Závěrečná práce: Lucie Nekvindová: Genetické asociační studie se zahrnutím příbuzných jedinců
Bakalářská práce
Genetické asociační studie se zahrnutím příbuzných jedinců
Genetic association studies with related individuals
Anotace
V bakalářské práci se věnuji problému genetických asociačních studií, kdy jsou někteří jedinci souboru příbuzní. Zaměřuji se především na studie pacientů a kontrol s pacienty v příbuzenském vztahu. Aby byly asociační analýzy takových datových souborů korektní, je nutné vzít v úvahu korelaci mezi pokrevně příbuznými jedinci. Práce přináší řešení tohoto problému rešerší metod, které zahrnují příbuznost …více
Abstract
In this thesis I study the issue of genetic association studies in samples where some individuals are biologically related. I focus mainly on case control studies with patients in a biological relationship. When performing an analysis of such data sets it is important to account for the correlation among relatives. I present a solution of this problem by the research of methods accounting for correlations …více
Klíčová slova
Genetická informace polymorfismus genetické asociační studie studie pacientů a kontrol metody zahrnující příbuzné jedince příbuzenské koeficienty genetické softwary hereditární angioedém Genetic information polymorphism genetic association studies case control studies methods accounting for related individuals kinship coefficients genetic software hereditary angioedemaZadání práce
Genetické asociační studie často pracují s tzv. studiemi pacientů a kontrol. Co se průkaznosti asociace týče, má hodnocení rodin, namísto nepříbuzných jedinců, své výhody. Kompletní data rodin jsou ale často bohužel nedostupná. Tato práce se proto zaměří na hodnocení datových souborů, které zahrnují nejen nepříbuzné jedince (obvykle pacienty a kontroly), ale i některé příbuzné jedince pacientů.
Studentka nastuduje metody pro hodnocení nepříbuzných jedinců společně s rodinnými příslušníky v genetických asociačních studiích. Konkrétně se zaměří na studie pacientů a kontrol s pacienty v příbuzenském vztahu. V závěru rešerše těchto metod uvede přehled genetických softwarů, v nichž jsou metody implementovány. V praktické části bakalářské práce vybranou metodu použije na reálném datovém souboru ze studie pacientů s hereditárním angioedémem.
Literatura:
BURTON P. R., TOBIN M. D., HOPPER J. L., 2005: Key concepts in genetic epidemiology. The Lancet 366 (9489), 941–951.
HOPPER J. L., BISHOP D. T., EASTON D. F., 2005: Population-based family studies in genetic epidemiology. The Lancet 366 (9494), 1397–1406.25. 5. 2015 14:53, RNDr. Michaela Cvanová, Ph.D., učo 175578
- Zadáno/změněno 23. 6. 2015 13:45, Irena Mitášová
- Záznam založen 30. 3. 2015 13:04, Irena Mitášová
- Zveřejnit od 21. 5. 2015 10:08, Irena Mitášová
- Práce převzata 21. 5. 2015 10:08, Irena Mitášová
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Právní režim informací v genetických databázích a biobankách
Mgr. Ondřej Antoš -
Exprese C1-INH v leukocytech
Bc. Alžběta Novotná -
Genetická analýza predispozice k lidským infekčním chorobám
Mgr. Jana Musilová, učo 260996 -
Geneticky podmíněné příčiny neplodnosti u mužů
Mgr. Tereza Kramářová -
Genetická analýza laktázové perzistence u velkomoravské populace ze Znojma – Hradiště
Mgr. Romana Sarvašová -
Metody hodnocení genetických asociačních studií
Mgr. Lucie Kubínová, učo 357561 -
Studium krystalových forem farmaceutických substancí pomocí NMR spektroskopie pevného stavu
Mgr. Petra Holíková -
Gen pro TOMM40 v patogenezi Alzheimerovy choroby
Mgr. Petr Kohutek




