Diplomová práce

Charakterizace mobilních genetických elementů a potenciálních faktorů virulence v genomu Macrococcus sp. z humánního klinického materiálu

Characterization of mobile genetic elements and possible virulence genes in genomes of Macrococcus sp. isolated from human clinical specimens

Bc. Zuzana Kaštilová
Anotace

V této práci byly osekvenovány genomy čtyř kmenů Macrococcus spp. izolovaných z humánního klinického materiálu a data analyzována se zaměřením na mobilní genetické elementy a faktory virulence. Byly identifikovány a bioinformatickými metodami blíže charakterizovány plazmidy a profágy těchto kmenů. Profágy byly také indukovány UV zářením a profág z kmene CCM 7927 byl charakterizován elektronovou mikroskopií …více

Abstract

Genomes of four strains Macrococcus spp. isolated from human clinical specimens were sequenced and analysed with focus on mobile genetic elements. Plasmids and prophages of these strains were identified and characterized using bioinformatic methods. Prophages were also induced by UV light and prophage of strain CCM 7927 was characterized using electron microscopy. Three staphylococcal cassette chromosomes …více

Klíčová slova
celogenomové sekvenování stafylokoková chromozomová kazeta plazmid profág faktory virulence Macrococcus sp. whole genome sequencing staphylococcal cassette chromosome plasmid prophage virulence factors
Zadání práce
Na základě celogenomového sekvenování genomu 3 kmenů makrokoků metodou NGS bude provedena srovnávací bioinformatická analýza a identifikovány profágy, plazmidy a ostrovy rezistence. Profágy budou indukovány a charakterizovány elektronovou mikroskopií. V částicích profágů budou detekovány metodou real-time PCR potenciální faktory virulence a antibiotikové rezistence
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
5. 1. 2017 01:06, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842
Plný text práce
3,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
8. 2. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842
Pracoviště výzkumu genomu Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
ÚEB Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.