Doctoral thesis

Computational modelling and study of electrostatic interactions in biological systems

Francesco Luca Falginella, UČO 442701
Abstract

Všechny hlavní biomolekuly, jako jsou proteiny, lipidy a nukleové kyseliny, obsahují nabité a/nebo polární chemické skupiny. Elektrostatické interakce těchto skupin patří k nejsilnějším a nejdalekodosahovějším v biologických systémech. Tyto interakce proto hrají klíčovou roli při určování rozpustnosti, struktury a funkce molekul. Ve výpočetní biologii se elektrostatické interakce popisují pomocí parciálních …more

Abstract

All major biomolecules such as proteins, lipids, and nucleic acids contain charged and/or polar chemical groups. The electrostatic interactions of these groups are among the strongest and most long-range in biological systems. Consequently, these interactions play a crucial role in the determination of molecular solubility, structure, and function. In computational biology, electrostatic interactions …more

Keywords
Elektrostatické interakce Parciální atomové náboje Metoda ekvalizace elektronegativit DEP doména C-koncová doména RNA polymerázy II Virus LRV1 Interakce protein-membrána Fázová separace kapalina-kapalina Interakce protein-nukleová kyselina Molekulová dynamika Simulace Monte Carlo Electrostatic interactions Partial atomic charges Electronegativity equalization method DEP domain C-terminal domain of RNA polymerase II LRV1 virus Protein-membrane binding Liquid-liquid phase separation Protein-nucleic acid interactions Molecular dynamics simulations Monte Carlo simulations
Administrative information
The thesis has been checked:
23/6/2023 05:45, prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., UČO 115936
Full text of thesis
45,1 MB / file PDF
Language used
English English
Defence date
11/9/2023
The thesis was defended successfully

Supervisor

prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., UČO 115936
NCBR PřF MU

Readers

doc. RNDr. Mgr. Jan Heyda, Ph.D.
ÚFCH VŠCHT Praha
Dr. Milán Szöri
Institute of Chemistry, University of Miskolc, Hungary
Cite this text
Masaryk University Faculty of Science
Programme
Plan
Biomolecular chemistry and bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.