Výpis publikací

OPÁLENÝ, Filip; Pavol ULBRICH; Joan PLANAS IGLESIAS; Jan BYŠKA; Jan ŠTOURAČ; David BEDNÁŘ; Katarína FURMANOVÁ a Barbora KOZLÍKOVÁ. Visual Support for the Loop Grafting Workflow on Proteins. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. United States: IEEE Computer Society, 2025, roč. 31, č. 1, s. 580-590. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://doi.org/10.1109/TVCG.2024.3456401.

ULBRICH, Pavol; Manuela WALDNER; Katarína FURMANOVÁ; Sérgio Manuel MARQUES; David BEDNÁŘ; Barbora KOZLÍKOVÁ a Jan BYŠKA. sMolBoxes: Dataflow Model for Molecular Dynamics Exploration. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. United States: IEEE Computer Society, 2023, roč. 29, č. 1, s. 581-590. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://doi.org/10.1109/TVCG.2022.3209411.

PLANAS IGLESIAS, Joan; Filip OPÁLENÝ; Pavol ULBRICH; Jan ŠTOURAČ; Zainab Kemi SANUSI; José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO; Andrea SMITH; Jan BYŠKA; Jiří DAMBORSKÝ; Barbora KOZLÍKOVÁ a David BEDNÁŘ. LoopGrafter: a web tool for transplanting dynamical loops for protein engineering. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2022, roč. 50, W1, s. "W465"-"W473", 9 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkac249.

PLANAS IGLESIAS, Joan; Filip OPÁLENÝ; Pavol ULBRICH; Jan ŠTOURAČ; Zainab Kemi SANUSI; José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO; A. SCHENKMAYEROVÁ; Jan BYŠKA; Jiří DAMBORSKÝ; Barbora KOZLÍKOVÁ a David BEDNÁŘ. Nástroj LoopGrafter. 2022.

SABANDO, María Virginia; Pavol ULBRICH; Matías SELZER; Jan BYŠKA; Jan MIČAN; Ignacio PONZONI; Axel J. SOTO; María Luján GANUZA a Barbora KOZLÍKOVÁ. ChemVA: Interactive Visual Analysis of Chemical Compound Similarity in Virtual Screening. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. IEEE, 2021, roč. 27, č. 2, s. 891-901. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://doi.org/10.1109/TVCG.2020.3030438.

JURČÍK, Adam; Katarína FURMANOVÁ; Jan BYŠKA; Vojtěch VONÁSEK; Ondřej VÁVRA; Pavol ULBRICH; Helwig HAUSER a Barbora KOZLÍKOVÁ. Visual Analysis of Ligand Trajectories in Molecular Dynamics. Online. In IEEE Pacific Visualization Symposium 2019. Bangkok, Thailand: IEEE, 2019, s. 212-221. ISBN 978-1-5386-9226-4. Dostupné z: https://doi.org/10.1109/PacificVis.2019.00032.

CHMELÍK, Jiří; Barbora KOZLÍKOVÁ; Pavel HUMPOLÍČEK; Milan DOLEŽAL; Antonín HOJNÝ; Miroslava JAREŠOVÁ; Ján BELLA; Michal HROŠ; Pavol ULBRICH; Helena LUKÁŠOVÁ a Tomáš POUZAR. NEWRON 0.97. 2014.