Diplomová práce

Strukturní role elektrostatických interakcí v C-terminální doméně podjednotky delta RNA polymerasy bakterie Bacillus subtilis

Structural role of electrostatic interactions in C-terminal domain of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis

Bc. Hana Štégnerová
Anotace

Delta podjednotka je součástí enzymu RNA polymerasy výhradně Gram pozitivních bakterií. Je to postradatelná část RNA polymerasy, nicméně je potřebná pro přežití buněk v kompetitivním prostředí. Delta podjednotka je částečně neuspořádaný protein, který se skládá ze dvou domén. N-terminální doména je strukturovaná, zatímco C-terminální doména je vnitřně neuspořádaná. C-terminální doména obsahuje mnohonásobné …více

Abstract

The delta subunit is a unique part of RNA polymerase of Gram positive bacteria. It is a dispensable subunit of RNA polymerase, however the delta subunit is required for fitness of the cells in the competitive environment. The delta subunit is a partially disordered protein, which comprises two domains. The N-terminal domain is well folded, whereas the C-terminal domain is intrinsically disordered. …více

Klíčová slova
NMR delta podjednotka RNA polymerasy IDP elektrostatické interakce RDC relaxace PRE delta subunit of RNA polymerase electrostatic interactions relaxations
Zadání práce
Cílem práce bude zjistit jakou roli hrají elektrostatické interakce ve strukturním chování podjednotky delta RNA polymerasy bakterie Bacillus subtilis. Úloha elektrostatických interakcí bude zkoumána dvěma přístupy - změnami iontové síly a mutacemi lysinů, o kterých se předpokládá, že jsou zásadní pro interakce s kyselými aminokyselinami neuspořádané části proteinu. Jako základní metoda vyhodnocení strukturních vlastností bude použita nukleární magnetická rezonance. Využity budou zejména pokročilé metody neuiniformního vzorkování, které poskytují vysoké rozlišení, nezbytné pro studium daného proteinu.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2017 04:23, prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
Plný text práce
4,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
12. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
NCBR PřF MU

Oponent

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564

Literatura

  • CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.