Disertační práce

Bioinformatics analysis of protein properties

Mgr. Bc. Gabriela Bučeková, učo 436961
Anotace

Experimentální data o struktuře proteinů, uložená v Protein Data Bank, představují velmi cenný vstup pro výzkum, na základě kterého bylo učiněno mnoho významných objevů. Struktury proteinů jsou navíc nepostradatelným vstupem různých výpočetních metod – jsou například nezbytné pro výpočet různých vlastností proteinů. Právě tyto výpočetně získané vlastnosti proteinů a jejich analýza tvoří hlavní téma …více

Abstract

Experimental protein structure data stored in the Protein Data Bank provide highly valuable input for research, and many significant discoveries have been made based on these data. Moreover, protein structures serve as a key input for various computational methods - for example, they are essential for calculating protein properties. These computationally derived protein properties and their analysis …více

Klíčová slova
Bioinformatics analysis Biomacromolecular structures Ring conformations Partial atomic charges PDBCharges Protein tunnels MOLEonline Molecular dynamics GROMACS MetaDump bioinformatická analýza biomakromolekulární struktury konformace cyklů parciální atomové náboje proteinové tunely molekulární dynamika
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
4. 6. 2026 07:03, prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
Plný text práce
25 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
3. 9. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
NCBR PřF MU

Oponenti

doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D.
ext RECETOX PřF MU, Fakulta informačních technologií VUT
Assoc. Prof. Vincent Zoete
University of Lausanne

Konzultanti

Mgr. Vladimír Horský, Ph.D., učo 358970
NCBR PřF MU
RNDr. Ondřej Schindler, Ph.D., učo 437155
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biomolekulární chemie a bioinformatika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.