Diplomová práce

Studium zaměnitelnosti kovových iontů ve vazebném místě lektinů

Study of metal ion substitutions in binding sites of lectins

Bc. Petr Baroň
Anotace

Tato práce se zabývá studiem lektinů PA-IIL z Pseudomonas aeruginosa a BC2L-A z Burkholderia cenocepacia. Tyto lektiny patří do lektinové rodiny PA-IIL, pro které je charakteristická přítomnost dvou Ca2+ iontů ve vazebném místě zprostředkovávajících vazbu sacharidu. V rámci diplomové práce byla studována možnost záměny vápenatých iontů ve vazebných místech lektinů PA-IIL a BC2L-A za jiné ionty kovů …více

Abstract

This work focuses on the study of the lectins PA-IIL from Pseudomonas aeruginosa and BC2L-A from Burkholderia cenocepacia. These lectins belong to the PA-IIL lectin family, which is characterized by the presence of two Ca2+ ions in the binding site that mediate sugar binding. The aim of this thesis was to investigate the possibility of substituting the calcium ions in the binding sites of PA-IIL and …více

Zadání práce
Lektiny hrají významnou úlohu v mnoha adhezivních a rozpoznávacích procesech včetně interakce patogenních mikroorganismů s hostitelem. Z hlediska biotechnologických aplikací lze využít jejich schopnosti interagovat specificky a reverzibilně se sacharidy a sacharidovými složkami glykoproteinů. Slouží tak při separaci proteinových směsí, identifikaci glykosylací jednotlivých proteinů ale i pro specifické barvení vzorků tkání pacientů. Lektiny z tzv. PA-IIL rodiny jsou unikátní svým vazebným módem, kdy se na interakci se sacharidy podílí dva ionty vápníku. Ta zajištuje nejen jejich specifitu ale i vysokou afinitu, čehož by se dalo využít při bioremediaci kovů. V rámci diplomové práce bude studována možnost záměny vápenatých iontů ve vybraných lektinech jinými dvoumocnými ionty a následně vliv této substituce na jejich vazebné vlastnosti. Bylo by tak možné připravit lektiny s pozměněnými vlastnostmi, případně identifikovat možná rizika při jejich použití pro vzorky kontaminované např. těžkými kovy.
Práce zkontrolována:
19. 5. 2023 09:48, Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
28. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
ÚBioch Chem PřF MU
Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781
CF BIC CSB CEITEC MU

Oponent

MVDr. Eva Paulenová, Ph.D., učo 437375
GBCh CSB CEITEC MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biotechnologie
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.