Bakalářská práce

Interactive Molecular Surface Generation

Hugo Adamove
Anotace

Cieľom práce je implementovať multiplatformovú aplikáciu na vizualizáciu molekúl s využitím nedávno vyvinutého grafického API WebGPU. Podstatnou zložkou aplikácie je podpora generovania a vykresľovania molekulárnych povrchov v reálnom čase na základe algoritmu navrhnutého Hermosillom et al. v článku pod názvom "Interactive GPU-based generation of solvent-excluded surfaces". Okrem toho sa v práci skúmajú …více

Abstract

The thesis aims to implement a cross-platform molecular visualization application using the recently developed WebGPU graphics API. The vital component of the application is the support for real-time molecular surface generation and rendering based on an algorithm proposed by Hermosilla et al. in a paper titled "Interactive GPU-based generation of solvent-excluded surfaces." Furthermore, the thesis …více

Zadání práce
The aim of this thesis is to implement an algorithm for the real-time computation of molecular surfaces based on the work of Hermosilla et al. [1]. The surface itself will be rendered using raymarching. The application will enable loading one or multiple PDB files describing either a static or dynamic molecule. The surface should be computed and rendered in real-time to support the dynamic playback of a molecular simulation. As the performance of the algorithm by Hermosilla et al. [1] depends on the requested resolution of the final surface, the application will enable users to set this parameter manually to test various settings. The implementation will run on top of native APIs, and WebGPU via WebAssembly to explore the current possibilities for developing molecular visualization for both native and web platforms. [1] Hermosilla, Pedro, et al. "Interactive GPU-based generation of solvent-excluded surfaces." The Visual Computer 33.6 (2017): 869-881.
Práce zkontrolována:
19. 12. 2022 17:05, RNDr. Jan Byška, Ph.D., učo 207879
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
31. 1. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Jan Byška, Ph.D., učo 207879
KVI FI MU

Oponent

Mgr. Matúš Talčík, učo 445341
KVI FI MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Informatika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.