Rigorózní práce

Úloha strukturní dynamiky při rozpoznání histonového proteinu H3 dimerem HP1 a vhodnost silových polí pro popis jejich interakcí

Role of structural dynamics in recognition of histone protein H3 by HP1 dimer and ability of force fields to describe their interaction network

Mgr. Pavlína Pokorná
Anotace

Lidský heterochromatinový protein 1 (HP1) je hlavním faktorem ovlivňujícím tvorbu a zachování heterochromatinu. Jeho chormo-shadow doména (CSD) je zodpovědná za tvorbu HP1 homodimerů. HP1(CSD) dimery pak slouží jako molekulární uzly, přechodně vázající různé proteiny. V této práci používám molekulárně dynamické simulace k popisu atomárních detailů interakce mezi HP1(CSD) dimerem a jedním z jeho interakčních …více

Abstract

Human heterochromatin protein 1 (HP1) is a key factor in the formation and maintenance of heterochromatin. Its chromo-shadow domain (CSD) is responsible for HP1 homodimerization. The HP1(CSD) dimer then acts as a hub, transiently binding diverse partner proteins. Here, I use molecular dynamics simulations to analyze atomistic details of interactions between HP1(CSD) dimer and one of its targets, N …více

Klíčová slova
protein-protein interakce molekulová mechanika silové pole molekulová dynamika HP1 protein protein-protein interactions molecular mechanics force field molecular dynamics
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
22. 10. 2019 13:35, prof. RNDr. Petr Skládal, CSc., učo 2202
Plný text práce
13 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
19. 2. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Oponenti

doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci, Křížkovského 511/8, 771 47, Olomouc
doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci, Křížkovského 511/8, 771 47, Olomouc
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biochemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.