Informace o předmětu

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Rozsah

0/2/0. 30. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučováno částečně online.

Vyučující

doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Monika Šudáková
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

VLBC0321c/01: St 12:00–13:40 A16/213
VLBC0321c/02: St 12:00–13:40 A16/213
VLBC0321c/03: St 8:00–9:40 A16/215, J. Gregorová
VLBC0321c/04: St 8:00–9:40 A16/215, J. Gregorová
VLBC0321c/05: Pá 12:00–13:40 A16/215, M. Králíková
VLBC0321c/06: Pá 12:00–13:40 A16/215, M. Králíková
VLBC0321c/07: St 16:00–17:40 A16/213, E. Táborská
VLBC0321c/08: St 16:00–17:40 A16/213, E. Táborská
VLBC0321c/09: St 16:00–17:40 A16/215, H. Paulová
VLBC0321c/10: St 16:00–17:40 A16/215, H. Paulová
VLBC0321c/11: St 12:00–13:40 A16/215, J. Slanina
VLBC0321c/12: St 12:00–13:40 A16/215, J. Slanina
VLBC0321c/13: Pá 14:00–15:40 A16/215, M. Hlaváčová
VLBC0321c/14: Pá 14:00–15:40 A16/215, M. Hlaváčová
VLBC0321c/15: Pá 10:00–11:40 A16/213, M. Tomandlová
VLBC0321c/16: Pá 10:00–11:40 A16/213, M. Tomandlová
VLBC0321c/17: Pá 8:00–9:40 A16/213, J. Dostál
VLBC0321c/18: Pá 8:00–9:40 A16/213, J. Dostál

Předpoklady

VLBI0222c Lékařská biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (4)

Cíle předmětu

Semináře i cvičení mají společnou náplň a slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.

Výstupy z učení

Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
-Být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• 1A: Úvod do biochemie.
• 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
• 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
• 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
• 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
• 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
• 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
• 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
• 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
• 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
• 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
• 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
• 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
• 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
• 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
• 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
• 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
• 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
• 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
• 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
• 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
• 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
• 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
• 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
• 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
• 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
• 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
• 14B: Náhradní témata, konsultace.

Literatura

povinná literatura
• Seminární texty dostupné v IS.
• Podklady k přednáškám dostupné v IS
• KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
• MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat. V závislosti na epidemiologické situaci mohou být podmínky získání zápočtu modifikovány. Aktuální podmínky budou ve Studijních materiálech předmětu v Organizačních pokynech.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Rozsah

0/2/0. 30. 3 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
Lenka Nerudová (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

VLBC0321c/01: Čt 13:00–14:40 A16/213, J. Dostál
VLBC0321c/02: Čt 13:00–14:40 A16/213, J. Dostál
VLBC0321c/03: St 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
VLBC0321c/04: St 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
VLBC0321c/05: Pá 14:00–15:40 A16/213, J. Slanina
VLBC0321c/06: Pá 14:00–15:40 A16/213, J. Slanina
VLBC0321c/07: St 14:00–15:40 A16/213, M. Králíková
VLBC0321c/08: St 14:00–15:40 A16/213, M. Králíková
VLBC0321c/09: Pá 12:00–13:40 A16/215, M. Hlaváčová
VLBC0321c/10: Pá 12:00–13:40 A16/215, M. Hlaváčová
VLBC0321c/11: Čt 15:00–16:40 A16/213, H. Paulová
VLBC0321c/12: Čt 15:00–16:40 A16/213, H. Paulová
VLBC0321c/13: Pá 10:00–11:40 A16/215, E. Táborská
VLBC0321c/14: Pá 10:00–11:40 A16/215, E. Táborská
VLBC0321c/15: Pá 8:00–9:40 A16/215, M. Tomandlová
VLBC0321c/16: Pá 8:00–9:40 A16/215, M. Tomandlová

Předpoklady

VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (2)

Cíle předmětu

Semináře i cvičení mají společnou náplň a slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.

Výstupy z učení

Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
-Být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• 1A: Úvod do biochemie.
• 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
• 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
• 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
• 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
• 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
• 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
• 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
• 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
• 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
• 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
• 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
• 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
• 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
• 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
• 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
• 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
• 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
• 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
• 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
• 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
• 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
• 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
• 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
• 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
• 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
• 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
• 14B: Náhradní témata, konsultace.

Literatura

povinná literatura
• Seminární texty dostupné v IS.
• Podklady k přednáškám dostupné v IS
• KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
• MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Rozsah

0/2/0. 30. 3 kr. Ukončení: z.

Vyučující

Ing. Martina Čarnecká, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
Lenka Nerudová (pomocník)
Mgr. Lucie Novotná (pomocník)
Mgr. Anna Pleskačová, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Roman Sándor, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

VLBC0321c/01: St 8:00–9:40 A16/213
VLBC0321c/02: St 8:00–9:40 A16/213
VLBC0321c/03: St 8:00–9:40 A16/215, J. Tomandl
VLBC0321c/04: St 8:00–9:40 A16/215, J. Tomandl
VLBC0321c/05: Pá 10:00–11:40 A16/215
VLBC0321c/06: Pá 10:00–11:40 A16/215
VLBC0321c/07: Čt 16:00–17:40 A16/215, J. Dostál
VLBC0321c/08: Pá 8:00–9:40 A16/215, M. Tomandlová
VLBC0321c/09: Čt 16:00–17:40 A16/215, J. Dostál
VLBC0321c/10: Pá 8:00–9:40 A16/215, M. Tomandlová
VLBC0321c/11: St 16:00–17:40 A16/215
VLBC0321c/12: St 16:00–17:40 A16/215
VLBC0321c/13: St 14:00–15:40 A16/215
VLBC0321c/14: St 14:00–15:40 A16/215
VLBC0321c/15: Pá 10:00–11:40 A16/213, J. Gregorová
VLBC0321c/16: Pá 10:00–11:40 A16/213, J. Gregorová

Předpoklady

VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (2)

Cíle předmětu

Semináře i cvičení mají společnou náplň a slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.

Výstupy z učení

Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
-Být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
• Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
• Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
• Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
• Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
• Biochemicky významné organické sloučeniny.
• Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
• Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
• Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
• Membránový transport, struktura membrán.
• Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
• Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
• Metabolismus vybraných aminokyselin.
• Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
• Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
• Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
• Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
• Replikace, transkripce, proteosyntéza.

Literatura

povinná literatura
• Seminární texty dostupné v IS.

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Rozsah

0/2/0. 3 kr. Ukončení: z.

Vyučující

Ing. Martina Čarnecká, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
Lenka Nerudová (pomocník)
Mgr. Lucie Novotná (pomocník)
Mgr. Anna Pleskačová, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Roman Sándor, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Ondřej Wiewiorka, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

VLBC0321c/01: St 7:30–9:10 A16/211
VLBC0321c/02: St 7:30–9:10 A16/211
VLBC0321c/03: St 7:30–9:10 A16/211, M. Králíková
VLBC0321c/04: St 7:30–9:10 A16/211, M. Králíková
VLBC0321c/05: Pá 9:20–11:00 A16/211, J. Gregorová
VLBC0321c/06: Pá 9:20–11:00 A16/211, J. Gregorová
VLBC0321c/07: Čt 15:20–17:00 A16/211, M. Čarnecká
VLBC0321c/08: Pá 7:30–9:10 A16/211, M. Tomandlová
VLBC0321c/09: Čt 15:20–17:00 A16/211, M. Čarnecká
VLBC0321c/10: Pá 7:30–9:10 A16/211, M. Tomandlová
VLBC0321c/11: St 16:00–17:40 A16/211, J. Slanina
VLBC0321c/12: St 16:00–17:40 A16/211, J. Slanina
VLBC0321c/13: St 14:00–15:40 A16/211, H. Paulová
VLBC0321c/14: St 14:00–15:40 A16/211, H. Paulová
VLBC0321c/15: Pá 7:30–9:10 A16/211, J. Dostál
VLBC0321c/16: Pá 7:30–9:10 A16/211, J. Dostál
VLBC0321c/17: St 12:00–13:40 A16/211, J. Tomandl
VLBC0321c/18: St 12:00–13:40 A16/211, J. Tomandl

Předpoklady

VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (2)

Cíle předmětu

Semináře i cvičení mají společnou náplň a slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.

Výstupy z učení

Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
-Být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
• Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
• Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
• Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
• Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
• Biochemicky významné organické sloučeniny.
• Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
• Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
• Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
• Membránový transport, struktura membrán.
• Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
• Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
• Metabolismus vybraných aminokyselin.
• Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
• Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
• Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
• Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
• Replikace, transkripce, proteosyntéza.

Literatura

povinná literatura
• Seminární texty dostupné v IS.

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Rozsah

0/2/0. 3 kr. Ukončení: z.

Vyučující

Ing. Martina Čarnecká, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
MUDr. Lenka Gescheidtová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Milena Matejovičová, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
MUDr. RNDr. Michal Řiháček, Ph.D., EuSpLM (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
Lenka Nerudová (pomocník)
Mgr. Lucie Novotná (pomocník)
Mgr. Anna Pleskačová, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Roman Sándor, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

VLBC0321c/01: St 7:30–9:10 A16/211
VLBC0321c/02: St 7:30–9:10 A16/211
VLBC0321c/03: St 7:30–9:10 A16/211, J. Gregorová
VLBC0321c/04: St 7:30–9:10 A16/211, J. Gregorová
VLBC0321c/05: Pá 9:20–11:00 A16/211, M. Tomandlová
VLBC0321c/06: Pá 9:20–11:00 A16/211, M. Tomandlová
VLBC0321c/07: Čt 15:20–17:00 A16/211, M. Čarnecká
VLBC0321c/08: Pá 7:30–9:10 A16/211, J. Tomandl
VLBC0321c/09: Čt 15:20–17:00 A16/211, M. Čarnecká
VLBC0321c/10: Pá 7:30–9:10 A16/211, J. Tomandl
VLBC0321c/11: St 16:00–17:40 A16/211, J. Slanina
VLBC0321c/12: St 16:00–17:40 A16/211, J. Slanina
VLBC0321c/13: St 14:00–15:40 A16/211, H. Paulová
VLBC0321c/14: St 14:00–15:40 A16/211, H. Paulová
VLBC0321c/15: Pá 7:30–9:10 A16/211, J. Dostál
VLBC0321c/16: Pá 7:30–9:10 A16/211, J. Dostál
VLBC0321c/17: St 12:00–13:40 A16/211, M. Králíková
VLBC0321c/18: St 12:00–13:40 A16/211, M. Králíková

Předpoklady

VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (2)

Cíle předmětu

Semináře/cvičení slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. Jsou probírány základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na biochemické dráhy v buňkách. Po absolvování předmětu je student schopen diskutovat principy acidobazických, srážecích a redoxních reakcí, je obeznámen s rolí makro- a mikrobiogenních prvků v organismu,  vlastnostmi a funkcí enzymů, aktivně popisuje základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti. Rozumí principům získávání energie pochody na buněčné úrovni. Je obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně. Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce po translaci a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů. Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy. Porozumí principům některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
• Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
• Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
• Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
• Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
• Biochemicky významné organické sloučeniny.
• Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
• Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
• Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
• Membránový transport, struktura membrán.
• Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
• Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
• Metabolismus vybraných aminokyselin.
• Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
• Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
• Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
• Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
• Replikace, transkripce, proteosyntéza.

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Předmět se v období podzim 2023 nevypisuje.

Rozsah

0/2/0. 30. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučováno částečně online.

Vyučující

doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Monika Šudáková
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Předpoklady

VLBI0222c Lékařská biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (4)

Cíle předmětu

Semináře i cvičení mají společnou náplň a slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.

Výstupy z učení

Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
-Být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• 1A: Úvod do biochemie.
• 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
• 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
• 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
• 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
• 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
• 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
• 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
• 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
• 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
• 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
• 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
• 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
• 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
• 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
• 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
• 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
• 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
• 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
• 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
• 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
• 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
• 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
• 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
• 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
• 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
• 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
• 14B: Náhradní témata, konsultace.

Literatura

povinná literatura
• Seminární texty dostupné v IS.
• Podklady k přednáškám dostupné v IS
• KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
• MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat. V závislosti na epidemiologické situaci mohou být podmínky získání zápočtu modifikovány. Aktuální podmínky budou ve Studijních materiálech předmětu v Organizačních pokynech.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Předmět se v období podzim 2022 nevypisuje.

Rozsah

0/2/0. 30. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučováno částečně online.

Vyučující

doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Monika Šudáková
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Předpoklady

VLBI0222c Lékařská biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (4)

Cíle předmětu

Semináře i cvičení mají společnou náplň a slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.

Výstupy z učení

Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
-Být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• 1A: Úvod do biochemie.
• 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
• 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
• 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
• 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
• 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
• 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
• 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
• 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
• 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
• 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
• 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
• 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
• 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
• 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
• 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
• 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
• 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
• 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
• 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
• 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
• 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
• 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
• 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
• 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
• 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
• 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
• 14B: Náhradní témata, konsultace.

Literatura

povinná literatura
• Seminární texty dostupné v IS.
• Podklady k přednáškám dostupné v IS
• KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
• MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat. V závislosti na epidemiologické situaci mohou být podmínky získání zápočtu modifikovány. Aktuální podmínky budou ve Studijních materiálech předmětu v Organizačních pokynech.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

VLBC0321c Biochemie I - cvičení

Předmět se v období podzim 2021 nevypisuje.

Rozsah

0/2/0. 30. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučováno částečně online.

Vyučující

doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Monika Šudáková
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta

Předpoklady

VLBI0222c Lékařská biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Všeobecné lékařství (program LF, M-VL) (4)

Cíle předmětu

Semináře i cvičení mají společnou náplň a slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.

Výstupy z učení

Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
-Být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.

Osnova

• 1A: Úvod do biochemie.
• 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
• 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
• 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
• 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
• 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
• 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
• 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
• 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
• 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
• 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
• 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
• 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
• 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
• 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
• 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
• 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
• 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
• 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
• 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
• 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
• 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
• 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
• 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
• 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
• 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
• 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
• 14B: Náhradní témata, konsultace.

Literatura

povinná literatura
• Seminární texty dostupné v IS.
• Podklady k přednáškám dostupné v IS
• KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
• MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info

Výukové metody

Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály

Metody hodnocení

Základní podmínkou je absolvování všech seminářů/cvičení. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat. V závislosti na epidemiologické situaci mohou být podmínky získání zápočtu modifikovány. Aktuální podmínky budou ve Studijních materiálech předmětu v Organizačních pokynech.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (nejnovější)