Bakalářská práce

Detekce a výpočet charakteristik proteinů

Detection and computation of protein characteristics

Matej Ružôň
Anotace

Teoretická časť tejto práce sa zaoberá troma charakteristikami proteínov: násobnou väzbou, parciálnym nábojom a vodíkovou väzbou. Praktická časť tejto práce sa zaoberá detekciou a výpočtom týchto charakteristík. Výstupom je implementácia týchto algoritmov do aplikácie CAVER.

Abstract

The theoretical part of this thesis deals with three characteristics of proteins: multiple bond, partial charge and hydrogen bond. The practical part of this thesis deals with detection and calculation of these characteristics. The output is implementation of these algorithms to the CAVER.

Klíčová slova
proteín chemická väzba parciálny náboj vodíkové mostíky Java PDB XML
Zadání práce
Úkolem studenta je seznámit se s oblastí proteinových struktur a zaměřit se zejména na oblast detekce a vybraných charakteristik. Praktickým výstupem práce bude implementace výpočtu zvolených charakteristik, především identifikace vodíkových můstků, násobných vazeb a počítání částečných nábojů. Tyto techniky budou navíc zaintegrovány do aplikace CAVER Viewer, která je ve spolupráci s Loschmidt laboratories vyvíjena v laboratoři HCI. V textové části student popíše zkoumané charakteristiky a postup při jejich implementaci a integraci.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
3. 1. 2013 08:42, RNDr. Ondřej Strnad, Ph.D.
Plný text práce
1,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
6. 2. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Ondřej Strnad, Ph.D.
abs FI MU

Oponent

doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850
KVI FI MU

Literatura

  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338.
  • PETSKO, Gregory A. a Dagmar RINGE. Protein structure and function. London: New Science Press, 2004, xxii, 195. ISBN 0878936637.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Matej Ružôň FI B-AP BcAP qfa8b/6
Dvořáková, A.
24. 4. 2012
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Ružôň, M.
31. 12. 2012
Anotace česky annotation.txt
Ružôň, M.
31. 12. 2012
Klíčová slova keywords.txt
Ružôň, M.
31. 12. 2012
Plný text práce BP_cela.pdf
Ružôň, M.
31. 12. 2012
Posudek oponenta oponent.docx
Kozlíková, B.
24. 1. 2013

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.