Diplomová práce

Abstract Visualization of Chromatin Sructure

Bc. Veronika Škvarlová
Anotace

Molekulárna vizualizácia je užitočný nástroj pre vedcov, aby dokázali lepšie pochopiť zložité biologické dáta. Namiesto zobrazovania úplých dát, abstraktné vizualizácie pomáhajú identifikovať ich konkrétne vlastnosti. V oblasti genomiky výskumníci študujú priestorové usporiadanie chromatínového vlákna, komplexnej štruktúry, ktorá vtesná dlhé vlákna DNA vnútri bunky. Analýza tohto priestorového usporiadania …více

Abstract

Molecular visualization is a powerful tool for scientists to better understand complex biological data. Rather than displaying the entire data, abstract visualizations help identify its specific properties. In genomics, researchers have been studying the spatial arrangement of chromatin fiber, a complex structure that compacts long strands of DNA into a cell's nucleus. Analyzing this spatial arrangement …více

Zadání práce
The goal of the thesis is to design and implement suitable visualization techniques for complex spatial models of chromatin. The student will study the topic of abstract visual representations of spatial biological data and discuss existing solutions in the textual part of the thesis. Subsequently, the student will design suitable abstract representations for the spatial arrangement of chromatin fiber and its properties. The representations should communicate the arrangement of spatial sub-units of the chromatin, their proximity, and interaction. The representations will be implemented and integrated into an existing application for visualization of chromatin data. The student will further design and implement the user interface for interaction with the spatial model, including controls for the selection of visual representations and aggregation level of the spatial data.
Práce zkontrolována:
23. 5. 2024 20:44, RNDr. Katarína Furmanová, Ph.D., učo 374538
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
17. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Katarína Furmanová, Ph.D., učo 374538
KVI FI MU

Oponent

RNDr. Vít Rusňák, Ph.D., učo 172757
KVI FI MU

Konzultant

RNDr. Jan Byška, Ph.D., učo 207879
KVI FI MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Počítačová grafika a vizualizace
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.