TRANTÍREK, Lukáš, Milan URBÁŠEK, Richard ŠTEFL, Juli FEIGON a Vladimír SKLENÁŘ. A Method for Direct Determination of Helical Parameters in Nucleic Acids Using Residual Dipolar Couplings. Journal of the American Chemical Society, Washington, D.C.: American Chemical Society, 2000, roč. 122, č. 42, s. 10454-10455. ISSN 0002-7863.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název A Method for Direct Determination of Helical Parameters in Nucleic Acids Using Residual Dipolar Couplings
Autoři TRANTÍREK, Lukáš (203 Česká republika), Milan URBÁŠEK, Richard ŠTEFL (203 Česká republika), Juli FEIGON a Vladimír SKLENÁŘ (203 Česká republika, garant).
Vydání Journal of the American Chemical Society, Washington, D.C. American Chemical Society, 2000, 0002-7863.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 6.025
Kód RIV RIV/00216224:14310/00:00004025
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000090137000023
Klíčová slova anglicky residual dipolar coupling; helical parameter; principal order frame; DNA; RNA; NMR; structure
Štítky DNA, helical parameter, NMR, principal order frame, residual dipolar coupling, RNA, structure
Změnil Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:41.
Anotace
Helical parameters describing the base-stacking and base-pairing interactions in nucleic acids are not accessible directly from X-ray or NMR experimental data. Their values can be obtained only by the analysis of refined structures. This Communication presents a novel approach for direct determination of rotational helical parameters without a structure refinement. The METHADON (MEthod for deTermination of HelicAl parameters using Dipolar cOupliNgs) procedure is based on the Saupe order matrix analysis of at least five NMR residual dipolar couplings per base and takes advantage of the restricted mobility and rigid (and well-defined) geometry of purine and pyrimidine bases. The method is demonstrated on the DNA dodecamer d(CGCGAATTCGCG)
Návaznosti
MSM 143100005, záměrNázev: Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
VS96095, projekt VaVNázev: Laboratoř struktury a dynamiky biomolekul
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Posílení výzkumu na vysokých školách
VytisknoutZobrazeno: 22. 10. 2020 18:02