Diplomová práce

Struktura a funkce monomerních mutantů proteinu 14-3-3zeta

Structure and function of 14-3-3zeta monomeric mutants

Bc. Tomáš Brom, učo 436685
Anotace

Dimerní charakter proteinů 14-3-3 je často stěžejní pro jejich funkci a pro jejich schopnost vázat fosforylované vazebné partnery. 14-3-3 tvoří homo/heterodimery, které jsou v dynamické rovnováze s monomery. Dimerní forma 14-3-3 proteinů byla dobře prostudována, nicméně struktura a funkce monomerní formy zůstávají nedostatečně popsány. Monomerizace 14-3-3ζ proteinu je regulována různými způsoby, včetně …více

Abstract

The dimeric character of 14-3-3 proteins is often crucial for their functions and for their ability to bind phosphorylated binding partners. 14-3-3s form homo/heterodimers that are in dynamic equilibrium with monomers. The dimeric form of 14-3-3 proteins has been heavily studied, however, structure and properties of the monomeric form remain insufficiently described. The monomerization of 14-3-3ζ is …více

Zadání práce
14-3-3 proteiny patří do rodiny regulačních proteinů ovlivňujících biologické procesy u různých eukaryontních organizmů. V současnosti je známo více než 800 proteinů, které se po fosforylaci vážou do proteinu 14-3-3, což následně vede k modulaci jejich aktivity. Protein 14-3-3 dominantně tvoří v nativní formě dimerní strukturu. Nedávné studie ukázali, že i monomerní forma proteinu 14-3-3 zastává v organismu dosud nepopsané funkce. Dimer-monomerní rovnováha může být ovlivněna zavedením vybraných mutací na dimerním rozhraní proteinu 14-3-3. Tato diplomové práce se bude zabývat charakterizací specificky navrhnutých mutantů. Pro popis vlastností navrhnutých konstruktů 14-3-3zeta proteinu budou použity metody X-ray krystalografie, SAXS, nativní elektroforézy a titračních experimentů s fluorescenční detekcí. Student připraví všechny proteiny potřebné pro tento projekt včetně fluorescenčního značení. Diplomová práce může být zpracována v českém nebo anglickém jazyce. Literatura: (1) Sijbesma E., Skora L., Leysen S., Brunsveld L., Koch U., Nussbaumer P., Jahnke W., Ottmann C. Identification of Two Secondary Ligand Binding Sites in 14-3-3 Proteins Using Fragment Screening. Biochemistry 2017 56 (30), 3972-3982 (2) Hritz J.; Byeon I-J.; Krzysiak T.; Martinez A.; Sklenář V.; Gronenborn A.M. Dissection of binding between a phosphorylated tyrosine hydroxylase peptide and 14-3-3zeta: a complex story elucidated by NMR. Biophys. J. 2014, 107, 2185-2194 (3) Jansen S., Melková K., Trošanová Z., Hanáková K., Zachrdla M., Nováček J., Župa E.,Zdráhal Z., Hritz J., Žídek L.: Quantitative Mapping of MAP2c Phosphorylation and 14-3-3zeta Binding Sites Reveals Key Differences Between MAP2c and Tau. J. Biol. Chem. 2017, 292, 6715-6727 (4) Louša P., Nedozrálová H., Župa E., Nováček J., Hritz J.: Phosphorylation of the regulatory domain of human tyrosine hydroxylase 1 monitored using non-uniformly sampled NMR. Biophys. Chem. 2017, 223, 25-29
Práce zkontrolována:
16. 5. 2019 15:25, doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
10. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
ÚChem Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D., učo 63581

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.