Diplomová práce

Segmentation of Tunneling Nanotubes Using U-Net-Like Neural Networks

Bc. Bruno Petrus, učo 514305
Anotace

Táto diplomová práca sa zaoberá automatickou sémantickou segmentáciou nanotubulárnych prepojení v 3D mikroskopických snímkach krídiel drozofíl. Práca riešila problémy súvisiace s vysokou priestorovou anizotropiou nasnímaných obrazových dát a jej riedkymi referenčnými anotáciami. Hlavným prínosom je vývoj siete AnisoUNet, anizotropného variantu architektúry typu U-Net navrhnutého na efektívne spracovanie …více

Abstract

This thesis addresses the automated semantic segmentation of tunnelling nanotubes (TNTs) in 3D Drosophila wing microscopy images. The work tackled challenges posed by a high spatial anisotropy of the analysed image data and its sparse reference annotations. The primary contribution is the development of AnisoUNet, an anisotropic U-Net-like architecture designed to effectively handle the highly anisotropic …více

Zadání práce
The primary objective of this thesis is to investigate the possibilities of different U-Net-like neural networks for segmenting tunneling nanotubes in multidimensional fluorescence microscopy image data of Drosophila's wings. The textual part of the thesis must include a concise and comprehensive description of the evaluated networks and their quantitative as well as qualitative performance comparison focused on segmentation accuracy, execution time, and memory consumption. The implementation of the evaluated networks, including training protocols and pre-trained models, will be delivered in an easy-to-use form and complemented with a practical guide that documents the exemplary usage of individual networks.
Práce zkontrolována:
17. 12. 2025 08:15, doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D., učo 60734
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
2. 2. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D., učo 60734
KVI FI MU

Oponent

doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
KVI FI MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Analýza a zpracování obrazu
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.