Bakalářská práce

Vytvoření ImageJ pluginu pro segmentaci kapilárních sítí

ImageJ plugin for angiogenesis segmentation

Jakub Kovařík
Anotace

Cílem bakalářské práce bylo vytvoření pluginu programu ImageJ pro segmentaci obrazů kapilárních sítí. Plugin byl vytvořen na základě im-plementace segmentační metody v Matlabu dodané vedoucím práce. Prá-ce obsahuje stručný popis programu ImageJ, popis použité metody, popis vlastní implementace a porovnání výstupů s výstupy implementace v Matlabu. Součástí práce je i webová stránka popisující vytvořený plugin.

Abstract

The aim of this thesis was to create a plugin for program ImageJ for segmentation of capillary network. Thesis contains breif description of ImageJ, description of the segmentation method, description of the implementation and the comparsion of results with results of Matlab implementation. A part of this thesis is also the website describing the implemented plugin.

Klíčová slova
ImageJ plugin Java segmentace kapilárních sítí angiogeneze
Zadání práce

Cílem práce je vytvořit ImageJ plugin pro segmentaci obrazů kapilárních sítí. Student dostane implementaci segmentační metody v Matlabu a implementuje ji v Javě tak, aby byla použitelná jako ImageJ plugin. Práce musí obsahovat detailní porovnání obou implementací na reálných datech a diskusi případných rozdílů. Vytvořený plugin musí být plně funkční a snadno použitelný pro uživatele ImageJ. Součástí práce je i vytvoření jednoduché webové stránky o implementovaném pluginu.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
7. 1. 2014 17:18, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
Plný text práce
2,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
6. 2. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
KVI FI MU

Oponent

Mgr. Karel Štěpka, Ph.D., učo 172454
CABO KVI FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.