4074
KSUZD FI MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.