Bakalářská práce

Vliv kovů na vazebné vlastnosti lektinů

Influence of ions on binding properties of lectines

Anna Ondráčková
Anotace

V této práci jsou předmětem studia proteiny PA-IIL pocházející z bakterie Pseudomonas aeruginosa a BC2L-A pocházející z bakterie Burkholderia cenopacia, v jejichž vazebných místech se nacházejí dva vápenaté ionty podílející se na vazbě se sacharidem. Cílem práce bylo odebrat tyto vápenaté ionty z vazebného místa lektinů, nahradit je jinými dvojmocnými kovovými ionty a poté měřit jejich aktivitu a vazebné …více

Abstract

The object of the study are proteins PA-IIL from bacteria Pseudomonas aeruginosa and BC2L-A from bacteria Burkholderia cenopacia, in whose binding site there are two calcium ions, that mediate binding between the lectin and a sacharide. The goal of this work is to remove these two calcium ions from the protein's binding site, replace them with other metal ions and then measure their activity and binding …více

Zadání práce
Cílem bakalářské práce je otestovat, zda-li je možné zaměnit vápenaté kationty, které se nachází ve vazebných místech lektinů BC2L-A a PA-IIL kde zprostředkovávají vazbu cukrů, za jiné vybrané kovové kationty a dále studovat vliv těchto kovů na vazebné vlastnosti daných proteinů. Lektiny BC2L-A z bakterie Burgholderia cepacia a PA-IIL z bakterie Pseudomonas aeruginosa jsou sekvenční a strukturní homology náležející do tzv. PA-IIL lektinové rodiny. Oba proteiny vážou cukry pomocí dvou vápenatých kationtů, které se nachází v jejich vazebných místech. Tyto proteiny budou připraveny v dostatečné čistotě a bez vápenatých iontů. Následně bude testována jejich schopnost přijmout do svého vazebného místa kationty vybraných kovů. Vazebné vlastnosti takto připravených proteinů s různými kationty ve vazebném místě budou studovány metodou izotermální titrační kalorimetrie, případně budou tyto proteiny krystalovány pro následné strukturní studie.
Práce zkontrolována:
15. 6. 2015 11:15, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D., učo 63581

Konzultant

Mgr. Jana Šístková, Ph.D.
abs PřF MU

 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.