Bakalářská práce

Implementace algoritmu pro korekci barevné vady jako plugin ImageJ

ImageJ plugin for correcting chromatic shifts

Stanislau Dubrouski, učo 374641
Anotace

Cílem práce byla implementace algoritmu pro měření a korekci barevné vady v mikroskopických snímcích pořízených pomocí fluorescenčních mikroskopů. Algoritmus byl implementován jako plugin pro použití v programu ImageJ. V rámci práce byla také vytvořená webová stránka se stručným popisem pluginu.

Abstract

The aim of this thesis was to implement algorithm for measurement and correction of chromatic aberrations in microscopic images, acquired with fluorescent microscopes. The algorithm was implemented for using as plugin for ImageJ. Web page with short description of plugin was also created.

Zadání práce
Cílem práce je vytvoření pluginu pro ImageJ, který bude implementovat algoritmus pro korekci barevné vady dle článku [1]. Korekční povrchy musí být možné spočítat z několika zadaných 3D obrazů fluorescenčních kuliček a musí být možné zkorigovat zadané obrazy dle spočítaných korečních povrchů (např. uložených v textovém souboru). Součástí práce je i vytvoření webové stránky o pluginu, která musí obsahovat příklady jeho správného použití.
Práce zkontrolována:
7. 1. 2014 17:08, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
6. 2. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
KVI FI MU

Oponent

RNDr. Pavel Karas, Ph.D., učo 106808
ÚTFA Fyz PřF MU

Literatura

  • KOZUBEK, Michal a Petr MATULA. An efficient algorithm for measurement and correction of chromatic aberrations in fluorescence microscopy. Journal of Microscopy. Oxford: Blackwell Science, 2000, roč. 200, č. 3, s. 206-217. ISSN 0022-2720.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.