Bakalářská práce

Studium struktury proteinů pomocí rentgenové krystalografie

Protein structure study using X-ray crystallography

Martin Kollár
Anotace

Táto bakalárska práca sa venuje štúdiu riešenia štruktúr lektínov na základe kryštalografických dát. Konkrétne ide o mutantné lektíny BC2L-A z baktérie Burkholderia cenocepacia a RS-IIL lektín z baktérie Ralstonia solanacearum, ktoré obsahujú každá po jednej mutácií v ich väzbovom mieste. Táto bakalárska práca sa zameriava hlavne na čo najlepšie spracovanie difrakčných dát a získanie čo najkvalitnejšej …více

Abstract

This bachelor thesis is devoted to study of solving the structure of lectins based on X-ray crystallography data. Especially mutant lectin BC2L-A from bacteria Burkholderia cenocepacia and lectin R-IIL from bacteria Ralstonia solanacearum, which both have a single mutation in their binding site. This bachelor thesis is focused on the best processing of difraction data and getting the structure of …více

Zadání práce
Struktura proteinů a jejich komplexů je klíčem k pochopení jejich funkce v organismu. Znalost 3D struktury nám dává možnost cíleně navrhovat mutace či analyzovat vliv inhibitorů a je rovněž nezbytným předpokladem pro aplikaci in silico přístupů. V současnosti je používáno několik zavedených metod k určování struktury, přičemž rentgenová krystalografie je metodou s nejvyšším množstvím vyřešených struktur. Pro zpracování dat je třeba kombinovat řadu nástrojů a programů, jejichž vývoj stále pokračuje. Předmětem bakalářské práce bude zpracování naměřených difrakčních dat, řešení struktury a následná analýza získaných 3D modelů proteinů.
Práce zkontrolována:
16. 5. 2017 08:29, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
Plný text práce
2,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
13. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781
NCBR PřF MU
prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Michal Babiak

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.