Bakalářská práce

Metody hodnocení genetických asociačních studií

Methods in genetic association studies

Lucie Brožová, učo 357561
Anotace

V bakalářské práci se věnuji hodnocení genetických asociačních studií. Genetické asociační studie hledají asociaci mezi genetickými markery a výskytem onemocnění na základě rozdílností jedinců ve studované populaci. Práce se konkrétně zaměřuje na hodnocení asociace jednonukleotidových polymorfizmů a stavu jedince: pacient/kontrola. Tyto studie jsou schopny odhalit i malé vlivy jednotlivých úseků DNA …více

Abstract

In this thesis I study the evaluation of genetic association studies. Genetic association studies look for association between genetic markers and the occurence of disease based on diversity of subjects in the study population.The work specifically focuses on the evaluation of singe nucleotide polymorphisms and association status of individuals: patient/control. These studies are able to detect even …více

Klíčová slova
Genetické asociační studie Jednonukleotidový polymorfizmus Asociace Genetický model dědičnosti Vícenásobné testování Interakce Software R Genetic association studies Single nucleotide polymorphism Association Genetic model of inheritance Multiple testing Interaction
Zadání práce
Genetické asociační studie zkoumají vztah genetických markerů (jednoho či více) ke vzniku a průběhu onemocnění včetně nemocí způsobených vnějšími patogeny. Cílem bakalářské práce bude literární rešerše toho času používaných základních statistických metod v genetických asociačních studiích na úrovni populace a aplikace nastudovaných metod na reálném datovém souboru. Práce bude zaměřena na hodnocení více genetických markerů současně, především SNPs (jednonukleotidových polymorfismů). Studentka nastuduje metodologii hodnocení populací nepříbuzných jedinců, dále pochopí základy klasické genetiky a porozumí významu studia genetiky ve vztahu ke vzniku nemocí. Nastudované metody následně studentka použije na reálném datovém souboru genomického výzkumu rezistence/vnímavosti ke vzniku nemoci u koní. Studentka se naučí pracovat s různými statistickými programy pro analýzu dat, především s R, dále lze i Statistica for Windows, SPSS, případně software specializovaný pro hodnocení genetických dat. Vypracuje konečné publikovatelné výstupy provedených analýz.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
22. 5. 2012 22:09, RNDr. Michaela Cvanová, Ph.D., učo 175578
Plný text práce
2,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
21. 6. 2012
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Michaela Cvanová, Ph.D., učo 175578
IBA SpolP LF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

RNDr. Jan Mužík, Ph.D., učo 1574
IBA SpolP LF MU

Literatura

  • FOULKES, Andrea S. Applied statistical genetics with R : for population-based association studies. New York: Springer Verlag, 2009, xxiii, 252. ISBN 9780387895536.
  • LI, Wentian. Three lectures on case-control genetic association analysis. Briefings in Bioinformatics. Oxford (UK): Oxford University Press, 2008, Jan 2008, vol. 9, s. 1-13. ISSN 1467-5463.
  • BALDING, David J. A tutorial on statistical methods for population association studies. Nature Reviews Genetics. 2006, Oct 2006, vol. 7, s. 781-791.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.