Alternativa bakalářské práce: Viktória Kubišová: Racionální návrh peptidů ovlivňujících dimer-monomerní rovnováhu 14-3-3zeta proteinu
Alternativa bakalářské práce
Racionální návrh peptidů ovlivňujících dimer-monomerní rovnováhu 14-3-3zeta proteinu
Rational design of peptides modulating the dimer-monomer equilibrium of the 14-3-3zeta protein
Anotace
14-3-3 proteiny představují centrální regulační uzly v eukaryotických buňkách, které interagují se stovkami fosforylovaných cílových proteinů a podílejí se na regulaci buněčné signalizace, metabolismu, průběhu buněčného cyklu a apoptózy. Deregulace aktivity proteinů 14-3-3 byla spojena s řadou patologických stavů, zejména s nádorovými onemocněními a neurodegenerativními poruchami, jako je Parkinsonova …více
Abstract
14-3-3 proteins are central regulatory hubs in eukaryotic cells which interact with hundreds of phosphorylated client proteins, controlling signalling, metabolism, cell-cycle progression and apoptosis. Dysregulation of 14-3-3 activity has been implicated in several pathological conditions, most notably cancer and neurodegenerative disorders such as Parkinson’s or Alzheimer’s disease. Since the function …více
Zadání alternativy bakalářské práce
14-3-3 proteiny představují centrální regulační uzly v eukaryotických buňkách, které interagují se stovkami fosforylovaných cílových proteinů a podílejí se na regulaci buněčné signalizace, metabolismu, průběhu buněčného cyklu a apoptózy. Deregulace aktivity proteinů 14-3-3 byla spojena s řadou patologických stavů, zejména s nádorovými onemocněními a neurodegenerativními poruchami, jako je Parkinsonova nebo Alzheimerova choroba. Jelikož funkce 14-3-3 proteinů významně závisí na tvorbě stabilního dimeru, představují strategie zaměřené na posun dimer- monomerní rovnováhy slibný způsob modulace aktivity 14-3-3 proteinů.
Tato práce se zaměřuje na racionální návrh krátkého alfa-helikálního peptidu, jehož cílem je podpořit monomerizaci izoformy 14-3-3zeta prostřednictvím kompetitivní vazby na dimerní rozhraní. Peptid bude navržen na základě strukturních informací o klíčových aminokyselinách v dimerním rozhraní proteinu 14-3-3 a s využitím zavedených principů stability alfa-helikální struktury. Pomocí simulací molekulární dynamiky bude studováno chování peptidu v roztoku i v komplexu se 14-3-3 monomerem. Dále budou provedeny experimentální studie za účelem posouzení jeho helikálního obsahu a schopnosti ovlivnit rovnováhu mezi monomerní a dimerní formou 14-3-3.
Klíčová slova: 14-3-3 proteiny; alfa-helikální peptidy; protein-proteinové interakce; molekulová dynamika; FRET
10. 6. 2026 07:39, doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
Citace dle normy ČSN ISO 690
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Vazba Tau proteinu vybranými izoformami 14-3-3 proteinu
Bc. Tadeáš Zoubek -
Úloha strukturní dynamiky při rozpoznání histonového proteinu H3 dimerem HP1 a vhodnost silových polí pro popis jejich interakcí
RNDr. Mgr. Pavlína Pokorná, Ph.D. -
Matematické modelování dimerizace 14-3-3 proteinů
Mgr. Eliška Pirnosová -
Strukturní analýza proteinů 14-3-3 s využitím molekulové dynamiky.
Mgr. Hana Zigová -
Homo- a hetero-dimerizace 14-3-3 proteinů
Mgr. Kateřina Králová, učo 474509 -
Protein–proteinové interakce významné při neurodegenerativních chorobách
Mgr. Petr Louša, Ph.D. -
Struktura a funkce monomerních mutantů proteinu 14-3-3zeta
Mgr. Tomáš Brom, Ph.D., učo 436685 -
Charakteristika interakce izoforem 14-3-3 proteinu s tau proteinem
Mgr. Norbert Gašparik, učo 451748




