-
Factors determining chromosomal localization of transposable elements in plants J - Článek v odborném periodikuKEJNOVSKÝ, Eduard; Pavel JEDLIČKA; Matej LEXA a Zdeněk KUBÁT. Factors determining chromosomal localization of transposable elements in plants. PLANT BIOLOGY. Wiley and Sons Ltd., 2025, roč. 27, č. 6, s. 975-989. ISSN 1435-8603. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/plb.70057.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2500418/cs
-
Detection and classification of long terminal repeat sequences in plant LTR-retrotransposons and their analysis using explainable machine learning J - Článek v odborném periodikuHORVÁTH, Jakub; Pavel JEDLIČKA; Marie KRÁTKÁ; Zdeněk KUBÁT; Eduard KEJNOVSKÝ a Matej LEXA. Detection and classification of long terminal repeat sequences in plant LTR-retrotransposons and their analysis using explainable machine learning. BIODATA MINING. ENGLAND: SpringerNature, 2024, roč. 17, č. 1, s. 57-82. ISSN 1756-0381. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s13040-024-00410-z.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2456899/cs
-
Rumex hastatulus: one species, two karyotypes a - Konferenční abstraktKRUŽLICOVÁ, Jana; Markéta BODLÁKOVÁ; Václav BAČOVSKÝ; Stephen WRIGHT; Zdeněk KUBÁT a Roman HOBZA. Rumex hastatulus: one species, two karyotypes. In Student Conference of Plant Biology 2024. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2381757/cs
-
Evolutionary Dynamics of LTR Retrotransposons in Holocentric Plants from Juncaceae Family a - Konferenční abstraktKRÁTKÁ, Marie; Pavel JEDLIČKA; Zdeněk KUBÁT a Eduard KEJNOVSKÝ. Evolutionary Dynamics of LTR Retrotransposons in Holocentric Plants from Juncaceae Family. In ITAT 2023 Information Technologies – Applications and Theory. 2023. ISSN 1613-0073.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2319837/cs
-
HiC-TE: a computational pipeline for Hi-C data analysis to study the role of repeat family interactions in the genome 3D organization J - Článek v odborném periodikuLEXA, Matej; Monika ČECHOVÁ; Son Hoang NGUYEN; Pavel JEDLIČKA; Viktor TOKAN; Zdeněk KUBÁT; Roman HOBZA a Eduard KEJNOVSKÝ. HiC-TE: a computational pipeline for Hi-C data analysis to study the role of repeat family interactions in the genome 3D organization. BIOINFORMATICS. ENGLAND: OXFORD UNIV PRESS, 2022, roč. 38, č. 16, s. 4030-4032. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac442.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1876219/cs
-
LTR retrotransposons in holocentric plants from the Cyperaceae and Juncaceae families a - Konferenční abstraktKRÁTKÁ, Marie; Pavel JEDLIČKA; Zdeněk KUBÁT; Viktor TOKAN; Jakub ŠMERDA; Petr BUREŠ a Eduard KEJNOVSKÝ. LTR retrotransposons in holocentric plants from the Cyperaceae and Juncaceae families. In ELIXIR CZ Annual conference 2022: Plant Cytogenomics. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2226002/cs
-
Fundamentally different repetitive element composition of sex chromosomes in Rumex acetosa J - Článek v odborném periodikuJESIONEK, Wojciech Krzysztof; Markéta BODLÁKOVÁ; Zdeněk KUBÁT; Radim ČEGAN; Boris VYSKOT; Jan VRÁNA; Jan ŠAFÁŘ; Janka PUTEROVA a Roman HOBZA. Fundamentally different repetitive element composition of sex chromosomes in Rumex acetosa. Annals of Botany. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 127, č. 1, s. 33-47. ISSN 0305-7364. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/aob/mcaa160.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1710216/cs
-
Identification of a Novel Retrotransposon with Sex Chromosome-Specific Distribution in Silene latifolia J - Článek v odborném periodikuKRÁLOVÁ, Tereza; Radim ČEGAN; Zdeněk KUBÁT; Jan VRÁNA; Ivan VOGEL; Eduard KEJNOVSKÝ a Roman HOBZA. Identification of a Novel Retrotransposon with Sex Chromosome-Specific Distribution in Silene latifolia. Cytogenetic and Genome Research. KARGER, 2014, roč. 143, 1-3, s. 87-95. ISSN 1424-8581. Dostupné z: https://doi.org/10.1159/000362142.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1392874/cs
-
Possible mechanisms responsible for absence of a retrotransposon family on a plant Y chromosome J - Článek v odborném periodikuKUBÁT, Zdeněk; Jitka ŽLUVOVÁ; Ivan VOGEL; Viera KOVÁČOVÁ; Tomáš ČERMÁK; Radim CEGAN; Roman HOBZA; Boris VYSKOT a Eduard KEJNOVSKÝ. Possible mechanisms responsible for absence of a retrotransposon family on a plant Y chromosome. New Phytologist. HOBOKEN: WILEY-BLACKWELL, 2014, roč. 202, č. 2, s. 662-678. ISSN 0028-646X. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/nph.12669.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1229105/cs
-
Expansion of Microsatellites on Evolutionary Young Y Chromosome J - Článek v odborném periodikuKEJNOVSKÝ, Eduard; Monika MICHALOVOVÁ; Pavlína ŠTEFLOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Susana MANZANO; Roman HOBZA; Zdeněk KUBÁT; Jan KOVAŘÍK; Manuel JAMILENA a Boris VYSKOT. Expansion of Microsatellites on Evolutionary Young Y Chromosome. PLoS One. San Francisco, CA, USA: Public Library of Science, 2013, roč. 8, č. 1, s. "nestránkováno", 10 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0045519.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1083995/cs
-
Genomic diversity in two related plant species with and without sex chromosomes – Silene latifolia and S. vulgaris. J - Článek v odborném periodikuCEGAN, R; Boris VYSKOT; Eduard KEJNOVSKÝ; Zdeněk KUBÁT; Hana BLAVET; Jan SAFAR; Jaroslav DOLEŽEL; N BLAVET a Roman HOBZA. Genomic diversity in two related plant species with and without sex chromosomes – Silene latifolia and S. vulgaris. PLoS Biology. USA: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2012, roč. 7, č. 2, s. 1-9. ISSN 1544-9173. Dostupné z: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0031898.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/983308/cs
-
The role of repetitive DNA in structure and evolution of sex chromosomes in plants J - Článek v odborném periodikuKEJNOVSKÝ, Eduard; Roman HOBZA; Zdeněk KUBÁT; Tomáš ČERMÁK a Boris VYSKOT. The role of repetitive DNA in structure and evolution of sex chromosomes in plants. Heredity. 2009, roč. 102, s. 533-541.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/806517/cs
-
Microsatellite accumulation on the Y chromosome in Silene latifolia J - Článek v odborném periodikuKUBÁT, Zdeněk; Roman HOBZA; Boris VYSKOT a Eduard KEJNOVSKÝ. Microsatellite accumulation on the Y chromosome in Silene latifolia. Genome. NRC Research Press, 2008, roč. 51, s. 1-7. ISSN 1480-3321.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/755351/cs
-
Survey of repetitive sequences in Silene latifolia with respect to their distribution on sex chromosomes J - Článek v odborném periodikuČERMÁK, Tomáš; Zdeněk KUBÁT; Roman HOBZA; Andrea KOBLIZKOVA; Alex WIDMER; Jiri MACAS; Boris VYSKOT a Eduard KEJNOVSKÝ. Survey of repetitive sequences in Silene latifolia with respect to their distribution on sex chromosomes. Chromosome Research. 2008, roč. 16/2008, s. 961-976.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/822941/cs
-
High intrachromosomal similarity of retrotransposon long terminal repeats: Evidence for homogenization by gene conversion on plant sex chromosomes? J - Článek v odborném periodikuKEJNOVSKÝ, Eduard; Roman HOBZA; Zdeněk KUBÁT; Alex WIDMER; Gabriel MARAIS a Boris VYSKOT. High intrachromosomal similarity of retrotransposon long terminal repeats: Evidence for homogenization by gene conversion on plant sex chromosomes? Gene. Elsevier, 2007, roč. 390, s. 92-97. ISSN 0378-1119.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/755313/cs
-
Quantitative Structure-Activity Relationships for Toxicity and Genotoxicity of Halogenated Aliphatic Compounds: Wing Spot Test of Drosophila melanogaster. J - Článek v odborném periodikuCHROUST, Karel; Martina PAVLOVÁ; Zbyněk PROKOP; Jan MENDEL; Kateřina BOŽKOVÁ; Zdeněk KUBÁT; Věra ZAJÍČKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Quantitative Structure-Activity Relationships for Toxicity and Genotoxicity of Halogenated Aliphatic Compounds: Wing Spot Test of Drosophila melanogaster. CHEMOSPHERE. 2007, roč. 67, č. 1, s. 152-159. ISSN 0045-6535.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700042/cs
-
Accumulation of chloroplast DNA sequences on the Y chromosome of Silene latifolia. J - Článek v odborném periodikuKEJNOVSKÝ, Eduard; Zdeněk KUBÁT; Roman HOBZA; Martina LENGEROVÁ; S SATO; S TABATA; K FUKUI; S MATSUNAGA a Boris VYSKOT. Accumulation of chloroplast DNA sequences on the Y chromosome of Silene latifolia. Genetica. Springer, 2006, roč. 128, s. 167-175. ISSN 0016-6707.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/755316/cs
-
Retand: A novel family of gypsy-like retrotransposon harboring an amplified tandem repeat. J - Článek v odborném periodikuKEJNOVSKÝ, Eduard; Zdeněk KUBÁT; Jiri MACAS; Roman HOBZA; Jaroslav MRACEK a Boris VYSKOT. Retand: A novel family of gypsy-like retrotransposon harboring an amplified tandem repeat. Molecular Genetics and Genomics. Springer, 2006, roč. 276, s. 254-263. ISSN 1617-4615.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/755311/cs