Bakalářská práce

Grafické uživatelské rozhraní pro vizualizaci simulací a experimentů na e-cyanobacterium.org

Graphical User Interface for Visualisation of Simulations and Experiments in E-cyanobacterium.org

Jozef Mikušinec, učo 456207
Anotace

Cieľom práce je upraviť existujúci vizualizátor na stránke e-cyanobacterium.org, alebo navrhnúť a implementovať jeho novú verziu tak, aby spĺňala nové požiadavky na jeho funkcionalitu a technické aspekty. V prvej časti práce sú detailne rozpracované požiadavky na novú verziu vizualizátora. Druhá časť práce porovnáva niekoľko technológií, ktoré by mohli byť použité na implementáciu vizualizátora. Tretia časť popisuje samotnú implementáciu.

Abstract

The goal of this thesis is to modify the existing visualizer on the website e-cyanobacterium.org, or to design and implement its new version such that it will fulfill new requirements on its functionality and technical aspects. In the first part of the thesis, requirements for the visualizer are detailed. The second part compares several technologies that could be used to implement the visualizer. The third part describes the implementation itself.

Klíčová slova
vizualizace web e-cyanobacterium.org plot.ly
Zadání práce

Tématem práce je rozšíření webové platformy e-cyanobacterium.org pro modelování, anotaci a analýzu biologických systémů o grafické uživatelské rozhraní, které umožní efektivní vizualizaci simulačních a experimentálních dat generovaných dedikovanými moduly platformy. Vizualizační komponenta plně nahradí existující implementaci, která nevyhovuje aktuálním požadavkům a současným trendům webových aplikací.

V teoretické části se student seznámí s existující vizualizační komponentou a state-of-the-art technologiemi, které jsou relevantní vzhledem k potřebám platformy e-cyanobacterium.org.

Na základě průzkumu existujících technologií student navrhne řešení, které dále implementuje v praktické části práce. Jazyk implementace je ponechán na volbě studenta a konzultaci s vedoucím práce.

Implementace bude otestována na existujících experimentech a modelech, které jsou v současné době dostupné v rámci portálu e-cyanobacterium.org.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
30. 5. 2019 11:56, doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159
Plný text práce
350,2 KB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
24. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159
KSUZD FI MU

Oponent

RNDr. Matej Troják, Ph.D., učo 410129
KSUZD FI MU

Literatura

  • KLEMENT, Matej; David ŠAFRÁNEK; Tadeáš DĚD; Aleš PEJZNOCH; Ladislav NEDBAL; Ralf STEUER; Jan ČERVENÝ a Stefan MUELLER. A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models. Online. In Proceedings of the fourth International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio'13). Neuveden: Elsevier, 2013, s. 61-67. ISSN 1571-0661. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.entcs.2013.11.006.
  • TROJÁK, Matej; David ŠAFRÁNEK; Jakub HRABEC; Jakub ŠALAGOVIČ; Františka ROMANOVSKÁ a Jan ČERVENÝ. E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria. In Ezio Bartocci et al. Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2016. Heidelberg: Springer, 2016, s. 316-322. ISBN 978-3-319-45176-3. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/978-3-319-45177-0_20.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.