C7176 DNA diagnostika - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2018
Rozsah
0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučující
prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D. (přednášející), doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (zástupce)
RNDr. Ing. Ondřej Bonczek, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
C7176/01: Po 17. 9. až Pá 14. 12. Čt 14:00–17:50 C15/211
C7176/02: Po 17. 9. až Pá 14. 12. Čt 10:00–13:50 C15/211
Předpoklady
C7175 Diagnostika DNA
Základním předpokladem je úspěšné absolvování předmětu DNA diagnostika.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 64 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/64, pouze zareg.: 0/64, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/64
Jiné omezení: Nutností zápisu do předmětu je úspěšné absolvování zkoušky z DNA diagnostiky.
Mateřské obory/plány
Anotace
Cílem cvičení z DNA diagnostiky je seznámit studenty s praktickou stránkou provádění DNA analýz.
Výstupy z učení
Studenti na konci kurzu budou umět samostatně provádět izolace DNA různými metodami, různé metody PCR, restrikční analýzu, elektroforézu na agarózovém gelu, sekvenace DNA, sběr biologického materiálu v terénu a jeho DNA analýzu. Mezi úlohy je také zařazeno použití rychlých imunochromatografických testů pro klinickou praxi.
Klíčová témata
1. Úvodní teoretická příprava, bezpečnost práce v laboratoři, seznámení s přístroji 2. Srovnání postupů izolace DNA – kolonky 3. Srovnání postupů izolace DNA – paramagnetické částice 4. Srovnání postupů izolace DNA – fenol-chloroformová izolace 5. Detekce polymorfizmu I/D genu pro angiotensinkonvertázu 6. Restrikční analýza a elektroforéza na agaróze 7. Sběr krevsajících členovců v terénu a izolace DNA 8. Real Time PCR detekce a kvantifikace borélií v krevsajících členovcích 9. Určení baktérie rodu Borrelia pomocí DNA sekvenace 10. Stanovení drogových metabolitů a dalších látek pomocí imunochromatografických testů
Studijní zdroje a literatura
    doporučená literatura
  • Manual of commercial methods in clinical microbiology. Edited by Allan L. Truant. Washington: ASM Press, 2002, xix, 481 s. ISBN 1-55581-189-2. info
  • The nucleic acid protocols handbook. Edited by Ralph Rapley. Totowa, N.J.: Humana Press, 1999, xxii, 1050. ISBN 0896038416. info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Výukové metody zahrnují jednak teoretickou přípravu formou přednášek, jednak laboratorní cvičení.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Klasifikovaný zápočet na základě odevzdání protokolů
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024, podzim 2025.