PřF:C2132 Úvod do bioinformatiky - semin - Informace o předmětu

C2132 Úvod do bioinformatiky - seminář

Rozsah

0/1/0. 1 kr. Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně

Vyučující

Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Josef Houser, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Tereza Buráňová (pomocník)
Mgr. Marek Šebesta, Ph.D. (přednášející)

Garance

Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

C2132/01: Po 16. 2. až Pá 22. 5. Čt 10:00–10:50 B09/316
C2132/02: Po 16. 2. až Pá 22. 5. Čt 13:00–13:50 B09/316
C2132/03: Po 16. 2. až Pá 22. 5. Čt 14:00–14:50 B09/316
C2132/04: Po 16. 2. až Pá 22. 5. Čt 15:00–15:50 B09/316

Předpoklady

Základní znalosti o biomakromolekulách (proteiny, nukleové kyseliny).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Anotace

Cílem předmětu je praktické procvičení znalostí získaných v předmětu C2131 Úvod do bioinformatiky.

Výstupy z učení

Student bude na konci kurzu schopen: 1) Predikovat geny v DNA sekvenci. 2) Pracovat se sekvencemi proteinů a DNA. 3) Využívat predikční nástroje. 4) Využívat vizualizační nástroje.

Klíčová témata

1) Základní zdroje bioinformatických dat.
2) Genetická informace, genetický kód, kodonová tabulka. Překlad DNA sekvence.
3) Názvosloví aminokyselin a zkratky – třípísmenné, jednopísmenné.
4) Alignment. Matice. Lokální, globální alignment.
5) Identifikace ORF v sekvenci.
6) Identifikace palindromů v sekvenci.
7) RNA.
8) Distanční matice. Tvorba fylogenetických stromů.
9) Základní vlastnosti proteinů. Predikční nástroje.
10) Predikce sekundární struktury proteinu.
11) Bioinformatické nástroje pro predikci glykosylace.
12-13) Návštěvy laboratoří v areálu UKB.

Studijní zdroje a literatura

• není relevantní

Přístupy, postupy a metody používané ve výuce

Skupinové řešení úkolů

Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení

Vypracování domácích úkolů

Další komentáře

Studijní materiály

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2026/C2132