-
Advanced NGS analysis of cell-free tumor DNA supports clonal relation to primary high-grade B-cell lymphoma lesion and CNS relapse despite MRI negativity J - Článek v odborném periodikuNAVRKALOVÁ, Veronika; Andrea MAREČKOVÁ; Jakub Paweł PORC; Samuel HRICKO; Viera HRABČÁKOVÁ; Jarmila KISSOVA; Soňa KUNDOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Andrea JANÍKOVÁ. Advanced NGS analysis of cell-free tumor DNA supports clonal relation to primary high-grade B-cell lymphoma lesion and CNS relapse despite MRI negativity. Diagnostic Pathology. LONDON: BMC, 2025, roč. 20, č. 1, s. 1-6. ISSN 1746-1596. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s13000-025-01609-2.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2499804/cs
-
Reference genomic database of the Czech population a - Konferenční abstraktSVOZILOVÁ, Hana; Karla PLEVOVÁ; Simone Andrea BIAGINI; Jakub Paweł PORC; Jakub HYNŠT; Jan SVATOŇ; Boris TICHÝ; Vojtěch BYSTRÝ; Viktor STRANECKY; Katerina JIRSOVA; Hana HARTMANNOVA; Michaela BENDOVA; Josef SROVNAL; Jiri DRABEK; Zuzana ROZANKOVA; Marta KALOUSOVA; Tomas ZIMA; Jana VACULÍKOVÁ; Terézia KURUCOVÁ; Jarmila SIMOVA; Lukáš HEJTMÁNEK; Michael DOUBEK; Vera FRANKOVA; Lucie BENESOVA; Magdalena UVIROVA; Stanislav KMOCH; Milan MACEK; Marian HAJDUCH a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Reference genomic database of the Czech population. In European Human Genetics Conference, Milan. 2025.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2554540/cs
-
Reliable detection of CNS lymphoma-derived circulating tumor DNA in cerebrospinal fluid using multi-biomarker NGS profiling: insights from a real-world study J - Článek v odborném periodikuNAVRKALOVÁ, Veronika; Andrea MAREČKOVÁ; Samuel HRICKO; Viera HRABČÁKOVÁ; Lenka RADOVÁ; Václav KUBEŠ; Jakub Paweł PORC; Tomáš REIGL; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Andrea JANÍKOVÁ. Reliable detection of CNS lymphoma-derived circulating tumor DNA in cerebrospinal fluid using multi-biomarker NGS profiling: insights from a real-world study. BIOMARKER RESEARCH. LONDON: BMC, 2025, roč. 13, č. 1, s. 1-12. ISSN 2050-7771. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s40364-025-00777-z.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2499805/cs
-
Systematic Assessment of the Applicability of Comprehensive Genomic Testing Towards Better Cancer Clinical Diagnostics in the Czech Republic a - Konferenční abstraktPLEVOVÁ, Karla; Sabina PEŇÁZOVÁ; Patricie SKALÁKOVÁ; Jakub Paweł PORC; Hana SVOZILOVÁ; Karolína ČERNOVSKÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Michael DOUBEK; Jana KOTAŠKOVÁ; Magdalena UVIROVA; Zuzana ZEMANOVA a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Systematic Assessment of the Applicability of Comprehensive Genomic Testing Towards Better Cancer Clinical Diagnostics in the Czech Republic. In Clinical Cancer Genomics Conference, Amsterodam. 2025.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2553879/cs
-
Detekce klinicky významné varianty genu MYD88 ve volné DNA získané z tekutých biopsií pacientů s lymfomy postihujícími centrální nervovou soustavu: likvor nebo plazma? a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Andrea MAREČKOVÁ; Samuel HRICKO; Viera HRABČÁKOVÁ; Jakub Paweł PORC; Klára ČINÁTLOVÁ; Natálie KAZDOVÁ; Hana HALÁMOVÁ; Martina FILIPOVÁ; Andrea JANÍKOVÁ a Jana KOTAŠKOVÁ. Detekce klinicky významné varianty genu MYD88 ve volné DNA získané z tekutých biopsií pacientů s lymfomy postihujícími centrální nervovou soustavu: likvor nebo plazma? In 26. celostátní konference DNA diagnostiky. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455731/cs
-
Exploring somatic structural variants in leukemia patients through chromatin interaction assessment a - Konferenční abstraktPORC, Jakub Paweł; Karolína ČERNOVSKÁ; Kristýna TAUŠOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Sabina ADAMOVÁ; Natálie KAZDOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Michael DOUBEK a Karla PLEVOVÁ. Exploring somatic structural variants in leukemia patients through chromatin interaction assessment. In EHGC 2024. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2463474/cs
-
Chromatin Complexity in Cancer: Unraveling the Impact of Complex Structural Variations in Chronic Lymphocytic Leukemia a - Konferenční abstraktČERNOVSKÁ, Karolína; Jakub Paweł PORC; Kristýna TAUŠOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Sabina ADAMOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Chromatin Complexity in Cancer: Unraveling the Impact of Complex Structural Variations in Chronic Lymphocytic Leukemia. In EMBO Workshop - Chromatin Biology in Cancer 2024. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2463469/cs
-
Integrative NGS testing reveals clonal dynamics of adverse genomic defects contributing to a natural progression in treatment-naïve CLL patients J - Článek v odborném periodikuNAVRKALOVÁ, Veronika; Karla PLEVOVÁ; Lenka RADOVÁ; Jakub Paweł PORC; Karol PÁL; Jitka MALČÍKOVÁ; Šárka PAVLOVÁ; Michael DOUBEK; Anna PANOVSKÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Integrative NGS testing reveals clonal dynamics of adverse genomic defects contributing to a natural progression in treatment-naïve CLL patients. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2024, roč. 204, č. 1, s. 240-249. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/bjh.19191.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2372237/cs
-
Klonální kompetice a alterace molekulárních drah u chronické lymfocytární leukémie a - Konferenční abstraktTAUŠOVÁ, Kristýna; Jakub Paweł PORC; Petr TAUŠ; Karol PÁL; Šárka PAVLOVÁ; Jitka MALČÍKOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Marcela ŽENATOVÁ; Boris TICHÝ; Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ; Anna PANOVSKÁ; Michael DOUBEK; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Klonální kompetice a alterace molekulárních drah u chronické lymfocytární leukémie. In 26. celostátní konference DNA diagnostiky. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455725/cs
-
KLONÁLNÍ KOMPETICE A ALTERACE MOLEKULÁRNÍCH DRAH U CHRONICKÉ LYMFOCYTÁRNÍ LEUKEMIE a - Konferenční abstraktTAUŠOVÁ, Kristýna; Jakub Paweł PORC; Petr TAUŠ; Karol PÁL; Šárka PAVLOVÁ; Jitka MALČÍKOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Marcela ŽENATOVÁ; Boris TICHÝ; Anna PANOVSKÁ; Michael DOUBEK; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. KLONÁLNÍ KOMPETICE A ALTERACE MOLEKULÁRNÍCH DRAH U CHRONICKÉ LYMFOCYTÁRNÍ LEUKEMIE. In III. ČESKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD in Transfuze a Hematologie Dnes. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2457629/cs
-
Optické mapování genomu a jeho přínos v diagnostice mnohočetného myelomu a - Konferenční abstraktKOTAŠKOVÁ, Jana; Andrea MAREČKOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; M. BOHÚNOVÁ; Johana MAYEROVÁ; Dorota NIŽŇANSKÁ; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; L. BRAVENCOVÁ; Marie ZÁDRAPOVÁ; Barbora SÁBLÍKOVÁ; Martin ŠTORK; Luděk POUR; Sabina ŠEVČÍKOVÁ a Marie JAROŠOVÁ. Optické mapování genomu a jeho přínos v diagnostice mnohočetného myelomu. In 57. Výroční cytogenomická konference. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2458927/cs
-
Potenciál pokročilých genomických metod pro analýzu komplexního karyotypu: příklad využití u chronické lymfocytární leukémie a - Konferenční abstraktČERNOVSKÁ, Karolína; Sabina ADAMOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Jan SVATOŇ; Jakub Paweł PORC; Natálie KAZDOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Kristýna TAUŠOVÁ; Michaela BOHÚNOVÁ; Tobias RAUSCH; Karol PÁL; Jakub HYNŠT; Vladimír BENEŠ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Potenciál pokročilých genomických metod pro analýzu komplexního karyotypu: příklad využití u chronické lymfocytární leukémie. In 26. celostátní konference DNA diagnostiky. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455743/cs
-
STUDIUM ORGANIZACE CHROMATINU U CHRONICKÉ LYMFOCYTÁRNÍ LEUKEMIE a - Konferenční abstraktČERNOVSKÁ, Karolína; Jakub Paweł PORC; Kristýna TAUŠOVÁ; Sabina ADAMOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ a Karla PLEVOVÁ. STUDIUM ORGANIZACE CHROMATINU U CHRONICKÉ LYMFOCYTÁRNÍ LEUKEMIE. In III. ČESKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD in Transfuze a Hematologie Dnes. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2457246/cs
-
The Genomic Landscape of Lymphomas Invading the Central Nervous System Inferred from Cell-Free DNA by Integrative NGS Analysis and the Diagnostic Benefit Compared to Flow Cytometry a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Andrea MARECKOVA; Viera HRABČÁKOVÁ; Samuel HRICKO; Jakub Paweł PORC; Martina FILIPOVÁ; Andrea JANÍKOVÁ a Jana KOTAŠKOVÁ. The Genomic Landscape of Lymphomas Invading the Central Nervous System Inferred from Cell-Free DNA by Integrative NGS Analysis and the Diagnostic Benefit Compared to Flow Cytometry. In Annual Meeting of the Association-for-Molecular-Pathology (AMP). 2024. ISSN 1525-1578.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2431608/cs
-
TP53-related clonal competition and disrupted molecular processes in CLL a - Konferenční abstraktTAUŠOVÁ, Kristýna; Jakub Paweł PORC; Petr TAUŠ; Karol PÁL; Jitka MALČÍKOVÁ; Šárka PAVLOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Marcela ŽENATOVÁ; Boris TICHÝ; Anna PANOVSKÁ; Michael DOUBEK; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. TP53-related clonal competition and disrupted molecular processes in CLL. In New frontiers in CLL research, Barcelona. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455751/cs
-
Unraveling CLL Pathogenic Cellular Mechanisms Through Integrated Micro-C, Long-Read, and RNA-Seq data analysis a - Konferenční abstraktPORC, Jakub Paweł; Karolína ČERNOVSKÁ; Kristýna TAUŠOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Sabina ADAMOVÁ; Jan SVATOŇ; Natálie KAZDOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Michael DOUBEK; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Unraveling CLL Pathogenic Cellular Mechanisms Through Integrated Micro-C, Long-Read, and RNA-Seq data analysis. In 13th ESLHO Symposium: Multi-omics approaches for diagnosis and monitoring of hematological malignancies, Lisbon. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2463473/cs
-
Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing J - Článek v odborném periodikuKURUCOVÁ, Terézia; Kamila RÉBLOVÁ; Pavlína JANOVSKÁ; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; Šárka PAVLOVÁ; Jitka MALČÍKOVÁ; Karla PLEVOVÁ; Boris TICHÝ; Michael DOUBEK; Vítězslav BRYJA; Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing. Molecular oncology. Hoboken: Wiley, 2024, roč. 18, č. 10, s. 2541-2553. ISSN 1574-7891. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/1878-0261.13663.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2407762/cs
-
Vysokokapacitní cytogenomické metody pro analýzu komplexního karyotypu u chronické lymfocytární leukémie a - Konferenční abstraktADAMOVÁ, Sabina; Kamila STRÁNSKÁ; Jan SVATOŇ; Karolína ČERNOVSKÁ; Jakub Paweł PORC; Eva ONDROUŠKOVÁ; Natálie KAZDOVÁ; Kristýna TAUŠOVÁ; Michaela BOHÚNOVÁ; T. RAUSCH; Karol PÁL; Jakub HYNŠT; Vladimír BENEŠ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Vysokokapacitní cytogenomické metody pro analýzu komplexního karyotypu u chronické lymfocytární leukémie. In 57. výroční cytogenomická konference. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2458937/cs
-
VYUŽITÍ POKROČILÝCH GENOMICKÝCH METOD PRO ANALÝZU KOMPLEXNÍHO KARYOTYPU U CHRONICKÉ LYMFOCYTÁRNÍ LEUKEMIE a - Konferenční abstraktADAMOVÁ, Sabina; Kamila STRÁNSKÁ; Jan SVATOŇ; Karolína ČERNOVSKÁ; Jakub Paweł PORC; Eva ONDROUŠKOVÁ; Natálie KAZDOVÁ; Kristýna TAUŠOVÁ; Michaela BOHÚNOVÁ; T. RAUSCH; Karol PÁL; Jakub HYNŠT; Vladimír BENEŠ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ a Karla PLEVOVÁ. VYUŽITÍ POKROČILÝCH GENOMICKÝCH METOD PRO ANALÝZU KOMPLEXNÍHO KARYOTYPU U CHRONICKÉ LYMFOCYTÁRNÍ LEUKEMIE. In III. ČESKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD in Transfuze a Hematologie 2024. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2457198/cs
-
VYUŽITÍ VYSOKOKAPACITNÍCH SEKVENAČNÍCH METOD PRO CHARAKTERIZACI GENOMICKÉ KOMPOZICE VÍCEKLONÁLNÍCH CHRONICKÝCH LYMFOCYTÁRNÍCH LEUKEMIÍ a - Konferenční abstraktSTRÁNSKÁ, Kamila; Jana ŠTRIGNEROVÁ; Kristýna TAUŠOVÁ; Jana BRUKNEROVÁ; Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ; Jakub Paweł PORC; Tomáš REIGL; Yvona BRYCHTOVÁ; Anna PANOVSKÁ; Michael DOUBEK; Veronika NAVRKALOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. VYUŽITÍ VYSOKOKAPACITNÍCH SEKVENAČNÍCH METOD PRO CHARAKTERIZACI GENOMICKÉ KOMPOZICE VÍCEKLONÁLNÍCH CHRONICKÝCH LYMFOCYTÁRNÍCH LEUKEMIÍ. In III. ČESKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD in Transfuze a Hematologie Dnes. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2457578/cs
-
A web-based bioinformatic tool LYNX for targeted LYmphoid NeXt- generation sequencing data analysis and visualization for hematooncology. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub HYNŠT; Karol PÁL; Kamila STRÁNSKÁ; Jana KOTAŠKOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. A web-based bioinformatic tool LYNX for targeted LYmphoid NeXt- generation sequencing data analysis and visualization for hematooncology. In ESHG Conference 2023, Glasgow, Skotsko. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2357959/cs
-
Application of long-read sequencing in chronic lymphocytic leukemia cases with complex karyotype. a - Konferenční abstraktADAMOVÁ, Sabina; Eva ONDROUŠKOVÁ; Jan SVATOŇ; Marie JAROŠOVÁ; Michaela BOHÚNOVÁ; Karol PÁL; Karolína ČERNOVSKÁ; Kristýna ZÁVACKÁ; Jakub Paweł PORC; Jana KOTAŠKOVÁ; Karla PLEVOVÁ a Kamila STRÁNSKÁ. Application of long-read sequencing in chronic lymphocytic leukemia cases with complex karyotype. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2355923/cs
-
CLLue: Searching for connections among clinical, biological, and molecular features in the dataset of leukemia patients. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub Paweł PORC; Karol PÁL; Kamila STRÁNSKÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. CLLue: Searching for connections among clinical, biological, and molecular features in the dataset of leukemia patients. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2359880/cs
-
Clonal competition and disrupted molecular processes in chronic lymphocytic leukemia. a - Konferenční abstraktZÁVACKÁ, Kristýna; Petr TAUŠ; Karol PÁL; Jakub Paweł PORC; Šárka PAVLOVÁ; Jitka MALČÍKOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Marcela ŽENATOVÁ; Boris TICHÝ; Nicolas BLAVET; Anna PANOVSKÁ; Michael DOUBEK; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Clonal competition and disrupted molecular processes in chronic lymphocytic leukemia. In XXVIIth Biochemistry congress. 2023. ISBN 978-80-8240-048-2.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2317919/cs
-
Comprehensive NGS testing allows integrated assessment of individual patient prognosis in multiple myeloma. a - Konferenční abstraktKOTAŠKOVÁ, Jana; Andrea MAREČKOVÁ; Daniela POKRIVČÁKOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Viera HRABČÁKOVÁ; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub Paweł PORC; Karla PLEVOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Martin ŠTORK a Luděk POUR. Comprehensive NGS testing allows integrated assessment of individual patient prognosis in multiple myeloma. In 23. Pražské hematologické dny, Praha. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2251887/cs
-
Dynamics of genomic aberrations in relation to disease activity in untreated patients with chronic lymphocytic leukemia. a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Jana KOTAŠKOVÁ; Karla PLEVOVÁ; Tomáš REIGL; Jakub Paweł PORC; Lenka RADOVÁ; Anna PANOVSKÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Dynamics of genomic aberrations in relation to disease activity in untreated patients with chronic lymphocytic leukemia. In 23. Pražské hematologické dny, Praha. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2251886/cs
-
Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub Paweł PORC; Karol PÁL; Kamila STRÁNSKÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue. In CEITEC PhD Conference. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2359946/cs
-
Genomic aberrations detected in circulating tumor DNA from cerebrospinal fluid and plasma of patients with primary and secondary CNS lymphomas with negative flowcytometry. a - Konferenční abstraktMAREČKOVÁ, Andrea; Veronika NAVRKALOVÁ; Michaela BOHÚNOVÁ; Viera HRABČÁKOVÁ; Samuel HRICKO; Tomáš REIGL; Jakub Paweł PORC; Andrea JANÍKOVÁ a Jana KOTAŠKOVÁ. Genomic aberrations detected in circulating tumor DNA from cerebrospinal fluid and plasma of patients with primary and secondary CNS lymphomas with negative flowcytometry. In ICML 2023, Lugano, červen 2023 in Hematological Oncology. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2356471/cs
-
Chromatin conformation analysis reveals genome structural and functional complexity in chronic lymphocytic leukemia. a - Konferenční abstraktČERNOVSKÁ, Karolína; Jakub Paweł PORC; Kristýna ZÁVACKÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Chromatin conformation analysis reveals genome structural and functional complexity in chronic lymphocytic leukemia. In XXVIIth Biochemistry congress. 2023. ISBN 978-80-8240-048-2.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2317917/cs
-
Integrativní diagnostika u pacienta s agresivním lymfomem postihujícím centrální nervový systém: využití komplexního NGS panelu a analýzy cfDNA a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Andrea MAREČKOVÁ; Jakub Paweł PORC; Michaela BOHÚNOVÁ; Lýdie BRAVENCOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Andrea JANÍKOVÁ. Integrativní diagnostika u pacienta s agresivním lymfomem postihujícím centrální nervový systém: využití komplexního NGS panelu a analýzy cfDNA. In 25. celostátní konference DNA diagnostiky. 2023. ISSN 2571-1997.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2298198/cs
-
Resolving chromatin organization in chronic lymphocytic leukemia. a - Konferenční abstraktČERNOVSKÁ, Karolína; Jakub Paweł PORC; Kristýna ZÁVACKÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Sabina ADAMOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Resolving chromatin organization in chronic lymphocytic leukemia. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2355919/cs
-
RNA sekvenovanie jednotlivých buniek umožňuje charakterizáciu a sledovanie zriedkavých CLL buniek s potenciálom navodiť refraktérne ochorenie. a - Konferenční abstraktKURUCOVÁ, Terézia; Kamila RÉBLOVÁ; Martina VALIŠOVÁ; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; Kristýna ZÁVACKÁ; Karla PLEVOVÁ; Boris TICHÝ; Michael DOUBEK; Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. RNA sekvenovanie jednotlivých buniek umožňuje charakterizáciu a sledovanie zriedkavých CLL buniek s potenciálom navodiť refraktérne ochorenie. In XXXV. Olomoucké hematologické dny in Transfuze a Hematologie Dnes. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2293242/cs
-
Single-cell RNA-sequencing enables tracking and characterization of rare CLL cells with the potential to cause refractoriness. a - Konferenční abstraktKURUCOVÁ, Terézia; Kamila RÉBLOVÁ; Martina VALIŠOVÁ; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; Šárka PAVLOVÁ; Jitka MALČÍKOVÁ; Karla PLEVOVÁ; Boris TICHÝ; Michael DOUBEK; Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Single-cell RNA-sequencing enables tracking and characterization of rare CLL cells with the potential to cause refractoriness. In EHA 2023 in HemaSphere (2023). 2023. ISSN 2572-9241.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2293214/cs
-
Solving complex karyotypes in leukemia samples using long-read sequencing. a - Konferenční abstraktSTRÁNSKÁ, Kamila; Sabina ADAMOVÁ; Michaela BOHÚNOVÁ; Jan SVATOŇ; Karol PÁL; Eva ONDROUŠKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Kristýna ZÁVACKÁ; Karolína ČERNOVSKÁ; Jakub Paweł PORC; Filip PARDY; Boris TICHÝ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Solving complex karyotypes in leukemia samples using long-read sequencing. In European Human Genetics Conference (ESHG), Glasgow, United Kingdom. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2360071/cs
-
Web-based bioinformatic tool LYNX: LYmphoid NeXt-generation sequencing data analysis and visualization in hematological malignancies. a - Konferenční abstraktPORC, Jakub Paweł; Tomáš REIGL; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub HYNŠT; Karol PÁL; Kamila STRÁNSKÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Web-based bioinformatic tool LYNX: LYmphoid NeXt-generation sequencing data analysis and visualization in hematological malignancies. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2355920/cs
-
CLLue: an interactive bioinformatic tool for data exploration, segregation, and important variables selection. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Veronika NAVRKALOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Jakub Paweł PORC; Karol PÁL; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. CLLue: an interactive bioinformatic tool for data exploration, segregation, and important variables selection. In 11th ESLHO Symposium, Polsko, Katowice. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2238282/cs
-
CLLue: an interactive bioinformatic tool for data exploration, segregation, and important variables selection. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; Karol PÁL; Kamila STRÁNSKÁ; Nikos DARZENTAS; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. CLLue: an interactive bioinformatic tool for data exploration, segregation, and important variables selection. In CEITEC PhD Conference. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2233310/cs
-
Exploring different aspects of clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia. a - Konferenční abstraktZÁVACKÁ, Kristýna; Petr TAUŠ; Karol PÁL; Jakub Paweł PORC; Šárka PAVLOVÁ; Jitka MALČÍKOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Marcela ŽENATOVÁ; Martina VALIŠOVÁ; Kamila RÉBLOVÁ; Terézia KURUCOVÁ; Karolína ČERNOVSKÁ; Anna PANOVSKÁ; Michael DOUBEK; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring different aspects of clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia. In EMBO Workshop, Itálie, Rimini. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2238284/cs
-
Chromatin organization by the SMC5/6 complex. a - Konferenční abstraktSTEFANOVIE, B; T CLARENCE; Lenka JURČIŠINOVÁ; Jakub Paweł PORC; Karla PLEVOVÁ a Jan PALEČEK. Chromatin organization by the SMC5/6 complex. In SYMPOSIUM & ANNUAL MC MEETING Nuclear Architecture & Function in Toulouse. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2241260/cs
-
Identification of genetic aberrations in multiple myeloma patients with low tumour burden using comprehensive NGS testing. a - Konferenční abstraktKOTAŠKOVÁ, Jana; Andrea MAREČKOVÁ; Daniela POKRIVČÁKOVÁ; Eva ONDROUŠKOVÁ; Anna FIDRICHOVÁ; Lenka BRYJOVÁ; Viera HRABČÁKOVÁ; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; Karla PLEVOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Martin ŠTORK a Luděk POUR. Identification of genetic aberrations in multiple myeloma patients with low tumour burden using comprehensive NGS testing. In EHA-SWG Scientific Meeting Integrated Cell Tracking in Oncohematology: Diagnosis, Targeted Therapy and Residual Disease, Francie, Bordeaux. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2238281/cs
-
Integrated NGS testing and cfDNA analysis as an approach for aggregate tumor characterization and monitoring in a patient with aggressive lymphoma invading the central neural system. a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Andrea MAREČKOVÁ; Jakub Paweł PORC; Marie JAROŠOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Andrea JANÍKOVÁ. Integrated NGS testing and cfDNA analysis as an approach for aggregate tumor characterization and monitoring in a patient with aggressive lymphoma invading the central neural system. In EHA-SWG Scientific Meeting Integrated Cell Tracking in Oncohematology: Diagnosis, Targeted Therapy and Residual Disease, Francie, Bordeaux. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2238279/cs
-
Long-read whole genomes sequencing used to detect complex chromosomal rearrangements a - Konferenční abstraktPÁL, Karol; Pavla MRHAČOVÁ; Kamila STRÁNSKÁ; Sabina ADAMOVÁ; Michaela BOHÚNOVÁ; Jakub Paweł PORC; Filip PARDY; T. RAUSCH; Jana KOTAŠKOVÁ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Vladimír BENEŠ; Boris TICHÝ a Karla PLEVOVÁ. Long-read whole genomes sequencing used to detect complex chromosomal rearrangements. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2211932/cs
-
LYNX: A web-based bioinformatic tool for targeted next-generation sequencing data analysis and visualization in lymphoid malignancies. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Jakub Paweł PORC; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub HYNŠT; Karol PÁL; Kamila STRÁNSKÁ; T. HRON; Z. HALBHUBER; Nikos DARZENTAS; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. LYNX: A web-based bioinformatic tool for targeted next-generation sequencing data analysis and visualization in lymphoid malignancies. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2211925/cs
-
Přínos a úskalí sekvenačních metod v diagnostice hematologických malignit. a - Konferenční abstraktPLEVOVÁ, Karla; Kristýna ZÁVACKÁ; Karol PÁL; Petr TAUŠ; Kamila STRÁNSKÁ; Tomáš REIGL; Jakub Paweł PORC; Jakub HYNŠT; Šárka PAVLOVÁ; Veronika NAVRKALOVÁ; Marcela ŽENATOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Přínos a úskalí sekvenačních metod v diagnostice hematologických malignit. In XXV. Biologické dny, Brno. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2233872/cs
-
Bioinformatický nástroj pro zpracování NGS dat a uživatelské rozhraní - LYNX (software) R - SoftwareREIGL, Tomáš; Jakub Paweł PORC; Karol PÁL; Jakub HYNŠT; Tomáš HRON; Nikos DARZENTAS; Veronika NAVRKALOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatický nástroj pro zpracování NGS dat a uživatelské rozhraní - LYNX. 2021.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1849358/cs
-
LYNX: an interactive bioinformatic tool for capture-based next-generation sequencing data analysis in lymphoid malignancies. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub HYNŠT; Jakub Paweł PORC; Karol PÁL; Tomáš HRON; Nikos DARZENTAS; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Z. HALBHUBER a Karla PLEVOVÁ. LYNX: an interactive bioinformatic tool for capture-based next-generation sequencing data analysis in lymphoid malignancies. In XX. Interdisciplinary Meeting of Young Biologists, Biochemists and Chemists. 2021.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1812420/cs
-
LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatic tool for integrative analysis of prognostic and predictive markers in B-cell malignancies. a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Tomáš REIGL; Karla PLEVOVÁ; Jakub HYNŠT; Karol PÁL; Jakub Paweł PORC; Andrea MAREČKOVÁ; Hana JELÍNKOVÁ; Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatic tool for integrative analysis of prognostic and predictive markers in B-cell malignancies. In XIX International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL). 2021.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1830688/cs
-
LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatický nástroj pro integrativní analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoproliferací. a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Karla PLEVOVÁ; Tomáš REIGL; Jakub HYNŠT; Karol PÁL; Jakub Paweł PORC; Andrea MAREČKOVÁ; Hana JELÍNKOVÁ; Andrea JANÍKOVÁ; Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatický nástroj pro integrativní analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoproliferací. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1812430/cs
-
Next-Generation Sequencing-Based Clonality Assessment of Ig Gene Rearrangements: A Multicenter Validation Study by EuroClonality NGS J - Článek v odborném periodikuVAN DEN BRAND, Michiel; Jos RIJNTJES; Markus MOBS; Julia STEINHILBER; Michele, Y. VAN DER KLIFT; Kim C. HEEZEN; Leonie I. KROEZE; Tomáš REIGL; Jakub Paweł PORC; Nikos DARZENTAS; Jeroen A. C. W. LUIJKS; Blanca SCHEIJEN; Frederic DAVI; Hesham ELDALY; Hongxiang LIU; Ioannis ANAGNOSTOPOULOS; Michael HUMMEL; Falko FEND; Anton W LANGERAK a Patricia J. T. A. GROENEN. Next-Generation Sequencing-Based Clonality Assessment of Ig Gene Rearrangements: A Multicenter Validation Study by EuroClonality NGS. JOURNAL OF MOLECULAR DIAGNOSTICS. UNITED STATES: ELSEVIER SCIENCE INC, 2021, roč. 23, č. 9, s. 1105-1115. ISSN 1525-1578. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2021.06.005.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2532177/cs
-
Capture-based NGS panel for detection of immunoglobulin and T-cell receptor gene rearrangements in DNA samples from patients with acute lymphoblastic leukemia a - Konferenční abstraktJELÍNKOVÁ, Hana; Veronika NAVRKALOVÁ; Karla PLEVOVÁ; Jakub Paweł PORC; Jakub HYNŠT; Karol PÁL; Tomáš REIGL; Nikos DARZENTAS; Michael DOUBEK; Marcela ŽENATOVÁ; Andrea MAREČKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Capture-based NGS panel for detection of immunoglobulin and T-cell receptor gene rearrangements in DNA samples from patients with acute lymphoblastic leukemia. In 25th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSphere. 2020.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1689636/cs
-
High throughput sequencing data analysis of IG/TR rearranged genes in leukemie clinical research. a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Jakub Paweł PORC; Kamila STRÁNSKÁ; Karol PÁL; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub HYNŠT; Vojtěch BYSTRÝ; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. High throughput sequencing data analysis of IG/TR rearranged genes in leukemie clinical research. In CEITEC PhD Conference, Brno, únor 2020. 2020.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1730957/cs
-
LYNX – modulární bioinformatický nástroj s uživatelským rozhraním pro analýzu NGS da u pacientů s hematologickými malignitami a - Konferenční abstraktREIGL, Tomáš; Veronika NAVRKALOVÁ; Jakub HYNŠT; Jakub Paweł PORC; Karol PÁL; T. HRON; Z. HALBHUBER; Šárka POSPÍŠILOVÁ; Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. LYNX – modulární bioinformatický nástroj s uživatelským rozhraním pro analýzu NGS da u pacientů s hematologickými malignitami. In XLIV. Brněnské onkologické dny, Brno, říjen 2020 in Klinická Onkologie. 2020.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1731861/cs
-
LYNX (Lymphoid NGS): a versatile NGS panel for comprehensive analysis of molecular markers with clinical relevance in lymphoproliferative disorders a - Konferenční abstraktNAVRKALOVÁ, Veronika; Jakub HYNŠT; Karla PLEVOVÁ; Karol PÁL; Tomáš REIGL; Jakub Paweł PORC; Nikos DARZENTAS; Andrea MAREČKOVÁ; Hana JELÍNKOVÁ; Marcela ŽENATOVÁ; Šárka PAVLOVÁ; Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid NGS): a versatile NGS panel for comprehensive analysis of molecular markers with clinical relevance in lymphoproliferative disorders. In 25th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSphere. 2020.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1689655/cs