MUNZAROVÁ, Markéta a Vladimír SKLENÁŘ. Three-Bond Sugar-Base Couplings in Purine versus Pyrimidine Nucleosides: A DFT Study of Karplus Relationships for 3JC2/4-H1' and 3JC6/8-H1' in DNA. Journal of the American Chemical Society. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2002, roč. 124, č. 36, s. 10666-10667. ISSN 0002-7863.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Three-Bond Sugar-Base Couplings in Purine versus Pyrimidine Nucleosides: A DFT Study of Karplus Relationships for 3JC2/4-H1' and 3JC6/8-H1' in DNA
Autoři MUNZAROVÁ, Markéta (203 Česká republika) a Vladimír SKLENÁŘ (203 Česká republika, garant).
Vydání Journal of the American Chemical Society, Washington, D.C. American Chemical Society, 2002, 0002-7863.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10403 Physical chemistry
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 6.201
Kód RIV RIV/00216224:14310/02:00006453
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky NUCLEIC-ACIDS; CONSTANTS; OLIGONUCLEOTIDES
Štítky CONSTANTS, NUCLEIC-ACIDS, Oligonucleotides
Změnil Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
Anotace
3JC2/4-H1' and 3JC6/8-H1' scalar spin-spin coupling constants have been calculated for deoxyadenosine, deoxyguanosine, deoxycytidine, and deoxythymidine as functions of the glycosidic torsion angle c by means of density functional theory. Except for deoxythymidine, 3JC2/4-H1' depends little on the base type. On the contrary, 3JC6/8-H1' follow the usual trans to cis ratio (3JC-H(cis) < 3JC-H(trans)) for purine nucleosides but reveal the opposite relation (3JC-H(cis) > 3JC-H(trans)) for pyrimidine nucleosides. Our results compare well with the experiment for deoxyguanosine and predict a novel trend in the case of pyrimidine bases for which no NMR results are available in the syn region. A breakdown of the key Fermi contact part of 3JC6/8-H1' into MO contributions rationalizes this trend in terms of an unusual coupling mechanism in the syn orientation that is very effective for pyrimidine nucleosides and considerably weaker for purine nucleosides.
Návaznosti
LN00A016, projekt VaVNázev: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
VytisknoutZobrazeno: 26. 2. 2024 09:01