Diplomová práce

Struktura a dynamika nukleových kyselin

Structure and Dynamics of Nucleic Acids

Bc. Viktor Illík
Anotace

Tato diplomová práce studuje strukturu a dynamiku DNA a ovlivnění jejích mechanických vlastností přítomností nekanonického páru bází vneseného do struktury chybnou replikacií DNA. Získané výsledky jsou diskutovány v kontextu mechanismu rozpoznání chyby lidským reparačním enzymem MutSα i jeho homology a proto může tato studie pomoct k pochopení mechanismu opravy DNA. Ke studiu byli využity metody výpočetní …více

Abstract

This diploma thesis studies the structure and dynamics of DNA and the alteration of its mechanical properties in the presence of a non-canonical base pair introduced into the structure by erroneous replication of DNA. Acquired results are discussed in the context of error recognition mechanism by human repair enzyme MutSα and its homologues. The outcome of this study may therefore contribute to understanding …více

Klíčová slova
DNA páry bazí replikace DNA mismatch repair MutSα ABF molekulová dynamika base-pairing DNA replication mismatches molecular dynamics
Zadání práce
Cílem práce je studium struktury a dynamiky nukleových kyselin (DNA) obsahujících nesprávné párovaní bází. Získané výsledky budou diskutovány v kontextu opravných mechanismů jakou jsou MMR (DNA mismatch repair). Dynamické vlastnosti DNA budou studovány pomocí metod molekulové dynamiky kombinované s výpočty volných energií zaměřených na vyčíslení vlivu chyby v párování na mechanické vlastnosti DNA. Struktura nekanonického párování bude dále studována pomocí hybridních kvantově mechanických / molekulově mechanických výpočtů s cílem pochopit souvislosti mezi strukturou a mechanickými vlastnostmi poškozené DNA.
Literatura: dle vlastní rešerše
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
28. 5. 2018 08:56, RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703
Plný text práce
4,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
8. 6. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Stanislav Kozmon, Ph.D.
VyCh CSB CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Tomáš Bouchal, Ph.D.
BiolÚ Teorie LF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.