Diplomová práce

Možnosti získání starobylé mitochondriální DNA z lidského zubního kamene

The possibilities of obtaining ancient mitochondrial DNA from the human dental calculus

Bc. Noemi Hrubová
Anotace

Úspěšné získání celých starobylých mitochondriálních genomů pomocí sekvenování nové generace a porovnání výsledků dvou postupů pro zachycení (obohacení) mtDNA proběhlo u čtyř vzorků zubního kamene jedinců z velkomoravského pohřebiště Znojmo-Hradiště. Porovnáním bylo potvrzeno vhodnější použití sady myBaits pro tento typ materiálu, kdy bylo získáno pokrytí starobylých mitogenomů v hodnotách 5−53× oproti …více

Abstract

The successful recovery of four ancient mitochondrial genomes by next-generation sequencing and comparison of two mtDNA targeted capture and enrichment methods were performed on four dental calculus samples from the Great Moravian burial site Znojmo-Hradiště. The comparison confirmed the myBaits kit as more efficient method with the mitogenome coverage 5−53× unlike the xGen IDT kit, where no complete …více

Klíčová slova
starobylá DNA zubní kámen mitochondriální genom sekvenování nové generace hybridizační sondy zachycení a obohacení mtDNA ancient DNA dental calculus mitochondrial genome next-generation sequencing mtDNA hybridization capture and enrichment
Zadání práce
DNA obsažena v zubním kameni je z více jak z 90 % bakteriální. Zbylá procenta připadají virům a eukaryotickým organismům, mezi které patří i DNA člověka, z kterého byl kámen odebrán. U historických populací je potřeba tuto DNA analyzovat v případech, kdy není možné analyzovat aDNA lidí přímo z kosterních pozůstatků. Již bylo prokázáno, že toto nepatrné množství aDNA ze zubního kamene lze zachytit a analyzovat. Diplomová práce se bude zaměřovat přímo na zachycení (obohacení) tzv. starobylé mitochondriální DNA (amtDNA) z historického zubního kamene. Cílem tedy bude vyhledat možnosti získání mtDNA z tohoto materiálu a prakticky porovnat několik metod obohacování.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2022 15:59, Mgr. Dana Buriánková Fialová, Ph.D., učo 184570
Plný text práce
2,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
10. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Dana Buriánková Fialová, Ph.D., učo 184570
Genet ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Pavel Mikel, Ph.D.
ÚEB Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biologie člověka

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.