PřF:Bi5980 Statistické hodn biodiverzity - Informace o předmětu

Bi5980 Statistické hodnocení biodiverzity

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

RNDr. Danka Haruštiaková, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D. (přednášející)

Garance

RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Danka Haruštiaková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Čt 9:00–10:50 F01B1/709

Předpoklady

Vzhledem k unikátnosti většiny metod v této oblasti není nezbytné vzdělávání v biostatistických metodách, předpokladem je pouze základní znalost principů statistických testů a provádění odhadů a znalost matematiky v rozsahu střední školy. Naopak nutným předpokladem je znalost populační biologie a ekologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem kurzu je představit specifickou oblast analýzy dat - zpracování analýzy dat biologických společenstev pomocí metod hodnocení biodiverzity. Prezentované metody sahají od jednoduchých bioidiverzitních indexů, přes modelová rozdělení společenstev až po jejich vícerozměrnou analýzu.

Výstupy z učení

V závěru pokročilého kurzu analýzy biodiverzity je student schopen:
- připravit datový soubor pro analýzu biodiverzitních dat;
- vizualizovat různými způsoby strukturu biologických společenstev a jejich biodiverzitu;
- popsat biodiverzitu indexy diverzity včetně jejich variability;
- aplikovat species-abundance modely včetně jejich na niku orientované varianty;
- rozhodnout o použití korektní metody vícerozměrné analýzy biologických společenstev;
- interpretovat různé způsoby hodnocení biodiverzity jak z jejich výpočetního, tak ekologického hlediska.
- orientovat se v nabídce software pro analýzu biodiverzity.

Osnova

• 1. Biodiverzita jako pojem. Biodiverzita v datech. Vizualizace dat biodiverzity.
• 2. Indexy diverzity a vyrovnanosti, rarefaction.
• 3. Modely druhové početnosti. Matematické a na niku orientované modely.
• 4. Transformace druhových dat. Výpočet asociačních koeficientů. Úvod do vícerozměrných metod. Přímá a nepřímá gradientová analýza.
• 5. Hodnocení biodiverzity pomocí metod shlukové analýzy. Hierarchická a nehierarchická shluková analýza.
• 6. Hodnocení biodiverzity pomocí ordinačních metod. Analýza hlavních komponent (PCA), korespondenční analýza (CA), detrendovaná korespondenční analýza (DCA).
• 7. Hodnocení biodiverzity pomocí nemetrického mnohorozměrného škálování (NMDS).
• 8. Hodnocení vztahů biologických společenstev a vlastností prostředí pomocí kanonických ordinačních metod. Kanonická korespondenční analýza (CCA).
• 9. Analýza podobnosti (ANOSIM).

Literatura

• LEGENDRE, Pierre a Louis LEGENDRE. Numerical ecology. 2nd engl. ed. Amsterdam: Elsevier, 1998, xv, 853 s. ISBN 0-444-89249-4. info
• J. H. Zar (1984). Biostatistical analysis. Prentice Hall. New Jersey.
• KREBS, Charles J. Ecological Methodology. New York: Harper Collins Publishers, 1989, 654 s. ISBN 0060437847. info
• Magurran A.E. (1988) Ecological Diversity and Its Measurement. Cambridge University Press, UK.
• Jongman, Ter Braak and Van Tongeren (1995). Data analysis in community and landscape ekology, Cambridge University Press, Cambridge

Výukové metody

Teoretické přednášky doplněné komentovanými příklady, studenti jsou podporováni v kladení otázek týkajících se probírané látky.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen písemnou zkouškou zaměřenou zejména na principy analýzy biodiverzitních dat, předpoklady výpočtů a jejich aplikaci.

Informace učitele

http://www.iba.muni.cz/vyuka/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2021/Bi5980