Bakalářská práce

Vytvoření ImageJ pluginu pro kvantifikaci kompaktních a difůzních struktur

ImageJ plugin for characterizing diffuse and compact structures

Martin Dřímal
Anotace

Cílem bakalářské práce bylo vytvoření pluginu pro program ImageJ pro kvantifikaci kompaktních a difuzních struktur v obrazech fluorescenčně značených buněk. V rámci bakalářské práce byl vytvořen plugin a doprovodná webová stránka popisující vytvořený plugin tak, aby byl volně dostupný komunitou pracující s biomedicínskými daty. Bakalářská práce pojednává i o možnostech tvorby rozšíření do programu ImageJ.

Abstract

The aim of this thesis was to create a plugin for the program ImageJ for quanti- fying assembly and disassembly of the Golgi complex in fluorescence microscopy images of live cells. The aim of this thesis was created plugin and accompanying website describing created plugin so as to be available for community working with biomedical data. This thesis is aimed at develeping plugins for program ImageJ.

Klíčová slova
ImageJ plugin macro Java kvantifikace zpracování obrazu Golgi aparát difuzní a kompaktní fenotyp
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
21. 5. 2013 10:29, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
Plný text práce
831 KB / soubor PDF
Přílohy (4)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
20. 6. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
KVI FI MU

Oponent

doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D., učo 2824
KVI FI MU

Literatura

  • MATULA, Petr; Tautvydas LISAUSKAS; Vytaute STARKUVIENE a Karl ROHR. Quantification of Golgi Complex Assembly and Disassembly in LiveCell Fluorescence Microscopy Images. In Proceedings of Workshop on Microscopic Image Analysis with Applications in Biology. Neuveden: Neuveden, 2011, 4 s.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.