Masarykova univerzita

Výpis publikací

česky | in English

Filtrování publikací

    2024

    1. Tale of tails; structural comparison of the RNA polymerase δ-subunits
      ČERNÝ, Martin, Viktor BARTOŠÍK, Markéta PETRŮJOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ a Lukáš ŽÍDEK. Tale of tails; structural comparison of the RNA polymerase δ-subunits. In XX Discussions in Structural Molecular Biology and 7th User Meeting of CIISB. 2024. ISSN 1211-5894.
      Odkaz na Abstrakt
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Martin Černý, učo 451182. Změněno: 29. 4. 2024 14:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2398057/cs

    2023

    1. Detailed insight into dynamics of C-terminal domain of δ subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis using high-resolution relaxometry
      KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Nicola SALVI, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE a Fabien FERRAGE. Detailed insight into dynamics of C-terminal domain of δ subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis using high-resolution relaxometry. In IDP Community F2F/hybrid meeting. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 23. 3. 2024 16:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2386899/cs
    2. Detailed insight into dynamics of intrinsically disordered proteins using high-resolution relaxometry
      ZAPLETAL, Vojtěch, Nicola SALVI, Andrea FLAMM, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Dennis KURZBACH, Mateos BORJA, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Jozef HRITZ, Robert KONRAT, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Detailed insight into dynamics of intrinsically disordered proteins using high-resolution relaxometry. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 23. 3. 2024 16:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2386900/cs
    3. Domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis beyond its major state conformation
      TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis beyond its major state conformation. In Inaugural Biochemistry Symposium Puzzles of (Bio)molecular Structure and Dynamics: NMR spectroscopy and complementary approaches. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00130951 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; RNA polymerase; Bacillus subtilis; NMR; conformational exchange
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 13. 6. 2023 13:42.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2291213/cs
    4. Characterisation of invisible conformation of domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis
      TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterisation of invisible conformation of domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In 19th European Magnetic Resonance Congress, EUROMAR 2023. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00131478 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, garant, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; RNA polymerase; Bacillus subtilis; NMR; conformational exchange
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 22. 8. 2023 20:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2303698/cs
    5. Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of σ A factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis
      TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžbeta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of σ A factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. Proteins: Structure, Function and Bioinformatics. Wiley, 2023, roč. 91, č. 9, s. 1276-1287. ISSN 0887-3585. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/prot.26531.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00131160 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; Bacillus subtilis; NMR; RNA polymerase; conformational exchange.
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 4. 2024 20:29.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2296078/cs
    6. Study of the Dynamics of Flexible Subunits of RNA Polymerase from Bacillus subtilis
      TUŽINČIN, Dávid, Nicola SALVI, Vojtěch ZAPLETAL, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Study of the Dynamics of Flexible Subunits of RNA Polymerase from Bacillus subtilis. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 25. 3. 2024 08:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2386901/cs

    2022

    1. Convergent views on disordered protein dynamics from NMR and computational approaches
      SALVI, Nicola, Vojtěch ZAPLETAL, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Convergent views on disordered protein dynamics from NMR and computational approaches. BIOPHYSICAL JOURNAL. UNITED STATES: CELL PRESS, 2022, roč. 121, č. 20, s. 3785-3794. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2022.09.016.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126947 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Narasimhan, Subhash (356 Indie, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 25. 3. 2024 10:41.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2225678/cs
    2. Interactions of adaptor protein Grb2 with microtubule associated protein 2c
      PLUCAROVÁ, Jitka, Séverine JANSEN, Alice LANÍKOVÁ a Lukáš ŽÍDEK. Interactions of adaptor protein Grb2 with microtubule associated protein 2c. In XVIII Discussions in Structural Molecular Biology. 2022.
      URL
      Název česky: Interakce adaptorového proteinu Grb2 s mikrotubuly asociavaným proteinem 2c
      Název anglicky: Interactions of adaptor protein Grb2 with microtubule associated protein 2c

      Změnila: Mgr. Jitka Plucarová, učo 436456. Změněno: 19. 10. 2022 17:29.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2225912/cs
    3. NMR Provides Unique Insight into the Functional Dynamics and Interactions of Intrinsically Disordered Proteins
      CAMACHO-ZARCO, Aldo R., Vincent SCHNAPKA, Serafima GUSEVA, Anton ABYZOV, Wiktor ADAMSKI, Sigrid MILLES, Malene Ringkjøbing JENSEN, Lukáš ŽÍDEK, Nicola SALVI a Martin BLACKLEDGE. NMR Provides Unique Insight into the Functional Dynamics and Interactions of Intrinsically Disordered Proteins. CHEMICAL REVIEWS. UNITED STATES: AMER CHEMICAL SOC, 2022, roč. 122, č. 10, s. 9331-9356. ISSN 0009-2665. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.chemrev.1c01023.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00129086 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Dynamics; Physical chemistry; Proteins; Reaction kinetics; Thermodynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 8. 2022 12:36.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1860349/cs
    4. Seeing the invisible – Study of transiently formed protein conformation found in domain 1.1 of bacterial transcription factor
      TUŽINČIN, Dávid, Pavel KADEŘÁVEK, Petr PADRTA a Lukáš ŽÍDEK. Seeing the invisible – Study of transiently formed protein conformation found in domain 1.1 of bacterial transcription factor. In XVIII Discussions in Structural Molecular Biology and 5th User Meeting of CIISB (Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology). 2022.
      URL
      Název anglicky: Seeing the invisible – Study of transiently formed protein conformation found in domain 1.1 of bacterial transcription factor
      RIV/00216224:14310/22:00126954 Prezentace na konferencích. angličtina.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NMR; sigmaA; Bacillus subtilis; region 1.1; protein dynamics
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 13. 6. 2023 13:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2225861/cs
    5. Specific phosphorylation of microtubule-associated protein 2c by extracellular signal–regulated kinase reduces interactions at its Pro-rich regions
      PLUCAROVÁ, Jitka, Séverine JANSEN, Subhash NARASIMHAN, Alice LANÍKOVÁ, Marc LEWITZKY, M. Stephan FELLER a Lukáš ŽÍDEK. Specific phosphorylation of microtubule-associated protein 2c by extracellular signal–regulated kinase reduces interactions at its Pro-rich regions. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. UNITED STATES: ELSEVIER, 2022, roč. 298, č. 10, s. 102384-102399. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102384.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126868 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Plucarová, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Narasimhan, Subhash (356 Indie, domácí) -- Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; PKA; Src homology 3 domain; cyclin-dependent kinase; extracellular signal–regulated kinase; growth factor receptor-bound protein 2 (GRB2); microtubule-associated protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 30. 1. 2023 10:12.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2224299/cs

    2021

    1. Investigation of the structure and dynamics of gallium binding to high-affinity peptides elucidated by multi-scale simulation, quantum chemistry, NMR and ITC dagger
      TAYLOR, C., N. SCHONBERGER, Alice LANÍKOVÁ, M. PATZSCHKE, B. DROBOT, Lukáš ŽÍDEK a F. LEDERER. Investigation of the structure and dynamics of gallium binding to high-affinity peptides elucidated by multi-scale simulation, quantum chemistry, NMR and ITC dagger. Physical Chemistry Chemical Physics. CAMBRIDGE: Royal Society of Chemistry, 2021, roč. 23, č. 14, s. 8618-8632. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d1cp00356a.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00121617 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: high-affinity peptides; multi-scale simulation; quantum chemistry; NMR; ITC
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Alice Laníková, učo 472411. Změněno: 3. 1. 2023 15:04.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1769960/cs

    2020

    1. Boosting the resolution of low-field 15N relaxation experiments on intrinsically disordered proteins with triple-resonance NMR
      JASEŇÁKOVÁ, Zuzana, Vojtěch ZAPLETAL, Petr PADRTA, Milan ZACHRDLA, N. BOLIK-COULON, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, F. FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Boosting the resolution of low-field 15N relaxation experiments on intrinsically disordered proteins with triple-resonance NMR. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2020, roč. 74, 2-3, s. 139-145. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-019-00298-6.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114136 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Dynamics; Intrinsically disordered proteins; High-resolution relaxometry; Non-uniform sampling
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2021 12:12.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1655339/cs
    2. Choice of Force Field for Proteins Containing Structured and Intrinsically Disordered Regions
      ZAPLETAL, Vojtěch, Arnošt MLÁDEK, Kateřina BENDOVÁ, Petr LOUŠA, Erik NOMILNER, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Vojtěch KUBÁŇ, Markéta MAKOVICKÁ, Alice LANÍKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Jozef HRITZ. Choice of Force Field for Proteins Containing Structured and Intrinsically Disordered Regions. Biophysical Journal. Bethesda, USA: Biophysical Society, 2020, roč. 118, č. 7, s. 1621-1633. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2020.02.019.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115635 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Nomilner, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Makovická, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; TYROSINE-HYDROXYLASE; NMR RELAXATION; RNA-POLYMERASE; DELTA-SUBUNIT; PREDICTION; PHOSPHORYLATION; RECOGNITION; ALIGNMENT; BIOLOGY
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 30. 4. 2021 18:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1655320/cs
    3. Structural Basis of Ca2+-Dependent Self-Processing Activity of Repeat-in-Toxin Proteins
      KUBÁŇ, Vojtěch, P. MACEK, Jozef HRITZ, K. NECHVATALOVA, K. NEDBALCOVA, M. FALDYNA, Peter ŠEBO, Lukáš ŽÍDEK a L. BUMBA. Structural Basis of Ca2+-Dependent Self-Processing Activity of Repeat-in-Toxin Proteins. MBIO. Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 2020, roč. 11, č. 2, s. 1-18. ISSN 2150-7511. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/mBio.00226-20.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115752 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Šebo, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RTX toxins; cell adhesion; clip-and-link; host-pathogen interactions; nuclear magnetic resonance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2021 13:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1660918/cs

    2019

    1. Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important Electrostatic Interactions in the Intrinsically Disordered Region of Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase
      KUBÁŇ, Vojtěch, Pavel SRB, Hana ŠTÉGNEROVÁ, Petr PADRTA, Milan ZACHRDLA, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, H. SANDEROVA, D. VITOVSKA, L. KRASNY, T. KOVAL, J. DOHNALEK, J. ZIEMSKA-LEGIECKA, M. GRYNBERG, P. JARNOT, A. GRUCA, M.R. JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important Electrostatic Interactions in the Intrinsically Disordered Region of Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 141, č. 42, s. 16817-16828. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.9b07837.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108078 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Štégnerová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Sanderova, H. (203 Česká republika) -- Vitovska, D. (203 Česká republika) -- Krasny, L. (203 Česká republika) -- Koval, T. (203 Česká republika) -- Dohnalek, J. (203 Česká republika) -- Ziemska-Legiecka, J. (616 Polsko) -- Grynberg, M. (616 Polsko) -- Jarnot, P. (616 Polsko) -- Gruca, A. (616 Polsko) -- Jensen, M.R. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RESIDUAL DIPOLAR COUPLINGS; BACILLUS-SUBTILIS; GENE-EXPRESSION; RAPID CHANGES; PROTEINS; NMR; TRANSCRIPTION; DETERMINANTS; PREDICTION; SCATTERING
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2020 19:39.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1607006/cs
    2. Structure and Functions of Microtubule Associated Proteins Tau and MAP2c: Similarities and Differences
      MELKOVÁ, Kateřina, Vojtěch ZAPLETAL, Subhash NARASIMHAN, Séverine JANSEN, Jozef HRITZ, R. SKRABANA, M. ZWECKSTETTER, M. RINGKJOBING JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Structure and Functions of Microtubule Associated Proteins Tau and MAP2c: Similarities and Differences. Biomolecules. Basel, Switzerland: MDPI AG, 2019, roč. 9, č. 3, s. 105-136. ISSN 2218-273X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biom9030105.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00109608 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Narasimhan, Subhash (356 Indie, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Skrabana, R. (703 Slovensko) -- Zweckstetter, M. (276 Německo) -- Ringkjobing Jensen, M. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: microtubule associated protein; tau; intrinsically disordered protein; phosphorylation; nuclear magnetic resonance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 3. 2020 09:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1529019/cs

    2018

    1. Conformation and dynamics of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c
      ZAPLETAL, Vojtěch, Kateřina MELKOVÁ, Séverine JANSEN, Erik NOMILNER, M.R. JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Conformation and dynamics of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c. 2018. ISSN 2211-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/2211-5463.12453.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00103544 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Nomilner, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Jensen, M.R. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: protein 2c; MAP2c
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1431016/cs
    2. Functionally specific binding regions of microtubule-associated protein 2c exhibit distinct conformations and dynamics
      MELKOVÁ, Kateřina, Vojtěch ZAPLETAL, Séverine JANSEN, Erik NOMILNER, Milan ZACHRDLA, Jozef HRITZ, Jiří NOVÁČEK, M. ZWECKSTETTER, M.R. JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Functionally specific binding regions of microtubule-associated protein 2c exhibit distinct conformations and dynamics. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2018, roč. 293, č. 34, s. 13297-13309. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA118.001769.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00101098 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Nomilner, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zweckstetter, M. (276 Německo) -- Jensen, M.R. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR relaxation; Tau protein (Tau); microtubule-associated protein (MAP); nuclear magnetic resonance (NMR); paramagnetic relaxation enhancement (PRE); protein conformation; small-angle X-ray scattering (SAXS)
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:21.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1427578/cs
    3. Nuclear Magnetic Resonance
      ZACHRDLA, Milan, Zuzana JASEŇÁKOVÁ a Lukáš ŽÍDEK. Nuclear Magnetic Resonance. Online. In Jan Hejátko, Toshio Hakoshima. Plant Structural Biology: Hormonal Regulations. 1. vyd. CHAM: SPRINGER INT PUBLISHING AG, 2018, s. 223-221, 25 s. n/a. ISBN 978-3-319-91352-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-91352-0_12.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00103860 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Švýcarsko.
      Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Molecular biology Plant development Signal transduction Arabidopsis X-ray crystallography NMR SAXS Molecular dynamics simulations
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2019 13:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1443137/cs
    4. Protein environment affects the water-tryptophan binding mode. MD, QM/MM, and NMR studies of engrailed homeodomain mutants
      ŠPAČKOVÁ, Naděžda, Zuzana TROŠANOVÁ, F. SEBESTA, Séverine JANSEN, J.V. BURDA, Pavel SRB, Milan ZACHRDLA, Lukáš ŽÍDEK a Jiří KOZELKA. Protein environment affects the water-tryptophan binding mode. MD, QM/MM, and NMR studies of engrailed homeodomain mutants. Physical Chemistry Chemical Physics. CAMBRIDGE: Royal Society of Chemistry, 2018, roč. 20, č. 18, s. 12664-12677. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c7cp08623g.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00101218 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Špačková, Naděžda (203 Česká republika, domácí) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Sebesta, F. (203 Česká republika) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Burda, J.V. (203 Česká republika) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kozelka, Jiří (250 Francie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEAR-MAGNETIC-RESONANCE; MOLECULAR-DYNAMICS; CRYSTAL-STRUCTURES; PROTON-EXCHANGE; DNA COMPLEX; CLEANEX-PM; SIMULATIONS; CONSTRAINTS; RESTRAINTS; PARAMETERS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 12:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1443202/cs
    5. Role of SH3b binding domain in a natural deletion mutant of Kayvirus endolysin LysF1 with a broad range of lytic activity
      BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Markéta PERNISOVÁ, Kateřina MELKOVÁ, Lenka TISAKOVA, Jiří DOŠKAŘ, Lukáš ŽÍDEK, Jan HEJÁTKO a Roman PANTŮČEK. Role of SH3b binding domain in a natural deletion mutant of Kayvirus endolysin LysF1 with a broad range of lytic activity. Virus Genes. DORDRECHT: Springer US, 2018, roč. 54, č. 1, s. 130-139. ISSN 0920-8569. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11262-017-1507-2.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00102396 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Pernisová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Tisakova, Lenka (703 Slovensko) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus bacteriophage; Endolysin; Endopeptidases; Enzybiotics; Src homology domains; Staphylococcal infections
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2019 13:05.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1411122/cs

    2017

    1. Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions
      ZAPLETAL, Vojtěch, Arnošt MLÁDEK, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.
      URL
      Název anglicky: Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions
      RIV/00216224:14740/17:00095560 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; hybrid proteins
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2018 15:10.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410473/cs
    2. Conformational dynamics are a key factor in signaling mediated by the receiver domain of a sensor histidine kinase from Arabidopsis thaliana
      OTRUSINOVÁ, Olga, Gabriel DEMO, Petr PADRTA, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Zuzana GELOVÁ, Agnieszka SZMITKOWSKA, Pavel KADEŘÁVEK, Séverine JANSEN, Milan ZACHRDLA, Tomáš KLUMPLER, Jaromír MAREK, Jozef HRITZ, Lubomír JANDA, Hideo IWAI, Michaela WIMMEROVÁ, Jan HEJÁTKO a Lukáš ŽÍDEK. Conformational dynamics are a key factor in signaling mediated by the receiver domain of a sensor histidine kinase from Arabidopsis thaliana. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 42, s. 17525-17540. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M117.790212.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095060 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Gelová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Szmitkowska, Agnieszka (616 Polsko, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Iwai, Hideo (246 Finsko) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: histidine kinase; nuclear magnetic resonance (NMR); protein dynamic; protein phosphorylation; X-ray crystallography; receiver domain; relaxation dispersion
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 4. 2018 11:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1392278/cs
    3. Conformational Entropy from Slowly Relaxing Local Structure Analysis of N-15-H Relaxation in Proteins: Application to Pheromone Binding to MUP-I in the 283-308 K Temperature Range
      ŽÍDEK, Lukáš a Eva MEIROVITCH. Conformational Entropy from Slowly Relaxing Local Structure Analysis of N-15-H Relaxation in Proteins: Application to Pheromone Binding to MUP-I in the 283-308 K Temperature Range. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2017, roč. 121, č. 37, s. 8684-8692. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b06049.
      URL
      RIV/00216224:14310/17:00098087 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Meirovitch, Eva (376 Izrael)
      Klíčová slova anglicky: MODEL-FREE APPROACH; MAGNETIC-RESONANCE RELAXATION; NMR RELAXATION; BACKBONE DYNAMICS; LIGAND-BINDING; ORDER PARAMETERS; DEPENDENCE; COMPLEX; DOMAIN; MOTIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 3. 2018 13:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1394037/cs
    4. NMR characterization of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c
      MELKOVÁ, Kateřina, Séverine JANSEN, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. NMR characterization of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.
      URL
      Název anglicky: NMR characterization of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c
      RIV/00216224:14740/17:00095559 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; MAP2c
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2018 14:58.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410470/cs
    5. Quantitative mapping of microtubule-associated protein 2c (MAP2c) phosphorylation and regulatory protein 14-3-3 zeta-binding sites reveals key differences between MAP2c and its homolog Tau
      JANSEN, Séverine, Kateřina MELKOVÁ, Zuzana TROŠANOVÁ, Kateřina HANÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Jiří NOVÁČEK, Erik ŽUPA, Zbyněk ZDRÁHAL, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. Quantitative mapping of microtubule-associated protein 2c (MAP2c) phosphorylation and regulatory protein 14-3-3 zeta-binding sites reveals key differences between MAP2c and its homolog Tau. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 16, s. 6715-6727. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M116.771097.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094770 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Župa, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: INTRINSICALLY UNSTRUCTURED PROTEINS; PAIRED HELICAL FILAMENTS; TUBULIN POLYMERIZATION; MULTIDIMENSIONAL NMR; NEURONAL DEVELOPMENT; DISORDERED PROTEINS; SYNAPTIC PLASTICITY; BETA-STRUCTURE; KINASE-A; BINDING
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 4. 2018 10:49.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1381982/cs
    6. Solution structure of domain 1.1 of the sigma(A) factor from Bacillus subtilis is preformed for binding to the RNA polymerase core
      ZACHRDLA, Milan, Petr PADRTA, Alzbeta RABATINOVA, Hana SANDEROVA, Ivan BARVIK, Libor KRASNY a Lukáš ŽÍDEK. Solution structure of domain 1.1 of the sigma(A) factor from Bacillus subtilis is preformed for binding to the RNA polymerase core. Journal of Biological Chemistry. Bethesda: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 28, s. 11610-11617. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M117.784074.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094887 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, Alzbeta (203 Česká republika) -- Sanderova, Hana (203 Česká republika) -- Barvik, Ivan (203 Česká republika) -- Krasny, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Bacillus; molecular modeling; nuclear magnetic resonance (NMR); protein structure; RNA polymerase; transcription initiation factor
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 28. 2. 2018 16:36.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1387541/cs
    7. Triple resonance NMR relaxation experiments for studies of intrinsically disordered proteins
      SRB, Pavel, Jiří NOVÁČEK, Pavel KADEŘÁVEK, A. RABATINOVA, L. KRÁSNÝ, J. ŽÍDKOVÁ, J. BOBÁĽOVÁ, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Triple resonance NMR relaxation experiments for studies of intrinsically disordered proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2017, roč. 69, č. 3, s. 133-146. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-017-0138-1.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095497 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, A. (203 Česká republika) -- Krásný, L. (203 Česká republika) -- Žídková, J. (203 Česká republika) -- Bobáľová, J. (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Non-uniform sampling; Intrinsically disordered proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2018 14:35.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1408290/cs

    2016

    1. ROLE OF IN VITRO PHOSPHORYLATION ASSAY IN UNDERSTADING MSP SIGNALING IN A. THALIANA
      SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Jan HEJÁTKO. ROLE OF IN VITRO PHOSPHORYLATION ASSAY IN UNDERSTADING MSP SIGNALING IN A. THALIANA. In CECE 2016 13 th International Interdisciplinary Meeting on Bioanalysis. 2016. ISBN 978-80-904959-4-4.
      URL
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 3. 2018 16:27.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1357410/cs
    2. Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies
      KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Pavel SRB, Petr PADRTA, Jana PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ, Mária ŠOLTÉSOVÁ, Jozef KOWALEWSKI, Göran WIDMALM, Josef CHMELÍK, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc. Elsevier Science, 2016, roč. 266, May, s. 23-40. ISSN 1090-7807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2016.02.016.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00090497 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Pavlíková Přecechtělová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šoltésová, Mária (703 Slovensko) -- Kowalewski, Jozef (752 Švédsko) -- Widmalm, Göran (752 Švédsko) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Spectral density function; Magnetic field; Nucleic acids; Carbohydrates
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 27. 4. 2017 13:36.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1350870/cs
    3. Structural Aspects of Multistep Phosphorelay-Mediated Signaling in Plants
      PEKÁROVÁ, Blanka, Agnieszka SZMITKOWSKA, Radka DOPITOVÁ, Oksana DEGTJARIK, Lukáš ŽÍDEK a Jan HEJÁTKO. Structural Aspects of Multistep Phosphorelay-Mediated Signaling in Plants. Molecular Plant. Cambridge (USA): Cell Press, 2016, roč. 9, č. 1, s. 71-85. ISSN 1674-2052. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2015.11.008.
      URL
      Název anglicky: Structural Aspects of Multistep Phosphorelay-Mediated Signaling in Plants
      RIV/00216224:14740/16:00088179 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Szmitkowska, Agnieszka (616 Polsko, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Degtjarik, Oksana (112 Bělorusko) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: multistep phosphorelay; structure; histidine kinase; phosphotransfer protein; response regulator
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 27. 4. 2017 16:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1354811/cs
    4. STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1
      SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ a Jan HEJÁTKO. STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1. In XVI Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků. 2016.
      URL
      Biochemie. čeština. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc., učo 417377. Změněno: 23. 9. 2016 18:04.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1354850/cs
    5. The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot
      PERCZEL, András, Atanas G. ATANASOV, Vladimír SKLENÁŘ, Jiří NOVÁČEK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Henryk KOZLOWSKI, Joanna WATLY, Aleksandra HECEL, Paulina KOLKOWSKA, Jaroslav KOČA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Lukáš PRAVDA, David SEHNAL, Vladimír HORSKÝ, Stanislav GEIDL, Ricardo D. ENRIZ, Pavel MATĚJKA, Adéla JENIŠTOVÁ, Marcela DENDISOVÁ, Alžběta KOKAISLOVÁ, Volkmar WEISSIG, Mark OLSEN, Aidan COFFEY, Jude AJUEBOR, Ruth KEARY, Marta SANZ-GAITERO, Mark J. VAN RAAIJ, Olivia MCAULIFFE, Birgit WALTENBERGER, Andrei MOCAN, Karel ŠMEJKAL, Elke H. HEISS, Marc DIEDERICH, Robert MUSIOL, Janez KOŠMRLJ, Jaroslaw POLANSKI a Josef JAMPÍLEK. The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot. MOLECULES. Basel: MDPI AG, 2016, roč. 21, č. 10, s. nestránkováno, 27 s. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules21101381.
      URL
      Název anglicky: The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot
      RIV/00216224:14310/16:00091715 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Švýcarsko.
      Perczel, András (348 Maďarsko) -- Atanasov, Atanas G. (40 Rakousko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kozlowski, Henryk (616 Polsko) -- Watly, Joanna (616 Polsko) -- Hecel, Aleksandra (616 Polsko) -- Kolkowska, Paulina (616 Polsko) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pravda, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sehnal, David (203 Česká republika, domácí) -- Horský, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Geidl, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Enriz, Ricardo D. (32 Argentina) -- Matějka, Pavel (203 Česká republika) -- Jeništová, Adéla (203 Česká republika) -- Dendisová, Marcela (203 Česká republika) -- Kokaislová, Alžběta (203 Česká republika) -- Weissig, Volkmar (840 Spojené státy) -- Olsen, Mark (840 Spojené státy) -- Coffey, Aidan (372 Irsko) -- Ajuebor, Jude (372 Irsko) -- Keary, Ruth (372 Irsko) -- Sanz-Gaitero, Marta (724 Španělsko) -- van Raaij, Mark J. (724 Španělsko) -- McAuliffe, Olivia (372 Irsko) -- Waltenberger, Birgit (40 Rakousko) -- Mocan, Andrei (642 Rumunsko) -- Šmejkal, Karel (203 Česká republika) -- Heiss, Elke H. (40 Rakousko) -- Diederich, Marc (410 Korejská republika) -- Musiol, Robert (616 Polsko) -- Košmrlj, Janez (705 Slovinsko) -- Polanski, Jaroslaw (616 Polsko) -- Jampílek, Josef (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: drug design; targeting; chemical biology; biological chemistry; proteins and nucleic acids; natural compounds; synthesis; biomaterials; nanoparticles; ADME; drug delivery systems
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 9. 4. 2017 11:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1360575/cs
    6. The influence of Mg2+ coordination on 13C and 15N chemical shifts in CKI1RD protein domain from experiment and molecular dynamics/density functional theory calculations
      VÍCHA, Jan, Martin BABINSKÝ, Gabriel DEMO, Olga OTRUSINOVÁ, Séverine JANSEN, Blanka PEKÁROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Markéta MUNZAROVÁ. The influence of Mg2+ coordination on 13C and 15N chemical shifts in CKI1RD protein domain from experiment and molecular dynamics/density functional theory calculations. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 2016, roč. 84, č. 5, s. 686-699. ISSN 0887-3585. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/prot.25019.
      Název anglicky: The influence of Mg2+ coordination on 13C and 15N chemical shifts in CKI1RD protein domain from experiment and molecular dynamics/density functional theory calculations
      RIV/00216224:14310/16:00087872 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; CKI1 histidine kinase; Mg2+ coordination; NMR chemical shift; 13C; 15N; molecular dynamics; density functional theory
      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 14. 4. 2017 14:39.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1341586/cs

    2015

    1. Conformational dynamics and antigenicity in the disordered malaria antigen merozoite surface protein 2
      MACRAILD, Christopher A., Milan ZACHRDLA, Dean ANDREW, Bankala KRISHNARJUNA, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Jack S. RICHARDS, James G. BEESON, Robin F. ANDERS a Raymond S. NORTON. Conformational dynamics and antigenicity in the disordered malaria antigen merozoite surface protein 2. PLOS ONE. San Francisco: Public Library Science, 2015, roč. 10, č. 3, s. "nestránkováno", 18 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0119899.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00082589 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      MacRaild, Christopher A. (36 Austrálie) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Andrew, Dean (36 Austrálie) -- Krishnarjuna, Bankala (36 Austrálie) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Richards, Jack S. (36 Austrálie) -- Beeson, James G. (36 Austrálie) -- Anders, Robin F. (36 Austrálie) -- Norton, Raymond S. (36 Austrálie)
      Klíčová slova anglicky: amino terminal sequence; animal experiment; animal model; antibody response; antibody specificity; antigenicity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 22. 3. 2016 15:24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231685/cs
    2. Cross-correlated relaxation measurements under adiabatic sweeps: determination of local order in proteins
      KADEŘÁVEK, Pavel, Sarina GRUTSCH, Nicola SALVI, Martin TOLLINGER, Lukáš ŽÍDEK, Geoffrey BODENHAUSEN a Fabien FERRAGE. Cross-correlated relaxation measurements under adiabatic sweeps: determination of local order in proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2015, roč. 63, č. 4, s. 353-365. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-015-9994-8.
      Full Text
      RIV/00216224:14740/15:00086418 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Grutsch, Sarina (40 Rakousko) -- Salvi, Nicola (756 Švýcarsko) -- Tollinger, Martin (40 Rakousko) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bodenhausen, Geoffrey (250 Francie) -- Ferrage, Fabien (250 Francie)
      Klíčová slova anglicky: NMR; Protein dynamics; Adiabatic sweep; Cross-correlated cross relaxation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 12. 2019 14:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1333976/cs
    3. Expression, purification and crystallization of the intracellular domains of the ethylene receptor ETR1 from Arabidopsis thaliana
      SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ a Jan HEJÁTKO. Expression, purification and crystallization of the intracellular domains of the ethylene receptor ETR1 from Arabidopsis thaliana. In XVII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2015. ISBN 978-80-210-8015-7.
      URL
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc., učo 417377. Změněno: 23. 9. 2016 17:49.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1354848/cs
    4. NMR assignment of intrinsically disordered self-processing module of the FrpC protein of Neisseria meningitidis
      KUBÁŇ, Vojtěch, Jiří NOVÁČEK, Ladislav BUMBA a Lukáš ŽÍDEK. NMR assignment of intrinsically disordered self-processing module of the FrpC protein of Neisseria meningitidis. Biomolecular NMR Assignments. Dordrecht (Netherlands): Springer Netherlands, 2015, roč. 9, č. 2, s. 435-440. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-015-9625-z.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00085528 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Nizozemské království.
      Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bumba, Ladislav (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: FrpC; Self-processing module; Neisseria meningitidis; Intrinsically disordered proteins; Sparse sampling; Resolution-enhanced spectroscopy; Resonance assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 16. 8. 2022 13:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1322749/cs

    2014

    1. Retro operation on the Trp-cage miniprotein sequence produces an unstructured molecule capable of folding similar to the original only upon 2,2,2-trifluoroethanol addition
      VYMETAL, Jiří, Sreenivas Reddy BATHULA, Jiří ČERNÝ, Radka CHALOUPKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Jiří VONDRÁŠEK. Retro operation on the Trp-cage miniprotein sequence produces an unstructured molecule capable of folding similar to the original only upon 2,2,2-trifluoroethanol addition. PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION. OXFORD: OXFORD UNIV PRESS, 2014, roč. 27, č. 12, s. 463-472. ISSN 1741-0126. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/protein/gzu046.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074482 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vymetal, Jiří (203 Česká republika) -- Bathula, Sreenivas Reddy (356 Indie, domácí) -- Černý, Jiří (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Vondrášek, Jiří (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: protein folding; protein-structure prediction; molecular dynamics; NMR methods; CD spectroscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 3. 4. 2015 07:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231793/cs
    2. RSL lectin - a complex approach to study carbohydrate-protein interaction
      HOUSER, Josef, Jiří NOVÁČEK, Jan KOMÁREK, David BUCHTA, Daniel POKORNÝ, Peter BYSTRICKÝ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. RSL lectin - a complex approach to study carbohydrate-protein interaction. In 12th Discussions in Structural Molecular Biology. 2014. ISSN 1211-5894.
      Název anglicky: RSL lectin - a complex approach to study carbohydrate-protein interaction
      RIV/00216224:14310/14:00073537 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Pokorný, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Bystrický, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: lectin; Ralstonia; AAL family
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781. Změněno: 15. 3. 2014 19:50.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1169615/cs
    3. Spectral density mapping protocols for analysis of molecular motions in disordered proteins
      KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Alžběta RABATINOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Spectral density mapping protocols for analysis of molecular motions in disordered proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2014, roč. 58, č. 3, s. 193-207. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-014-9816-4.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073529 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnecit resonance; Relaxation; Spectral density function; Intrinsically disordered proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1169199/cs
    4. Stabilization of the beta-hairpin in Mason-Pfizer monkey virus capsid protein- a critical step for infectivity
      OBR, Martin, Romana HADRAVOVÁ, Michal DOLEŽAL, Ivana KŘÍŽOVÁ, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Richard HRABAL, Tomáš RUML a Michaela RUMLOVÁ. Stabilization of the beta-hairpin in Mason-Pfizer monkey virus capsid protein- a critical step for infectivity. Retrovirology. London: Biomed Central LTD, 2014, roč. 11, October 2014, s. "nestránkováno", 14 s. ISSN 1742-4690. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12977-014-0094-8.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077815 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Obr, Martin (203 Česká republika) -- Hadravová, Romana (203 Česká republika) -- Doležal, Michal (203 Česká republika) -- Křížová, Ivana (203 Česká republika) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hrabal, Richard (203 Česká republika) -- Ruml, Tomáš (203 Česká republika) -- Rumlová, Michaela (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: N-TERMINAL DOMAIN; IN-VITRO; STRUCTURAL-ANALYSIS; ESCHERICHIA-COLI; GAG POLYPROTEIN; CORE FORMATION; RESOLUTION; MATURATION; ASSIGNMENT; MUTATIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 7. 1. 2015 20:25.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213591/cs
    5. Structural Biology in Use : NMR, X-ray and Molecular Dynamics Modeling in Study on Multistep Phosphorelay Signaling in Plants
      DEGTJARIK, Oksana, Radka DOPITOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Tomáš KLUMPLER, Jakub HORÁK, Petra BORKOVCOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, David ŘEHA, Sandra PUEHRINGER, Olga OTRUSINOVÁ, Séverine JANSEN, Michal KUTÝ, Manfred S. WEISS, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Structural Biology in Use : NMR, X-ray and Molecular Dynamics Modeling in Study on Multistep Phosphorelay Signaling in Plants. In 6. Metodické dny. 2/2014. 2014, s. 52-52. ISSN 1213-6670.
      URL
      Botanika. angličtina. Česká republika.
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 18. 3. 2015 12:58.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1230829/cs
    6. Toward optimal-resolution NMR of intrinsically disordered proteins
      NOVÁČEK, Jiří, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Toward optimal-resolution NMR of intrinsically disordered proteins. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc Elsevier Science, 2014, roč. 241, April, s. 41-52. ISSN 1090-7807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2013.12.008.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073570 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: IDPs; IDPRs; Multi-dimensional NMR; Non-uniform sampling; NUS; PRE; RDC; RNAP delta-subunit
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 17. 10. 2014 13:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173973/cs
    7. X-ray vs. NMR structure of N-terminal domain of delta-subunit of RNA polymerase
      DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Jan KOMÁREK, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Pavel SRB, Alzbeta RABATINOVA, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela WIMMEROVÁ. X-ray vs. NMR structure of N-terminal domain of delta-subunit of RNA polymerase. Journal of Structural Biology. San Diego: Academic Press, 2014, roč. 187, č. 2, s. 174-186. ISSN 1047-8477. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2014.06.001.
      URL
      Název anglicky: X-ray vs. NMR structure of N-terminal domain of delta-subunit of RNA polymerase
      RIV/00216224:14740/14:00073722 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, Alzbeta (703 Slovensko) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: N-terminal domain; Nuclear magnetic resonance; Protein crystallography; RNA polymerase; delta-Subunit
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 22. 10. 2014 15:09.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1188082/cs

    2013

    1. Efficient protocol for backbone and side-chain assignments of large, intrinsically disordered proteins: transient secondary structure analysis of 49.2 kDa microtubule associated protein 2c
      NOVÁČEK, Jiří, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Efficient protocol for backbone and side-chain assignments of large, intrinsically disordered proteins: transient secondary structure analysis of 49.2 kDa microtubule associated protein 2c. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2013, roč. 56, č. 4, s. 291-301. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-013-9761-7.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066377 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Intrinsically disordered proteins; Microtubule-associated protein; Transient secondary structure; C-13 detection
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 24. 10. 2013 09:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1123258/cs
    2. Multiple Recognition Motifs in Nucleoporin Nup159 Provide a Stable and Rigid Nup159-Dyn2 Assembly
      NYARKO, Afua, Yujuan SONG, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK a Elisar BARBAR. Multiple Recognition Motifs in Nucleoporin Nup159 Provide a Stable and Rigid Nup159-Dyn2 Assembly. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2013, roč. 288, č. 4, s. 2614-2622. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M112.432831.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066050 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Nyarko, Afua (840 Spojené státy) -- Song, Yujuan (840 Spojené státy) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Barbar, Elisar (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: Intrinsic disorder NMR ITC polybivalency enthalpy/entropy balance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 26. 9. 2013 11:05.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1091436/cs
    3. NMR Determines Transient Structure and Dynamics in the Disordered C-Terminal Domain of WASp Interacting Protein
      HABA, Noam Y, Renana GROSS, Jiří NOVÁČEK, Hadassa SHAKED, Lukáš ŽÍDEK, Mira BARDA-SAAD a Jordan H CHILL. NMR Determines Transient Structure and Dynamics in the Disordered C-Terminal Domain of WASp Interacting Protein. Biophysical Journal. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2013, roč. 105, č. 2, s. 481-493. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2013.05.046.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066376 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Haba, Noam Y (376 Izrael) -- Gross, Renana (376 Izrael) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Shaked, Hadassa (376 Izrael) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Barda-Saad, Mira (376 Izrael) -- Chill, Jordan H (376 Izrael)
      Klíčová slova anglicky: WISKOTT-ALDRICH-SYNDROME; NUCLEAR-MAGNETIC-RESONANCE; SEQUENCE-SPECIFIC ASSIGNMENT; PROLINE-RICH REGIONS; 8 M UREA; CHEMICAL-SHIFTS; ALPHA-SYNUCLEIN; N-WASP; ACTIN POLYMERIZATION; POLYPROLINE-II
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 24. 10. 2013 09:18.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1123257/cs
    4. Structural Study of the Partially Disordered Full-Length delta Subunit of RNA Polymerase from Bacillus subtilis
      PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Structural Study of the Partially Disordered Full-Length delta Subunit of RNA Polymerase from Bacillus subtilis. ChemBioChem. WEINHEIM: WILEY-VCH Verlag, 2013, roč. 14, č. 14, s. 1772-1779. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201300226.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066324 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
      Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy; RNA polymerase; partially disordered proteins; protein structures; delta subunit
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 4. 4. 2014 08:42.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1122510/cs
    5. The Delta Subunit of RNA Polymerase Is Required for Rapid Changes in Gene Expression and Competitive Fitness of the Cell
      RABATINOVÁ, Alžbeta, Hana ŠANDEROVÁ, Jitka JIRÁT MATĚJČKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Luděk SOJKA, Ivan BARVÍK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Vladimír SKLENÁŘ, Lukáš ŽÍDEK a Libor KRÁSNÝ. The Delta Subunit of RNA Polymerase Is Required for Rapid Changes in Gene Expression and Competitive Fitness of the Cell. Journal of Bacteriology. Washington: American Society for Microbiology, 2013, roč. 195, č. 11, s. 2603-2611. ISSN 0021-9193. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/JB.00188-13.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066221 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Rabatinová, Alžbeta (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Jirát Matějčková, Jitka (203 Česká republika) -- Korelusová, Jana (203 Česká republika) -- Sojka, Luděk (203 Česká republika) -- Barvík, Ivan (203 Česká republika) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Krásný, Libor (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase; delta subunit; regulation; nucleoside triphosphate; gene expression; cell survival
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 8. 4. 2014 14:11.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1113356/cs
    6. X ray vs. NMR structure of the N terminal domain of delta subunit of RNA polymerase
      DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Jan KOMÁREK, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Pavel SRB, Alzbeta RABATINOVA, Libor KRASNY, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela WIMMEROVÁ. X ray vs. NMR structure of the N terminal domain of delta subunit of RNA polymerase. In Fifth Joint BER II and BESSY II User Meeting 2013. 2013.
      Název anglicky: X ray vs. NMR structure of the N terminal domain of delta subunit of RNA polymerase
      RIV/00216224:14740/13:00070649 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Německo.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, Alzbeta (703 Slovensko) -- Krasny, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: structure NMR crystallographie delta subunit RNA polymerase
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 20. 12. 2013 17:06.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1137660/cs

    2012

    1. Accurate Reduced Spectral Density Mapping for Analysis of 13C Relaxation Rates
      KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Accurate Reduced Spectral Density Mapping for Analysis of 13C Relaxation Rates. In 53rd Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference. 2012.
      Změnil: Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653. Změněno: 17. 10. 2012 13:52.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1069054/cs
    2. NMR Studies of the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana
      OTRUSINOVÁ, Olga, Séverine JANSEN, Pavel KADEŘÁVEK, Blanka PEKÁROVÁ, Jaromír MAREK, Jan HEJÁTKO, Lubomír JANDA, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Studies of the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana. In XXVth ICMBRS. 2012.
      URL
      Název anglicky: NMR Studies of the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana
      Biochemie. angličtina. Francie.
      Změnila: Mgr. Olga Otrusinová, učo 175607. Změněno: 18. 2. 2013 16:54.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1087836/cs
    3. NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      BYSTRICKÝ, Peter, Marie POKORNÁ, Karel KUBÍČEK, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS. In 2nd EAST NMR Young Investigator's meeting. 2012.
      Název anglicky: NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      RIV/00216224:14740/12:00061756 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Slovensko.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Recenzováno: ano
      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 5. 11. 2012 16:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1072360/cs
    4. NMR study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria
      PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Jiří NOVÁČEK, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzystof KAZIMIERCZUK, Lukáš ŽÍDEK, Wiktor KOZMINSKI, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria. 2012. ISBN 978-80-86441-43-6.
      URL
      Název česky: NMR studie delta podjednotky RNA polymerázy specifické pro gram-pozitivní bakterie
      Název anglicky: NMR study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: delta subunit, RNA polymerase,NMR, assignment, structure
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 17. 7. 2012 13:35.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/987378/cs
    5. RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY
      BYSTRICKÝ, Peter, Marie POKORNÁ, Karel KUBÍČEK, Michaela WIMMEROVÁ a Lukáš ŽÍDEK. RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY. In 26th Intenational Carbohydrate Symposium 2012 abstracts. 2012.
      Název anglicky: RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY
      RIV/00216224:14740/12:00061753 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Španělsko.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano
      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 5. 11. 2012 15:54.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1072349/cs
    6. SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin
      BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Roman PANTŮČEK. SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin. In prof. RNDr. Jiří Doškař. The Student Scientific Conference on Biotechnology. Conference book. Brno: Masarykova univerzita, 2012, s. 92-93. ISBN 978-80-210-5811-8.
      RIV/00216224:14310/12:00064946 Stať ve sborníku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Růžičková, Vladislava (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus aureus; Myoviridae; E.coli
      Změnila: Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D., učo 134438. Změněno: 27. 3. 2013 12:19.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1085289/cs
    7. SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin: Cloning, expression and structure determination
      BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Marek MOŠA a Roman PANTŮČEK. SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin: Cloning, expression and structure determination. In Viruses of Microbes. From exploration to applications in the -omics era. EMBO Conference Series, Brussels, Belgium. 2012.
      URL
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Belgie.
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus; bacteriophage; Myoviridae; endolysin; SH3b domain; NMR
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 22. 11. 2012 11:34.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1074370/cs
    8. Significant changes between the Xray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase
      DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Significant changes between the Xray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase. In Struktura 2012, Cesko-slovenska krystalograficka spolecnost. 2012. ISSN 1211-5894.
      Název česky: Podstatni zmeny mezi krystalografickou a NMR strukturou delta podjednotky RNA polymerazy
      Název anglicky: Significant changes between the X-ray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase
      RIV/00216224:14740/12:00057460 Konferenční abstrakt. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: delta subunit comparism NMR Xray structure
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 29. 6. 2012 10:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/986112/cs
    9. 4D Non-uniformly sampled HCBCACON and (1) J(NC alpha)-selective HCBCANCO experiments for the sequential assignment and chemical shift analysis of intrinsically disordered proteins
      NOVÁČEK, Jiří, Noam Y HABA, Jordan H CHILL, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. 4D Non-uniformly sampled HCBCACON and (1) J(NC alpha)-selective HCBCANCO experiments for the sequential assignment and chemical shift analysis of intrinsically disordered proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2012, roč. 53, č. 2, s. 139-148. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-012-9631-8.
      URL
      Název anglicky: 4D Non-uniformly sampled HCBCACON and (1) J(NC alpha)-selective HCBCANCO experiments for the sequential assignment and chemical shift analysis of intrinsically disordered proteins
      RIV/00216224:14740/12:00057624 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Haba, Noam Y (376 Izrael) -- Chill, Jordan H (376 Izrael) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Intrinsically disordered proteins; Non-uniform sampling; C-13 detection; Chemical shifts; Residual secondary structure; Prolines assignment
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 7. 5. 2013 06:52.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1066896/cs

    2011

    1. Cloning and expression of endolysin and its SH3b-domain from polyvalent staphylococcal bacteriophage
      BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Cloning and expression of endolysin and its SH3b-domain from polyvalent staphylococcal bacteriophage. In XX. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2011. 2011.
      URL
      Název česky: Klonování a exprese endolyzinu a jeho SH3b-domény z polyvalentního stafylokokového bakteriofága
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 14. 7. 2011 18:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/945673/cs
    2. Cloning, expression and structure determination of SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin
      BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Marek MOŠA a Roman PANTŮČEK. Cloning, expression and structure determination of SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin. In Phages 2011 - Bacteriophage Applications, 19-21 September 2011, St Hilda's College, Oxford, UK. 2011.
      URL
      RIV/00216224:14310/11:00050057 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Růžičková, Vladislava (203 Česká republika, domácí) -- Moša, Marek (203 Česká republika) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bacteriophage therapy; Staphylococcus aureus; bacteriophage endolysin; SH3b domain
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 14. 10. 2011 12:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/953385/cs
    3. Complementation of 3D structure of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis with description of internal motions in terms of reduced spectral density mapping
      KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Complementation of 3D structure of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis with description of internal motions in terms of reduced spectral density mapping. MATERIALS STRUCTURE. 2011, roč. 18, č. 1, s. 3-5. ISSN 1211-5894.
      URL
      RIV/00216224:14740/11:00057189 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Diehl, Carl (752 Švédsko) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Akke, Mikael (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: NMR; delta subunit; RNA polymerase; spectral density function
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 16. 4. 2013 11:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/935903/cs
    4. Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase
      DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase. In Higher European Research Course for Users of Large Experimental Systems (HERCULES). 2011.
      Název česky: Krystalizace a určení struktury delta-podjednotky RNA polymerázy
      Název anglicky: Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase
      RIV/00216224:14740/11:00049774 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: delta-subunit RNA polymerase crystallization structure
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 8. 5. 2011 12:10.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/936743/cs
    5. Effect of Mg2+ Binding on the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana
      JANSEN, Séverine, Olga TŘÍSKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Tomáš KLUMPLER, Jakub HORÁK, Radka DOPITOVÁ, Jiří NOVÁČEK, Jaromír MAREK, Jan HEJÁTKO, Lubomír JANDA, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Effect of Mg2+ Binding on the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana. Frankfurt am Main, Germany: EUROMAR, 2011, s. 325-325. ISBN 978-3-86955-845-5.
      URL
      Název česky: Efekt vazby Mg2+ iontů na příjímačovou doménu senzoru CKI1 histidin kinázy z Arabidopsis thaliana

      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Změnila: Séverine Jansen, PhD., učo 128288. Změněno: 10. 2. 2012 08:11.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/970563/cs
    6. NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
      PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Gordon Research Conference. 2011.
      URL
      Název česky: NMR studie podjednotky RNA polymerazy unikatní v grampozitivních bakteriích
      Název anglicky: NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteri
      Biochemie. angličtina. Itálie.
      Klíčová slova anglicky: NMR, RNA polymerase, delta subunit, structure, dynamics, interactions
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 22. 8. 2011 15:19.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/942603/cs
    7. Structure and binding specificity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana.
      PEKÁROVÁ, Blanka, Tomáš KLUMPLER, Olga TŘÍSKOVÁ, Jakub HORÁK, Séverine JANSEN, Radka DOPITOVÁ, Petra BORKOVCOVÁ, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK, Lukáš ŽÍDEK, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Structure and binding specificity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana. The Plant Journal. England: BLACKWELL PUBLISHING, 2011, roč. 67, č. 5, s. 827-839. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04637.x.
      URL
      RIV/00216224:14740/11:00050106 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Třísková, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Horák, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Borkovcová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Nejedlá, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: multistep phosphorelay; receiver domain; CKI1; crystal structure; NMR spectroscopy; Arabidopsis thaliana
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D., učo 1989. Změněno: 1. 5. 2012 01:49.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/956151/cs
    8. Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria
      PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Šanderová HANA, Rabatinová ALŽBĚTA, Zawadzka-Kazimierczuk ANNA, Kazimierczuk KRZYSZTOF, Lukáš ŽÍDEK, Kozminski WIKTOR, Krásný LIBOR a Vladimír SKLENÁŘ. Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria. In 9th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady. 2011. ISSN 1211-5894.
      URL
      Název česky: Studie delta podjednotky RNA polymerazi jedinečné pro gram-poziotivní bakterie
      Název anglicky: Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria

      Klíčová slova anglicky: nmr, delta subunit, RNA polymerase, structure, dynamics, interactions
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 29. 3. 2011 11:24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/932326/cs
    9. The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase
      DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana SANDEROVA, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase. In XV. Setkani biochemiku a molekularnich biologu. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.
      Název česky: Roetgenova struktura verzus NMR struktura delta-podjednotky RNA-polymerazy
      RIV/00216224:14740/11:00050113 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Sanderova, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: X-ray NMR structure delta-subunit comparison
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Nikola Kostlánová, Ph.D., učo 12689. Změněno: 4. 4. 2012 12:09.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/956217/cs
    10. 5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion
      NOVÁČEK, Jiří, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ, Wiktor KOZMINSKI a Vladimír SKLENÁŘ. 5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2011, roč. 50, č. 1, s. 1-11. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-011-9496-2.
      RIV/00216224:14740/11:00049942 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zawadzka-Kazimierczuk, Anna (616 Polsko) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Kozminski, Wiktor (616 Polsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Intrinsically disordered proteins ; Non-uniform sampling ; 13C detection ; Longitudinal relaxation optimization ; Backbone assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 1. 4. 2012 06:35.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/948801/cs

    2010

    1. ANALYSIS OF BACKBONE MOTIONS OF DELTA SUBUNIT OF RNA POLYMERASE FROM BACILLUS SUBTILIS
      KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika MOTÁČKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. ANALYSIS OF BACKBONE MOTIONS OF DELTA SUBUNIT OF RNA POLYMERASE FROM BACILLUS SUBTILIS. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady, 2010. 2010.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 10. 3. 2011 13:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/890213/cs
    2. Carbon-detected Experiments for Assignment of Proline Rich Proteins
      FIALA, Radovan, Michaela HORNIČÁKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Norbert MÜLLER. Carbon-detected Experiments for Assignment of Proline Rich Proteins. In 25th NMR Valtice - Central European NMR Meeting. 2010. ISBN 978-80-86441-42-9.
      URL
      Název česky: Uhlíkem detekované experimenty pro přiřazení proteinů bohatých na prolin
      Název anglicky: Carbon-detected Experiments for Assignment of Proline Rich Proteins
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy, protein, structure, proline
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 4. 10. 2010 15:39.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/901013/cs
    3. Cooperativity between subunits is essential for high affinity binding of N-acetylhexosamines to dimeric soluble and dimeric cellular forms of human CD69
      KAVAN, Daniel, Monika KUBÍČKOVÁ, Jan BILÝ, Ondřej VANĚK, Kateřina HOFBAUEROVÁ, Mrázek HYNEK, Rozbeský DANIEL, Bojarová PAVLA, Vladimír KŘEN, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Karel BEZOUŠKA. Cooperativity between subunits is essential for high affinity binding of N-acetylhexosamines to dimeric soluble and dimeric cellular forms of human CD69. Biochemistry. Washington, USA: American Chemical Society, 2010, roč. 49, č. 19, s. 4060-4067. ISSN 0006-2960.
      RIV/00216224:14310/10:00044022 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kavan, Daniel (203 Česká republika) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Bilý, Jan (203 Česká republika) -- Vaněk, Ondřej (203 Česká republika) -- Hofbauerová, Kateřina (203 Česká republika) -- Hynek, Mrázek (203 Česká republika) -- Daniel, Rozbeský (203 Česká republika) -- Pavla, Bojarová (203 Česká republika) -- Křen, Vladimír (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Bezouška, Karel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NMR CD69 lectin-type proteins NK cell glycoproteins
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 2. 4. 2014 12:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/885673/cs
    4. Dynamic structure and binding specifity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1
      PEKÁROVÁ, Blanka, Tomáš KLUMPLER, Olga TŘÍSKOVÁ, Jakub HORÁK, Lukáš ŽÍDEK, Jaromír MAREK, Radka DOPITOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Dynamic structure and binding specifity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1. Tarragona, Spain: IPGSA conference 2010, 2010, s. 85-86.
      URL
      Název česky: Dynamika struktury a vazebná specifita přijímačové domény senzorové histidinkinázy CKI1
      Název anglicky: Dynamic structure and binding specifity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1
      Biochemie. angličtina. Španělsko.
      Klíčová slova anglicky: multistep phosphorelay, crystal structure, NMR analysis, CKI1
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 29. 4. 2011 15:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/911208/cs
    5. NMR as a tool for studies of (partially) disordered proteins and their interactions
      PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Libor KRÁSNÝ a Wiktor KOZMINSKI. NMR as a tool for studies of (partially) disordered proteins and their interactions. In Molecular Perspectives on Protein-Protein Interactions. 2010.
      URL
      Název česky: NMR jako nástroj pro studium (částečně) neuspořádaných proteinů a jejich interakcí
      Název anglicky: NMR as a tool for studies of (partially) disordered proteins and their interactions

      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 23. 11. 2010 13:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/908760/cs
    6. Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Jiří JONÁK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. USA: John Wiley and Sons, 2010, roč. 78, č. 7, s. 1807-1810. ISSN 0887-3585.
      Název česky: Struktura N-terminální domény delta podjednotky RNA polymerasy z Bacilla subtila a její klasifikace na základě strukturních homologů
      RIV/00216224:14310/10:00043931 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Motáčková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Švenková, Alžběta (203 Česká republika) -- Korelusová, Jana (203 Česká republika) -- Jonák, Jiří (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase; delta subunit; gram positive bacteria; nuclear magnetic resonance; structural homologues
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 2. 2. 2012 17:31.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/883410/cs
    7. Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Jiří NOVÁČEK, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzysztof KAZIMIERCZUK, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ, Wiktor KOZMINSKI a Vladimír SKLENÁŘ. Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments. Journal of Biomolecular NMR. Netherlands: Springer Netherlands, 2010, roč. 48, č. 3, s. 169-177. ISSN 0925-2738.
      URL
      Název česky: Strategie pro kompletní NMR přiřazení nestrukturovaných proteinů s vysokým počtem repeticí v sekvenci
      Název anglicky: Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments
      RIV/00216224:14310/10:00045112 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Motáčková, Veronika (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zawadzka-Kazimierczuk, Anna (616 Polsko) -- Kazimierczuk, Krzysztof (616 Polsko) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Kozminski, Wiktor (616 Polsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Unfolded proteins; Repetitive sequence; Multi-dimensional NMR; Non-uniform sampling; Assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 2. 2. 2012 17:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/903212/cs
    8. Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Jiří NOVÁČEK, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzysztof KAZIMIERCZUK, Wiktor KOŹMIŃSKI, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference. 2010.
      URL
      Název česky: Struktura a dynamika podjednotky RNA polymerazy specifické pro gram-pozitivní bakterie
      Název anglicky: Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
      Biochemie.
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase; delta subunit; gram-positive bacteria; structure; validation; structural homologues; dynamics
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 19. 10. 2010 10:54.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/894361/cs
    9. Structure and dynamics of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis
      KADEŘÁVEK, Pavel, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Carl DIEHL, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Structure and dynamics of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In International school of biological magnetic resonance, 10th Course, Biophysics and Structure to Counter Threats and Challenges, Erice 2010. 2010.
      URL
      Změnil: Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653. Změněno: 3. 7. 2010 19:38.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/890215/cs
    10. Structure determination of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Structure determination of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010. ISBN 978-80-210-5164-5.
      URL
      Název česky: Popis struktury podjednotky RNA polymerasy specificke pro gram-pozitivni bakterie
      Název anglicky: Structure determination of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria

      Klíčová slova anglicky: nmr, delta subunit, RNA polymerase, gram-positive bacteria, assignment, structure, validation, structural homologs, alignment
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 3. 1. 2011 13:36.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/881950/cs
    11. Synthetic N-acetylglucosamine based fully branched tetrasaccharide, a mimetic of the endogenous ligand for CD69, activates CD69+ NK cells and killer lymphocytes upon dimerization via a hydrophilic flexible linker
      KOVALOVÁ, Anna, Miroslav LEDVINA, David ŠAMAN, Daniel ZYKA, Monika KUBÍČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Petr POMPACH, Daniel KAVAN, Jan BILÝ, Ondřej VANĚK, Zuzana KUBÍNKOVÁ, Markéta VANČUROVÁ, Mária ANTOLÍKOVÁ, Zuzana LEJSKOVÁ, Hynek MRÁZEK, Daniel ROZBESKÝ, Kateřina HOFBAUEROVÁ, Vladimír KŘEN a Karel BEZOUŠKA. Synthetic N-acetylglucosamine based fully branched tetrasaccharide, a mimetic of the endogenous ligand for CD69, activates CD69+ NK cells and killer lymphocytes upon dimerization via a hydrophilic flexible linker. Journal of Medicinal Chemistry. USA: American Chemical Society, 2010, roč. 53, č. 10, s. 4050-4065. ISSN 0022-2623.
      RIV/00216224:14310/10:00044042 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kovalová, Anna (203 Česká republika) -- Ledvina, Miroslav (203 Česká republika) -- Šaman, David (203 Česká republika) -- Zyka, Daniel (203 Česká republika) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Pompach, Petr (203 Česká republika) -- Kavan, Daniel (203 Česká republika) -- Bilý, Jan (203 Česká republika) -- Vaněk, Ondřej (203 Česká republika) -- Kubínková, Zuzana (203 Česká republika) -- Vančurová, Markéta (203 Česká republika) -- Antolíková, Mária (203 Česká republika) -- Lejsková, Zuzana (203 Česká republika) -- Mrázek, Hynek (203 Česká republika) -- Rozbeský, Daniel (203 Česká republika) -- Hofbauerová, Kateřina (203 Česká republika) -- Křen, Vladimír (203 Česká republika) -- Bezouška, Karel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Lymphocyte activation; receptors for carbohydrates; crosslinking; natural killer cells; tumor immunotherapies
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 2. 4. 2014 12:40.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/885814/cs
    12. S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments
      NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Alžbeta ŠVENKOVÁ, Jean Marc NUZILLARD, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2010, roč. 46, č. 2, s. 191-197. ISSN 0925-2738.
      URL
      RIV/00216224:14310/10:00043623 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Novák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Motáčková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Švenková, Alžbeta (703 Slovensko) -- Nuzillard, Jean Marc (250 Francie) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Software - Sparky - Residual dipolar couplings - NMR
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 2. 5. 2012 16:12.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878347/cs
    13. The receiver domain of sensor histidine kinase of CKI1: its dynamic structure and binding specificity.
      PEKÁROVÁ, Blanka, Tomáš KLUMPLER, Olga TŘÍSKOVÁ, Jakub HORÁK, Lukáš ŽÍDEK, Jaromír MAREK, Radka DOPITOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. The receiver domain of sensor histidine kinase of CKI1: its dynamic structure and binding specificity. 1. vyd. Suzhou, China: Cold Spring Harbor Conferences Asia, 2010, s. 47.
      URL
      Název anglicky: The receiver domain of sensor histidine kinase of CKI1: its dynamic structure and binding specificity.
      Biochemie. angličtina. Čína.
      Klíčová slova anglicky: vícekomponentní fosforylace, 3-D struktura, NMR analýza
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 29. 4. 2011 15:31.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/911185/cs

    2009

    1. Backbone dynamics of N-terminal Domain of the Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase
      KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika MOTÁČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Mikael AKKE. Backbone dynamics of N-terminal Domain of the Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase. In Structural Biology Network 13th Annual Conference. 2009.
      URL
      Změnil: Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653. Změněno: 3. 7. 2010 19:04.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/890212/cs
    2. Backbone 1H, 13C, and 15N NMR assignment for the inactive form of the retroviral protease of the murine intracisternal A-type particle, inMIA-14 PR
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Monika KUBÍČKOVÁ, Milan KOŽÍŠEK, Klára GRANTZ ŠAŠKOVÁ, Martin ŠVEC, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Backbone 1H, 13C, and 15N NMR assignment for the inactive form of the retroviral protease of the murine intracisternal A-type particle, inMIA-14 PR. Biomolecular NMR Assignments. Netherlands: Springer Netherlands, 2009, roč. 3, č. 2, s. 261-264. ISSN 1874-2718.
      Název česky: Backbone 1H, 13C, and 15N NMR assignment for the inactive form of the retroviral protease of the murine intracisternal A-type particle, inMIA-14 PR
      RIV/00216224:14310/09:00037169 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Motáčková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Kožíšek, Milan (203 Česká republika) -- Grantz Šašková, Klára (203 Česká republika) -- Švec, Martin (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Retroviral protease; Murine intracisternal A-type particles; inMIA-14 PR; C-terminal domain; Homodimer; Assignment A-type particles \and inMIA-14 PR \and C-terminal domain; Homodimer; Assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 2. 2. 2012 17:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/854490/cs
    3. Effects of magnesium binding and beryllofluoridation on a component of the cytokinin signaling pathway studied by nuclear magnetic resonance
      TŘÍSKOVÁ, Olga, Blanka PEKÁROVÁ, Veronika MOTÁČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK a Lubomír JANDA. Effects of magnesium binding and beryllofluoridation on a component of the cytokinin signaling pathway studied by nuclear magnetic resonance. 2009.
      Název česky: Účinek navázání Mg(2+) a BeF3 na část cytokininové dráhy studované pomocí nukleární magnetické rezonance
      Název anglicky: Effects of magnesium binding and beryllofluoridation on a component of the cytokinin signaling pathway studied by nuclear magnetic resonance

      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 9. 4. 2010 15:19.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/871217/cs
    4. Investigation of Thermal Denaturation of Barley Nonspecific Lipid Transfer Protein 1 (ns-LTP1b) by Nuclear Magnetic Resonance and Differential Scanning Calorimetry
      MATEJKOVÁ, Michaela, Jitka ŽÍDKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ, Josef CHMELÍK a Vladimír SKLENÁŘ. Investigation of Thermal Denaturation of Barley Nonspecific Lipid Transfer Protein 1 (ns-LTP1b) by Nuclear Magnetic Resonance and Differential Scanning Calorimetry. Journal of Agricultural and Food Chemistry. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2009, roč. 57, č. 18, s. 8444-8452. ISSN 0021-8561.
      Název česky: Zkoumání teplotních denaturací nespecifického lipid transfer proteinu 1 (ns-LTP1b) pomocí nukleární magnetické resonance a diferenciální skenovací kalorimetrie
      Název anglicky: Investigation of Thermal Denaturation of Barley Nonspecific Lipid Transfer Protein 1 (ns-LTP1b) by Nuclear Magnetic Resonance and Differential Scanning Calorimetry
      RIV/00216224:14310/09:00036779 Článek v odborném periodiku. Potravinářství. angličtina. Spojené státy.
      Matejková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Žídková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Non-specific lipid transfer protein 1; barley grain; thermaldenaturation; nuclear magnetic resonance; differential scanningcalorimetry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 3. 2015 05:39.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/849041/cs
    5. MAGE (melanoma-associated antigen) Domain structural studies using NMR
      BATHULA, Sreenivas Reddy, Jan PALEČEK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. MAGE (melanoma-associated antigen) Domain structural studies using NMR. In Central European NMR Meeting, Valtice, CR. 2009.
      Název česky: Studium MAGE domény pomocí NMR spektroskopie
      Název anglicky: MAGE (melanoma-associated antigen) Domain structural studies using NMR
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: melanoma antigen MAGE protein NMR
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Sreenivas Reddy Bathula, Ph.D., učo 249633. Změněno: 14. 11. 2011 22:15.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/862483/cs
    6. NMR analyses of the receiver domain of CKI1 histidine kinase and its interaction with AHP proteins
      PEKÁROVÁ, Blanka, Olga TŘÍSKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jaromír MAREK, Jakub HORÁK, Radka DOPITOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. NMR analyses of the receiver domain of CKI1 histidine kinase and its interaction with AHP proteins. In ACPD 2009 : Auxins and Cytokinins in Plant Development International Symposium. 2009.
      URL
      Název anglicky: NMR analyses of the receiver domain of CKI1 histidine kinase and its interaction with AHP proteins
      RIV/00216224:14310/09:00039607 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Pekárová, Blanka (203 Česká republika) -- Třísková, Olga (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika) -- Horák, Jakub (203 Česká republika) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Histidine Kinase; CKI1; receiver domain; AHP proteins
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Změnila: Mgr. Radka Dopitová, Ph.D., učo 12868. Změněno: 9. 4. 2010 15:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/877331/cs
    7. NMR structural study of N-terminal domain of RNA polymerase delta subunit from Bacillus subtilis
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR structural study of N-terminal domain of RNA polymerase delta subunit from Bacillus subtilis. In VII Discussions in Structural Molecular Biology Nové Hrady. 2009. ISSN 1211-5894.
      Název česky: NMR strukturní studie N-terminální domény delta podjednotky RNA polymerasy z Bacilla subtila

      Klíčová slova anglicky: nmr; RNA polymerase; delta subunit; assignment; structure
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 4. 5. 2009 10:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/830572/cs
    8. NMR Structure of the N-Terminal Domain of Capsid Protein from the Mason-Pfizer Monkey Virus
      MACEK, Pavel, Josef CHMELÍK, Ivana KŘÍŽOVÁ, Pavel KADEŘÁVEK, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Marcela WILDOVÁ, Romana HADRAVOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Iva PICHOVÁ, Tomáš RUML, Michaela RUMLOVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Structure of the N-Terminal Domain of Capsid Protein from the Mason-Pfizer Monkey Virus. Journal of Molecular Biology. 2009, roč. 392, č. 1, s. 100-114. ISSN 0022-2836.
      Název česky: NMR struktura N-terminální domény kapsidového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru
      RIV/00216224:14310/09:00036514 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Macek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Křížová, Ivana (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wildová, Marcela (203 Česká republika) -- Hadravová, Romana (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Pichová, Iva (203 Česká republika) -- Ruml, Tomáš (203 Česká republika) -- Rumlová, Michaela (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: M-PMV; betaretroviruses; capsid protein; NMR structure; internal dynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 10. 3. 2011 13:05.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/842971/cs
    9. Structural study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Structural study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Central European NMR Meeting Valtice. 2009. ISBN 978-80-86441-40-5.
      Název česky: Strukturní studie podjednotky RNA polymerasy specifické pro gram-positivní bakterie
      Název anglicky: Structural study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria

      Klíčová slova anglicky: nmr, rna polymerase, assignment, structure, validation
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 30. 4. 2009 12:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/830083/cs

    2008

    1. Inactivation of colicin Y by intramembrane helix helix interaction with its immunity protein
      ŠMAJS, David, Magda DOLEŽALOVÁ, Pavel MACEK a Lukáš ŽÍDEK. Inactivation of colicin Y by intramembrane helix helix interaction with its immunity protein. FEBS Journal. 2008, roč. 275, č. 21, s. 5325 - 5331. ISSN 1742-464X.
      Název česky: Inaktivace kolicinu Y jeho imunitním proteinem
      Název anglicky: Inactivation of colicin Y by intramembrane helixhelix interaction with its immunity protein
      RIV/00216224:14310/08:00027657 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šmajs, David (203 Česká republika, garant) -- Doležalová, Magda (203 Česká republika) -- Macek, Pavel (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: colicin immunity; colicin Y; helix helix interaction; pore orming colicin; site drected mutagenesis
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 8. 6. 2010 10:40.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/817461/cs
    2. NMR study of a single-stranded DNA binding to the C-terminal domain of the protease from murine intracisternal A-type particle
      MOTÁČKOVÁ, Veronika, Monika KUBÍČKOVÁ, Martin ŠVEC, Milan KOŽÍŠEK, Lukáš ŽÍDEK, Jan KONVALINKA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of a single-stranded DNA binding to the C-terminal domain of the protease from murine intracisternal A-type particle. In XXIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems San Diego. 2008.
      Název česky: NMR studie retrovirové proteasy se zaměřením na vazbu jednovláknových nukleových kyselin k C-terminální doméně
      Název anglicky: NMR study of a single-stranded DNA binding to the C-terminal domain of the protease from murine intracisternal A-type particle

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 30. 4. 2009 13:02.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/830084/cs
    3. 1H, 13C, and 15N Resonance Assignment of the N-terminal Domain of Mason-Pfizer Monkey Virus Capsid Protein, CA1-140.
      MACEK, Pavel, Lukáš ŽÍDEK, Michaela RUMLOVÁ, Ivana PÍCHOVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. 1H, 13C, and 15N Resonance Assignment of the N-terminal Domain of Mason-Pfizer Monkey Virus Capsid Protein, CA1-140. Biomolecular NMr Assignments. Netherlands: Springer Netherlands, 2008, roč. 2, č. 1, s. 43-45. ISSN 1874-2718.
      Název česky: Přiřazení signálů 1H, 13C, and 15N N-terminální domény kapsidového proteinu Mason-Pfizer opičího viru, CA1-140.
      RIV/00216224:14310/08:00026072 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Macek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Rumlová, Michaela (203 Česká republika) -- Píchová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Mason-Pfizer Virus NMr assigments capsid protein N-terminal domain
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 10. 3. 2011 13:06.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/769121/cs

    2007

    1. Backbone Motions of Free and Pheromone-Bound Major Urinary Protein I Studied by Molecular Dynamics Simulation
      MACEK, Pavel, Petr NOVÁK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Backbone Motions of Free and Pheromone-Bound Major Urinary Protein I Studied by Molecular Dynamics Simulation. Journal of Physical Chemistry B. USA: The American Chemical Society, 2007, roč. 111, č. 20, s. 5731-5739. ISSN 1089-5639.
      Název česky: Backbone Motions of Free and Pheromone-Bound Major Urinary Protein I Studied by Molecular Dynamics Simulation
      RIV/00216224:14310/07:00022171 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Macek, Pavel (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Molecular dynamics; order parameter; NMR relaxation; motional analysis
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 11. 6. 2007 15:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/719134/cs
    2. Dynamics of major urinary protein-pheromone interactions: Insight by NMR and MD simulations
      MACEK, Pavel, Petr NOVÁK, Hana KŘÍŽOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Dynamics of major urinary protein-pheromone interactions: Insight by NMR and MD simulations. In ISMAR 2007, Program and Abstracts. Taiwan: Taiwan Magnetic Resonance Society, 2007, s. 63-63.
      URL
      Název česky: Dynamika interakce močovinového proteinu s feromonem: Studie pomocí NMR spektroskopie a MD simulací.
      RIV/00216224:14310/07:00022902 Stať ve sborníku. Biofyzika. angličtina. Tchaj-wan.
      Macek, Pavel (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Křížová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; relaxation; protein-ligand interactions; internal dynamics; N-15; MD simulations;
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727774/cs
    3. Program for Analysis of Internal Motion in Molecular Dynamics Simulation
      NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Pavel MACEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Program for Analysis of Internal Motion in Molecular Dynamics Simulation. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2007, 1 s.
      Název česky: Program pro analýzu vnitřních pohybů v molekulové dynamice
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: MD; PAIN; protein; dynamics;
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 4. 2010 13:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/853389/cs
    4. Structure of Bombyx mori chemosensory protein 1 in solution
      JANSEN, Séverine, Josef CHMELÍK, Lukáš ŽÍDEK, Petr PADRTA, Petr NOVÁK, Zbyněk ZDRÁHAL, Jean-François PICIMBON, Christer LÖFSTEDT a Vladimír SKLENÁŘ. Structure of Bombyx mori chemosensory protein 1 in solution. Archives of Insect Biochemistry and Physiology. Wiley, 2007, roč. 66, č. 3, s. 135-145. ISSN 0739-4462.
      Název česky: Structure of Bombyx mori chemosensory protein 1 in solution
      RIV/00216224:14310/07:00020544 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Jansen, Séverine (250 Francie) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Picimbon, Jean-François (250 Francie) -- Löfstedt, Christer (752 Švédsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Bombyx mori; Chemosensory proteins; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr., učo 34759. Změněno: 26. 6. 2009 10:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/726988/cs

    2006

    1. Molecular dynamics study of major urinary protein-pheromone interactions: A structural model for ligand-induced flexibility increase
      MACEK, Pavel, Petr NOVÁK, Hana KŘÍŽOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Molecular dynamics study of major urinary protein-pheromone interactions: A structural model for ligand-induced flexibility increase. FEBS Letters. Amsterdam: Elsevier Science B.V., 2006, roč. 580, č. 1, s. 682-684. ISSN 0014-5793.
      URL
      RIV/00216224:14310/06:00017608 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Macek, Pavel (203 Česká republika, garant) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Křížová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Major urinary protein; Molecular dynamics simulation; Pheromone–protein interaction; Molecular motion; TZL; Order parameter
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Petr Novák, Ph.D., učo 23060. Změněno: 30. 3. 2010 08:41.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/701742/cs
    2. 1H, 13C, and 15N resonance assignment of Bombyx mori chemosensory protein 1 (BmorCSP1)
      JANSEN, Séverine, Lukáš ŽÍDEK, Christer LÖFSTEDT, Jean-Francois PICIMBON a Vladimír SKLENÁŘ. 1H, 13C, and 15N resonance assignment of Bombyx mori chemosensory protein 1 (BmorCSP1). Journal of Biomolecular NMR. ESCOM Science Publishers B.V., 2006, roč. 36, č. 5, s. 47-47. ISSN 0925-2738.
      Název česky: 1H, 13C, and 15N resonance assignment of Bombyx mori chemosensory protein 1 (BmorCSP1)
      Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Klíčová slova anglicky: NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 16. 3. 2007 07:52.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/702327/cs

    2005

    1. New NMR Methods for Conformational Studies of Biomolecules
      FIALA, Radovan a Lukáš ŽÍDEK. New NMR Methods for Conformational Studies of Biomolecules. Materials Structure. Praha: The Czech and Slovak Cryst. Assoc., 2005, roč. 12, č. 1, s. 23-24. ISSN 1211-5894.
      URL
      Název česky: Nové metody NMR spektroskopie pro studium konformace biomolekul
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy; protein; nucleic acid; structure; conformation; residual dipolar coupling; chemical shift anisotropy
      Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 4. 11. 2005 17:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/586361/cs
    2. NEW TOOLS FOR AN ANALYSIS OF EXPERIMENTAL (NMR) AND THEORETICAL (MD) DATA
      NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Pavel MACEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. NEW TOOLS FOR AN ANALYSIS OF EXPERIMENTAL (NMR) AND THEORETICAL (MD) DATA. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2005, 1 s.
      Název česky: Nové nástroje pro analýzu experimentálních (NMR) a teoretických (MD) dat
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: S3EPY; MD; RDC; PAIN;
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 4. 2010 14:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/853390/cs
    3. NMR Study of Protein CD69
      NÁLEZKOVÁ, Monika, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Study of Protein CD69. In Strukturni biofyzika makromolekul. Czech Republic: MU, 2005, s. 13.
      Název česky: Stidium proteinu CD69 pomoci NMR
      Název anglicky: NMR Study of Protein CD69
      Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR CD69 lectin-type proteins NK cell glycoproteins
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 4. 2010 14:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/702292/cs

    2004

    1. Refinement of Trypanosoma U6 RNA Stem-Loop Structure Using 1- and 2-Bond Residual Dipolar Couplings
      NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Refinement of Trypanosoma U6 RNA Stem-Loop Structure Using 1- and 2-Bond Residual Dipolar Couplings. In 19th NMR Valtice. Brno: Masarykova universita v Brně, 2004, s. 30-30. ISBN 80-210-3352-5.
      Název česky: Rafinace struktury Trypanosoma U6 RNA s využitím jedno- a dvouvazebných zbytkových dipolárních interakcí
      RIV/00216224:14310/04:00011133 Stať ve sborníku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Novák, Petr (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; Residual dipolar couplings; RNA; structure;
      Změnil: Mgr. Petr Novák, Ph.D., učo 23060. Změněno: 31. 5. 2005 13:42.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/571832/cs
    2. Temperature Dependent Spectral Density Analysis Applied to Monitoring Backbone Dynamics of Major Urinary Protein-I Complexed with the Pheromone 2-sec-Butyl-4,5-dihydrothiazole
      KŘÍŽOVÁ, Hana, Lukáš ŽÍDEK, Martin J. STONE, Milos V. NOVOTNY a Vladimír SKLENÁŘ. Temperature Dependent Spectral Density Analysis Applied to Monitoring Backbone Dynamics of Major Urinary Protein-I Complexed with the Pheromone 2-sec-Butyl-4,5-dihydrothiazole. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2004, roč. 28, č. 4, s. 369-384. ISSN 0925-2738.
      Název česky: Temperature Dependent Spectral Density Analysis Applied to Monitoring Backbone Dynamics of Major Urinary Protein-I Complexed with the Pheromone 2-sec-Butyl-4,5-dihydrothiazole
      RIV/00216224:14310/04:00019739 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Křížová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant) -- Stone, Martin J. (840 Spojené státy) -- Novotny, Milos V. (840 Spojené státy) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: backbone dynamics; NMR relaxation; spectral density function;temperature dependence
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 12. 7. 2005 13:02.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/493134/cs

    2003

    1. Internal Consistency of NMR Data Obtained in Partially Aligned Biomacromolecules
      ŽÍDEK, Lukáš, Petr PADRTA, Josef CHMELÍK a Vladimír SKLENÁŘ. Internal Consistency of NMR Data Obtained in Partially Aligned Biomacromolecules. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press, 2003, roč. 162, č. 1, s. 385-395. ISSN 1090-7807.
      Název anglicky: Internal Consistency of NMR Data Obtained in Partially Aligned Biomacromolecules
      RIV/00216224:14310/03:00008778 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: residual dipolar couplings; chemical shift anisotropy; peptide plane; nucleic acids base
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/487506/cs
    2. The effect of water on NMR spin-spin couplings in DNA: Improvement of calculated values by application of two solvent models
      SYCHROVSKÝ, Vladimír, Bohdan SCHNEIDER, Pavel HOBZA, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. The effect of water on NMR spin-spin couplings in DNA: Improvement of calculated values by application of two solvent models. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2003, roč. 5, č. 4, s. 734-739. ISSN 1463-9076.
      Název anglicky: The effect of water on NMR spin-spin couplings in DNA: Improvement of calculated values by application of two solvent models
      RIV/00216224:14310/03:00007956 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Schneider, Bohdan (203 Česká republika) -- Hobza, Pavel (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; coupling constants; DNA hairpin DFT
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/484671/cs

    2002

    1. Exploring the Structure of a DNA Hairpin with the Help of NMR Spin-spin Coupling Constants: An Experimental and Quantum Chemical Investigation
      SYCHROVSKÝ, Vladimír, Jaroslav VACEK, Pavel HOBZA, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Dieter CREMER. Exploring the Structure of a DNA Hairpin with the Help of NMR Spin-spin Coupling Constants: An Experimental and Quantum Chemical Investigation. Journal of Physical Chemistry B. USA: The American Chemical Society, 2002, roč. 106, č. 29, s. 10242-10250. ISSN 1089-5639.
      Název anglicky: Exploring the Structure of a DNA Hairpin with the Help of NMR Spin-spin Coupling Constants: An Experimental and Quantum Chemical Investigation
      RIV/00216224:14310/02:00006454 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Vacek, Jaroslav (203 Česká republika) -- Hobza, Pavel (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Cremer, Dieter (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: NMR; coupling constants; DNA hairpin DFT
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 3. 2015 05:41.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/405487/cs
    2. Pheromone binding by polymorphic mouse major urinary proteins
      SHARROW, Scott D., Jeffrey L. VAUGHN, Lukáš ŽÍDEK, Milos V. NOVOTNY a Martin J STONE. Pheromone binding by polymorphic mouse major urinary proteins. Protein Science. Plainview: Cold Spring Harbor Lab. Press, 2002, roč. 11, č. 11, s. 2247-2256. ISSN 0961-8368.
      Název anglicky: Pheromone binding by polymorphic mouse major urinary proteins
      RIV/00216224:14310/02:00007921 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Sharrow, Scott D. (840 Spojené státy) -- Vaughn, Jeffrey L. (840 Spojené státy) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant) -- Novotny, Milos V. (840 Spojené státy) -- Stone, Martin J (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: Binding affinity; isothermal titration calorimetry; major urinary proteins eins; pheromones; selectivity
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 26. 2. 2004 09:58.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/405739/cs
    3. Refinement of d(GCGAAGC) hairpin structure using one- and two-bond residual dipolar couplings
      PADRTA, Petr, Richard ŠTEFL, Lukáš KRÁLÍK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Refinement of d(GCGAAGC) hairpin structure using one- and two-bond residual dipolar couplings. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2002, roč. 24, č. 1, s. 1-14. ISSN 0925-2738.
      Název anglicky: Refinement of d(GCGAAGC) hairpin structure using one- and two-bond residual dipolar couplings
      RIV/00216224:14310/02:00006455 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika) -- Králík, Lukáš (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: DNA hairpin; NMR; refinement; residual dipolar couplings
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/405489/cs

    2001

    1. Measurement of small scalar and resiudal dipolar couplings in purine and pyrimidine bases
      ŽÍDEK, Lukáš, Haihong WU, Juli FEIGON a Vladimír SKLENÁŘ. Measurement of small scalar and resiudal dipolar couplings in purine and pyrimidine bases. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2001, roč. 21, č. 2, s. 153-159. ISSN 0925-2738.
      Název anglicky: Measurement of small scalar and resiudal dipolar couplings in purine and pyrimidine bases
      RIV/00216224:14310/01:00004651 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Nizozemské království.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR methods; nucleic acid bases; residual dipolar couplings; spin-state-selective filter
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:40.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/375591/cs
    2. NMR methodology for the study of nucleic acids
      ŽÍDEK, Lukáš, Richard ŠTEFL a Vladimír SKLENÁŘ. NMR methodology for the study of nucleic acids. Current Opinion in Structural Biology. London: Elsevier Science Ltd., 2001, roč. 11, č. 3, s. 275-281. ISSN 0959-440X.
      Název anglicky: NMR methodology for the study of nucleic acids
      RIV/00216224:14310/01:00004237 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; nucleic acids; NMR methods; review
      Změnil: prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362. Změněno: 26. 1. 2007 17:20.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/363291/cs
    3. Structural basis of pheromone binding to mouse major urinary protein (MUP-I)
      TIMM, David E., L. J. BAKER, H MUELLER, Lukáš ŽÍDEK a Milos NOVOTNY. Structural basis of pheromone binding to mouse major urinary protein (MUP-I). Protein Science. Plainview: Cold Spring Harbor Lab. Press, 2001, roč. 10, č. 5, s. 997-1005. ISSN 0961-8368.

      Klíčová slova anglicky: FEMALE MICE; HOUSE MOUSE; PUBERTY; RESOLUTION; CRYSTALLOGRAPHY; REFINEMENT; LIPOCALIN; MUSCULUS; LIGAND; GENES
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 10:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362182/cs

    2000

    1. Glycosylated major urinary protein of the house mouse: characterization of its N-linked oligosaccharides
      MECHREF, Yehiya, Lukáš ŽÍDEK, Weidong MA a Milos NOVOTNY. Glycosylated major urinary protein of the house mouse: characterization of its N-linked oligosaccharides. Glycobiology. Oxford: Oxford University Press, 2000, roč. 10, č. 3, s. 231-235. ISSN 0959-6658.

      Klíčová slova anglicky: MASS-SPECTROMETRY; VOMERONASAL ORGAN; MUS-MUSCULUS; GENES; MATRIX; FAMILY; MICE
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 09:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362181/cs

    1999

    1. An increase in protein backbone flexibility upon binding a hydrophobic ligand
      STONE, Martin J, Lukáš ŽÍDEK, Susan M LATO, Andrew D ELLINGTON a Milos NOVOTNY. An increase in protein backbone flexibility upon binding a hydrophobic ligand. FASEB Journal. Bethesda: Federation Amer. Soc. Exp. Biol., 1999, roč. 13, 7, S, s. A1570, 1 s. ISSN 0892-6638.
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 09:51.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362177/cs
    2. Increased protein backbone conformational entropy upon hydrophobic ligand binding
      ŽÍDEK, Lukáš, Milos NOVOTNY a Martin J STONE. Increased protein backbone conformational entropy upon hydrophobic ligand binding. Nature Structural Biology. New York: Nature America Inc., 1999, roč. 6, č. 12, s. 1118-1121. ISSN 1072-8368.

      Klíčová slova anglicky: N-15 NMR RELAXATION; NUCLEAR-MAGNETIC-RESONANCE; MODEL-FREE APPROACH; ORDER PARAMETERS; DYNAMICS; SPECTROSCOPY; RECOGNITION; ENERGY; DOMAIN; ENZYME
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 09:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362179/cs
    3. NMR mapping of the recombinant mouse major urinary protein I binding site occupied by the pheromone 2-sec-butyl-4,5-dihydrothiazole
      ŽÍDEK, Lukáš, Martin J STONE, Susan M LATO, Mark D PAGEL, Zhongshan MIAO, Andrew D ELLINGTON a Milos V NOVOTNY. NMR mapping of the recombinant mouse major urinary protein I binding site occupied by the pheromone 2-sec-butyl-4,5-dihydrothiazole. Biochemistry. Washington: Amer. Chemical Soc., 1999, roč. 38, č. 31, s. 9850-9861. ISSN 0006-2960.

      Klíčová slova anglicky: CHEMICAL-SHIFT INDEX; GENE FAMILY; MUS-MUSCULUS; MOLECULAR HETEROGENEITY;IMPROVED SENSITIVITY; BACKBONE ASSIGNMENT; SECONDARY STRUCTURE; FEMALE MICE;SPECTROSCOPY; LIVER
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 26. 2. 2003 07:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362176/cs
    4. Positive identification of the puberty-accelerating pheromone of the house mouse: the volatile ligands associating with the major urinary protein
      NOVOTNY, Milos, Weidong MA, Don WIESLER a Lukáš ŽÍDEK. Positive identification of the puberty-accelerating pheromone of the house mouse: the volatile ligands associating with the major urinary protein. Proceedings of the Royal Society of London, Series B - Biological Sciences. London: Royal Soc. London, 1999, roč. 266, č. 1432, s. 2017-2022. ISSN 0962-8452.

      Klíčová slova anglicky: FEMALE MICE; MUS-MUSCULUS; SYNTHETIC ANALOGS; CONSTITUENTS; RESPONSES; FAMILY
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 14. 7. 2005 07:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362178/cs
    5. Recent biochemical insights into puberty acceleration, estrus induction and puberty delay in the house mouse
      NOVOTNY, Milos V., Weidong MA, Lukáš ŽÍDEK a Evgenij DAEV. Recent biochemical insights into puberty acceleration, estrus induction and puberty delay in the house mouse. editors. In JOHNSTON, Robert E., Dietland MULLER-SCHWARTZE a Peter W. SORENSEN. Chemical Signals in Vertebrates 8. New York: Kluwer Academic / Plenum Publishers, 1999, s. 99-116. ISBN 0306461145.
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 10. 2002 09:47.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/405753/cs

    1998

    1. Reaction of N-Acetylglycyllysine Methyl Ester with 2-Alkenals: An Alternative Model for Covalent Modification of Proteins
      BAKER, Andrew, Lukáš ŽÍDEK, Don WIESLER a Milos NOVOTNY. Reaction of N-Acetylglycyllysine Methyl Ester with 2-Alkenals: An Alternative Model for Covalent Modification of Proteins. Chemical Research in Toxicology. Washington, DC (USA): American Chemical Society, 1998, roč. 11, č. 7, s. 730-740. ISSN 08993228X.

      Klíčová slova anglicky: LOW-DENSITY-LIPOPROTEIN; MASS-SPECTROMETRY; ADDUCTS; PEROXIDATION; ALDEHYDES; HISTIDINE; GLYCINE; LYSINE
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 08:50.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/205691/cs

    1997

    1. Modification of horse heart cytochrome c with trans-2-hexenal
      ŽÍDEK, Lukáš, Petr DOLEŽEL, Josef CHMELÍK, Andrew G BAKER a Milos NOVOTNY. Modification of horse heart cytochrome c with trans-2-hexenal. Chemical Research in Toxicology. Washington, DC (USA): American Chemical Society, 1997, roč. 10, č. 6, s. 702-710. ISSN 08993228X.

      Klíčová slova anglicky: ELECTROOSMOTIC ZONE DISPLACEMENT; LIPID-PEROXIDATION PRODUCTS; BOVINESERUM-ALBUMIN; PROTEIN ADDUCTS; ALDEHYDES
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 13. 6. 2001 09:43.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362171/cs

    1996

    1. Isolation and partial characterization of mucosal pheromone-binding proteins in mice.
      ERIKSSON, Kjell-Ove, Lukáš ŽÍDEK a Milos NOVOTNY. Isolation and partial characterization of mucosal pheromone-binding proteins in mice. Abstracts of Papers of the American Chemical Society. Washington: Amer. Chemical Soc., 1996, roč. 211, č. 1, s. 94. ISSN 0065-7727.
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 10:06.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362183/cs

    1993

    1. Kinetics of inhibition of horse liver alcohol-dehydrogenase by p-methylbenzyl hydroperoxide
      ŽÍDEK, Lukáš a Miroslav ŘEZÁČ. Kinetics of inhibition of horse liver alcohol-dehydrogenase by p-methylbenzyl hydroperoxide. Journal of Enzyme Inhibition. Reading: Harwood Acad. Publ. GmbH, 1993, roč. 7, č. 3, s. 191-197. ISSN 8755-5093.

      Klíčová slova anglicky: HORSE LIVER ALCOHOL DEHYDROGENASE; P-METHYLBENZYL HYDROPEROXIDE
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 26. 2. 2003 07:36.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362175/cs
    2. Osnova paradigmat biochemie?
      ŽÍDEK, Lukáš a Michaela WIMMEROVÁ. Osnova paradigmat biochemie? Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 1993, roč. 87, č. 1, s. 122-125. ISSN 0009-2770.
      Název anglicky: A plan of the paradigms of biochemistry?
      RIV: Článek v odborném periodiku. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 11. 2001 06:43.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/196844/cs

    1992

    1. Hydroperoxidic inhibitor of horse liver alcohol-dehydrogenase activity, tightly bound to the enzyme-NAD+ complex, characteristically degrades the coenzyme
      SKURSKÝ, Ladislav, Miroslav ŘEZÁČ, Allah N KHAN, Lukáš ŽÍDEK a Jaroslav ROČEK. Hydroperoxidic inhibitor of horse liver alcohol-dehydrogenase activity, tightly bound to the enzyme-NAD+ complex, characteristically degrades the coenzyme. Journal of Enzyme Inhibition. Reading: Harwood Acad. Publ. GmbH, 1992, roč. 6, č. 3, s. 211-222. ISSN 8755-5093.

      Klíčová slova anglicky: HORSE LIVHORSE LIVER ALCOHOL DEHYDROGENASE; P-METHYLBENZYL HYDROPEROXIDE;TIGHT-BINDING INHIBITIONER ALCOHOL DEHYDROGENASE; P-METHYLBENZYL HYDROPEROXIDE;TIGHT-BINDING INHIBITION
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 26. 2. 2003 07:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362174/cs

    1991

    1. Interactions of Organic Hydroperoxides with Heme Proteins
      ŽÍDEK, Lukáš, Miroslav MACHALA a Ladislav SKURSKÝ. Interactions of Organic Hydroperoxides with Heme Proteins. Drug Metabolism and Drug Interactions. Tel Aviv: Freund Publishing House, Ltd., 1991, roč. 9, 3-4, s. 209-234. ISSN 0792-5077.

      Klíčová slova anglicky: HYDROPEROXIDE (4-METHYLBENZYL); DECOMPOSITION; HYDROPEROXIDE (CUMYL); MONOOXYGENASE (CYTOCHROME P-450 - DEPENDENT); 7-ETHOXYRESORUFIN DEETHYLATION; HEMOPROTEINS
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 10:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/362192/cs
Zobrazeno: 22. 5. 2024 18:25