Diplomová práce

Možnosti použití syntetických, teplotně citlivých polymerů pro imobilizaci savčích buněk v in-cell NMR spektroskopii

Application potential of synthetic, thermosensitive polymers for immobilization of mammalian cells in in-cell NMR.

Bc. Šárka Pospíšilová
Anotace

Pro studium struktury biomolekul v živých buňkách byla zavedena metoda in-cell NMR. Díky používání průtokového bioreaktoru, jenž zásobuje imobilizované buňky čerstvým médiem, lze zásadně prodloužit dobu in-cell NMR měření. Pro imobilizaci buněk v bioreaktoru se používají různé gelové nosiče, většina však neumožňuje po měření buňky ze vzorku šetrně izolovat zpět. Zde jsem testovala nové kopolymery na …více

Abstract

The in-cell NMR technique has been employed to study structures of biomolecules in living cells. By using a flow-through bioreactor that supplies fresh medium to the immobilized cells, the duration of in-cell NMR measurements can be significantly extended. Various gel carriers are used to immobilize cells in the bioreactor, but most of them do not allow the cells to be gently recovered from the sample …více

Klíčová slova
In-cell NMR In-cell NMR bioreaktor Biopolymer Imobilizace buněk Transfekce In-cell NMR bioreactor Immobilization of cells Transfection
Zadání práce
Oficiální zadání: Cílem diplomové práce je vyhodnocení aplikačního potenciálu syntetických, biokompatibilních a teplotně citlivých ko-polymerů na bázi poly(lactide-co-glycolide)-b-poly(ethyleneglycol)-b-poly(lactide-co-glycolide) (PLGA-PEG-PLGA) pro imobilizaci savčích buněk v 3D uspořádání pro bioanalytické aplikace založené na in-cell NMR spektroskopii. Důraz bude kladen zejména na: a) vypracování postupů pro zpětnou izolaci buněk z gelové matrix pro následnou cytometrickou a mikroskopickou analýzu a b) vyhodnocení dopadů imobilizace na parametry vnitrobuněčného prostředí a životaschopnost buněk. V rámci teoretické části diplomové práce student/studentka vypracuje rešerši na téma „Možnosti a omezení použití biokompatibilních polymerů pro imobilizaci savčích buněk v in-cell NMR spektroskopii“. Doporučená literatura: 1) Kubo et al. A gel-encapsulated bioreactor system for NMR studies of protein-protein interactions in living mammalian cells. Angew Chem Int Ed Engl. 2013 Jan 21;52(4):1208-11. 2) Burz et al. Improved sensitivity and resolution of in-cell NMR spectra. Methods Enzymol. 2019;621:305-328. 3) Cox et al. A novel bioreactor for combined magnetic resonance spectroscopy and optical imaging of metabolism in 3D cell cultures. Magn Reson Med. 2019 May;81(5):3379-3391. 4) Cerofolini et al. Real-Time Insights into Biological Events: In-Cell Processes and Protein-Ligand Interactions. Biophys J. 2019 Jan 22;116(2):239-247. 5) Breindel, Shekhtman. Active metabolism unmasks functional protein-protein interactions in real time in-cell NMR. Commun Biol. 2020, 3(1):249.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
20. 5. 2022 08:10, prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc., učo 1865
Plný text práce
3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
21. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D., učo 8725
NekGen CSB CEITEC MU

Oponent

Mgr. Tomáš Loja, Ph.D., učo 41673
Genomics CMM CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Jan Ryneš, Ph.D., učo 119705
NekGen CSB CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Bioanalytik

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.