C7301 Genomika - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2025
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: z.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Ing. Šárka Michlíčková (cvičící)
Mgr. Jiří Rudolf (cvičící)
Mgr. Anna Rudolfová (cvičící)
RNDr. Jan Skalák, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lucia Tomovičová (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
NOW( CG020 Genomika )
Předpokladem pro porozumění předmětu je absolvování základů biochemie nebo molekulární biologie a genetiky.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 12/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Jiné omezení: pro zápis do cvičení je nutné absolvování teoretické přednášky Bi7201
Mateřské obory/plány
předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Studenti získají praktické zkušenosti se základními metodami funkční genomiky, t.j. základní přístupy pro analýzu sekvencí DNA in silico, analýza genové exprese pomocí transkripční fůze a automatické mikroskopie, kvantifikace protein-proteinových interakcí in vivo metodou FliM/FRET, identifikace inzerčních mutantů pomocí PCR a kvantifikace genové exprese pomocí RT qPCR. Práce probíhá ve skupinách po 2 a každý si tak může prakticky vyzkoušet samostatný přístup jak k plánování experimentu, tak i jeho provedení.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu získají studenti přehled o základních přístupech funkční genomiky, které budou schopni využít při řešení problémů vlastní odborné praxe.
Osnova
  • Práce s databázemi molekulárně-biologických informací
  • Analýza genové exprese pomocí transkripční fůze
  • Kvantifikace protein-proteinových interakcí in vivo pomocí FLIM/FRET
  • Izolace rostlinné genomové DNA
  • Identifikace inzerčního mutanta pomocí PCR
  • Izolace RNA
  • Kvantifikace genové exprese pmocí RT qPCR
  • Základy automatické a konfokální mikroskopie
Literatura
  • Functional genomics : methods and protocols. Edited by Michael J. Brownstein - Arkady B. Khodursky. Totowa, N.J.: Humana Press, 2003, xii, 258. ISBN 1588292916. info
  • Plant functional genomics. Edited by Erich Grotewold. Totowa, N.J.: Humana Press, 2003, xv, 449 s. ISBN 1588291456. info
Výukové metody
Praktické řešení problémů demonstrujících využití základních nástrojů funkční genomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Navazující předměty
Informace učitele
Výuka předmětu bude probíhat blokově v termínu od 15. do 19.12. 2025.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2025/C7301