Bakalářská práce

Knihovna pro tvorbu pluginů pro PyMOL

A Tool for Developing PyMOL Plugins

Matěj Škrabánek
Anotace

V dnešní době existuje škála programů zabývající se analýzou makromolekulárních struktur a nové jsou denně vyvíjeny. Cílem této práce je vytvoření nástrojů, které umožní těmto programům přístup k vizualizační aplikaci PyMOL, a to způsobem vytvářejícím jak možnosti překladu výstupních dat analytických programů do dat, které je aplikace PyMOL schopna zobrazit, tak možností tvorby uživatelského rozhraní …více

Abstract

In today's world there exists range of programs dealing with analysis of macromolecular structures and new are being created every day. Goal of this thesis is creation of tools, that will allow these programs to access visualization aplication PyMOL. For this reason library PyMOLBuilder and aplication PyMOLPluginCompiler were created allowing transformation of programs writen in language C# to programs …více

Klíčová slova
PyMOL Python C# Roslyn plugin kompilátor.
Zadání práce
PyMOL je velmi populární software pro vizualizaci chemických struktur, který umožňuje tvorbu uživatelských pluginů v jazyce Python. Úkolem studenta je navrhnout a implementovat knihovnu v prostředí Microsoft .NET pro usnadnění tvorby těchto pluginů. Součástí práce je demonstrace funkčnosti navrženého řešení na dvou konkrétních aplikacích (aplikace pro výpočet tunelů v proteinech a přikládání molekulárních struktur).
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
22. 5. 2012 13:04, RNDr. David Sehnal, Ph.D., učo 140435
Plný text práce
1,1 MB / soubor PDF
Přílohy (2)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
20. 6. 2012
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. David Sehnal, Ph.D., učo 140435
NCBR PřF MU

Oponent

prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
CF BioData CSB CEITEC MU

Literatura

  • AHO, Alfred V. Compilers : principles, techniques, & tools. 2nd ed. Boston: Pearson/Addison Wesley, 2007, xxiv, 1009. ISBN 0321486811.
  • CWALINA, Krzysztof a Brad ABRAMS. Framework Design Guidelines: Conventions, Idioms, And Patterns For Reusable .NET Libraries. 2nd ed. Addison-Wesley Professional, 2008, 480 s. ISBN 978-0-321-54561-9.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Matěj Škrabánek FI B-AP BcAP fvrs6/8
Drštková, E.
24. 4. 2012
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Škrabánek, M.
20. 5. 2012
Anotace česky annotation.txt
Škrabánek, M.
20. 5. 2012
Klíčová slova keywords.txt
Škrabánek, M.
20. 5. 2012
Plný text práce thesis.pdf
Škrabánek, M.
21. 5. 2012
Posudek oponenta posudek_oponenta_skrabanek.doc
Svobodová Vařeková, R.
11. 6. 2012
Příloha Prilohy.zip
Škrabánek, M.
20. 5. 2012
Příloha thesis.tex
Škrabánek, M.
20. 5. 2012

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.