Bakalářská práce

Vliv iontové síly na zbytkovou strukturu C-terminální domény pojednotky delta RNA polymerázy bakterie Bacillus subtilis

Effect of inonic strenght on residual structure of C-terminal domain of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis

Hana Štégnerová
Anotace

V této bakalářské práci se věnujeme vlivu iontové síly na silně záporně nabitou C-terminální doménu částečně neuspořádaného proteinu delta podjednotky RNA polymerázy v bakterii Bacillus subtilis. N-terminální část proteinu je strukturovaná, obsahuje čtyři alfa šroubovice a antiparalelní beta skládaný list. Naopak C-terminální část je nestrukturovaná (tzv. IDP - intrinsically disordered protein) a obsahuje …více

Abstract

In this thesis we study effect of ionic strenght on residual structure of C-terminal domain of delta subunit RNA polymerase from Bacillus subtilis. Delta subunit is partially disordered protein, which contains a structured N-terminal domain and an unstructured C-terminal domain. The N-terminal domain contains four alpha helices and an antiparallel beta sheet. On the contrary, the C-terminal domain …více

Zadání práce
Cílem práce bude získat nové informace o chování pojednotky delta RNA polymerasy bakterie Bacillus subtilis. Bude zkoumán vliv iontové síly na konformační chování silně záporně nabité C-terminální domény proteinu. Jako základní přístupy budou použity různé metody NMR spektrometrie, zejména měření zbytkových dipólových interakcí. Náplní práce bude příprava médií pro taková měření (zejména stlačených polyakrylamidových gelů), provádění měření a vyhodnocování dat.
Práce zkontrolována:
19. 5. 2015 05:45, prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
Plný text práce
681,6 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
19. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Jiří Nováček, Ph.D., učo 151132

Konzultant

Mgr. Pavel Srb, Ph.D.
ext NCBR PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.