Diplomová práce

Mechanismus vazby na DNA telomerových proteinů účastnících se při ochraně lidských chromozomů

DNA binding mechanism of telomeric proteins protecting human chromosomes

Bc. Klára Boudná
Anotace

Shelterin je specifický telomerový komplex tvořený šesti různými proteiny z nichž dva proteiny TRF1 a TRF2 specificky vážou dvouřetězcovou telomerovou DNA. TRF1 se rozhodujícím způsobem podílí na replikaci a zabraňuje prodlužování telomer. TRF2 se podílí na uspořádání telomerové DNA a hraje klíčovou roli v ochraně konců chromozomů. Tato práce je zaměřena na optimalizaci přípravy TRF1 v dostatečné čistotě …více

Abstract

Shelterin is a specific telomere complex comprising six different proteins, two subunits - TRF1 and TRF2 specifically bind double-stranded telomeric DNA. TRF1 is involved in replication and prevents telomere elongation. TRF2 is involved in telomeric DNA organization and plays a key role in protecting the ends of chromosomes. This work is aimed at optimizing the preparation of TRF1 in sufficient purity …více

Klíčová slova
telomery shelterin telomeráza netelomerické funkce DNA DNA-vazebné proteiny proteinové komplexy proteiny TRF1 TRF2 CL7/Im7 anizotropie fluorescence DLS DSF EMSA
Zadání práce

V rámci práce bude probíhat výzkum lidských telomerových proteinů, které specificky rozpoznávají telomerovou DNA. Konkrétně se bude jednat o proteiny TRF1 a TRF2~-~telomere repeat binding protein 1 and 2.

Tyto proteiny se vážou na dvouřetězcovou telomerovou DNA a chrání ji před nechtěným rozpoznáním úplných konců chromozomů jako zlomů na DNA, které by jinak byly opravovány reparačními systémy buňky.

Bude testována hypotéza, že protein TRF1 způsobuje odvázání proteinu TRF2 z DNA a tím reguluje míru ochrany telomerové DNA.

V rámci experimentální práce bude prováděno:
  • Klonování proteinu TRF1, TRF2 a jeho následná optimalizace exprese a purifikace.
  • Charakterizace stability připravených proteinů v různých podmínkách za použití metod MS, DLS a DSF.
  • Určení afinity proteinů TRF1 a TRF2 na telomerovou a netelomerovou dvouřetězcovou DNA.
  • Při kompetitivním uspořádání určení míry ovlivnění vazby TRF2 na DNA za přítomnosti TRF1.
  • Měření s eventuálním zahrnutí dalších telomerových proteinů jako RAP1 a TIN2.

Tyto dílčí úkoly budou upraveny na základě vývoje získávání vědeckých poznatků a objektivních možností výzkumu v laboratoři.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
13. 1. 2023 08:53, doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807
Plný text práce
3,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
8. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Barbora Štefanovie, Ph.D., učo 142123
NCBR PřF MU

Konzultant

Ing. Tomáš Janovič, Ph.D., učo 366321
ÚBioch Chem PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Analytická biochemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.