Bakalářská práce

Studium zaměnitelnosti kovových iontů v lektinu PA-IIL z lidského patogenu Pseudomonas aeruginosa

Study of metal ion interchangeability in PA-IIL lectin from Pseudomonas aeruginosa

Tereza Michalíková, učo 484595
Anotace

Predmetom záujmu bakalárskej práce bol lektín PA-IIL produkovaný baktériou Pseudomonas aeruginosa, ktorý sa vyznačuje neobyčajným väzbovým módom sprostredkovaným dvoma vápenatými iónmi, ktoré participujú na interakcii lektínu so sacharidom. Pôvodným cieľom práce bolo štúdium možnosti zámeny iónov vápnika v lektíne PA-IIL inými dvojmocnými iónmi kovov. Nakoľko však bol pri testovaní aktivity získaného …více

Abstract

The subject of interest of the bachelor thesis was the lectin PA-IIL produced by the bacterium Pseudomonas aeruginosa and characterized by an unusual binding mode mediated by two calcium ions, which participate in the interaction of the lectin with carbohydrates. The original aim of this work was to study the possibility of replacement of calcium ions in lectin PA-IIL by other divalent metal ions. …více

Klíčová slova
lektín PA-IIL vápenaté ióny Pseudomonas aeruginosa hemaglutinácia lectin calcium ions hemagglutination
Zadání práce

Proteiny schopné specificky a reverzibilně vázat sacharidy se označují jako lektiny. Lektiny hrají významnou úlohu v mnoha adhezivních a rozpoznávacích procesech, proto často patří lektiny patogenních mikroorganismů mezi faktory virulence. Rodina lektinů z tzv. PA-IIL rodiny je unikátní svým vazebným modem, kdy se na interakci se sacharidy podílí dva ionty vápníku. V rámci bakalářské práce bude připraven lektin PA-IIL z Pseudomonas aeruginosa, otestovány jeho aglutinační schopnosti a v případě získání aktivního proteinu bude studována možnost záměny iontů vápníku jinými ionty kovů a studovány případné změny ve vazebných vlastnostech proteinu moderními biofyzikálními metodami a v případě získání potřebného množství proteinu i jeho krystalizace.

Cíle práce:

  • Izolace plasmidu nesoucího gen pro lektin PA-IIL, transformace E. coli pro vytvoření expresního systému pro produkci proteinu.
  • Produkce rekombinantního proteinu PA-IIL a jeho purifikace.
  • Ověření vazebných vlastností proteinů.
  • V případě získání aktivního proteinu v dostatečném množství studium možnosti záměny iontů vápníku jinými ionty kovů v lektinu PA-IIL a jeho krystalizace v komplexech se sacharidem.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
3. 6. 2021 13:38, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
7. 7. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Marek Korsák, učo 436513
NCBR PřF MU

Konzultant

Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.