Diplomová práce

Evoluce repetitivnich sekvenci v tribu Boechereae (brukvovité)

Repeatome evolution in the tribe Boechereae (Brassicaceae)

Bc. Stanislav Kostiuk, učo 481262
Anotace

Ačkoliv byla repetitivní DNA objevena již v roce 1968, její struktura a role v eukaryotických genomech zůstávala neobjasněnou až do konce dvacátého století. Repetitivní DNA, spolu s ostatními oblastmi genomu, které nekódují proteiny, byla označována jako sobecká DNA, a u rostlin tvoří nejzastoupenější složku genomu. Díky rozvoji metod sekvenování DNA a bioinformatiky se analýza repetitivní složky genomů …více

Abstract

Although repetitive DNA was discovered as soon as in 1968, its structure and role in eukaryotic genomes remained unclear until the end of the twentieth century. Repetitive DNA, along with other non-protein-coding regions of the genome, has been referred to as selfish DNA, and in plants it constitutes the most abundant component of the genome. Thanks to the development of DNA sequencing methods and …více

Klíčová slova
bioinformatická analýza bioinformatic analysis Boechera evoluce genomu genome evolution Hyb-Seq repeatom repeatome repetitivní DNA repetitive DNA
Zadání práce
Rod Boechera (tribus Boechereae, čeleď brukvovitých), blízce příbuzný modelovému rostlinnému druhu Arabidopsis thaliana, obsahuje c. 110 druhů rozšířených především v Severní Americe. Rod Boechera zahrnuje diploidní sexuální stejně jako diploidní a triploidní apomiktické taxony. Jedná se o jediný rod v čeledi brukvovitých, kde se apomixie vyskytuje na diplodní úrovni, proto představuje významný model pro studium apomixie. Je známo, že repetitivní DNA je významným faktorem ovlivňujícím velikost a strukturu rostlinných genomů. Předmětem této diplomové práce je detailní kvalitativní a kvantitativní bioinformatická analýza repeatomů u několika desítek druhů z rodu Boechera a dalších zástupců tribu Boechereae. Cílem této studie je pochopení evoluce repetitivních sekvencí v celém tribu.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
17. 5. 2023 14:01, RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D., učo 64119
Plný text práce
1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
9. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D., učo 64119
Genet ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Lucie Crhák Khaitová, Ph.D., učo 77874
abs PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Molekulární biologie a genetika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.