Bakalářská práce

Aktivace pseudoexonů v kontextu vzácných dědičných onemocnění

Pseudoexon activation in the context of rare genetic diseases

Kristýna Ehlová
Anotace

V této bakalářské práci se věnuji aktivaci pseudoexonů u lidských genů kódujících proteiny. Pseudoexon je intronová sekvence připomínající exon, která běžně není součástí zralé mRNA. Může však být za určitých okolností aktivována a do zralé mRNA začleněna. Aktivace pseudoexonů je jedním z možných důsledků sestřihových mutací, má potenciál narušit produkci funkčního proteinu a může vést k rozvoji vzácných …více

Abstract

In this thesis I study pseudoexon activation in human protein-coding genes. Pseudoexon is an intronic sequence that resembles exon, which is normally not a part of a mature mRNA. However, it may be under certain circumstances activated and incorporated into the mature mRNA. Pseudoexon activation is one of the possible consequences of splicing mutations, it has potential to disrupt production of functional …více

Zadání práce
Paradigmatem genetické diagnostiky je hodnotit patogenitu bodových mutací v první řadě podle toho, jak tyto mutace ovlivňují kódované aminokyseliny. Mutace však často ovlivňují i jiné kroky genové exprese, které překladu mRNA do struktury proteinu předcházejí, například transkripci, sestřih nebo polyadenylaci primárního transkriptu. Samotné poruchy sestřihu pre-mRNA jsou zodpovědné přibližně za 20 % monogenně dědičných onemocnění. Specifickou kategorií poruch sestřihu je tzv. aktivace pseudoexonu. Po mutaci dochází k exonizaci části intronu, tedy k začlenění původně intronové sekvence do zralé mRNA. Je to jev poměrně vzácný, což ale nemusí být dáno jeho skutečnou raritou, ale spíše nesnadností detekce při běžných genetických vyšetřeních. Ačkoli bylo dosud popsáno okolo sta jednotlivých případů aktivace pseudoexonu, u některých genů se odhaduje jejich frekvence až na 10 % ze všech sestřihových mutací. Projekty v oblasti na výzkumu pseudoexonů by měly pomoci překlenout tento rozdíl a napomoci genetické diagnostice ve vyhledávání a rozpoznávání mutací, které pseudoexony skutečně aktivují. Cílem této bakalářské práce bude shrnout stávající znalosti o pseudoexonech, různé možnosti jejich aktivace a možnosti na pseudoexony cílené terapie u vzácných dědičných onemocnění člověka.
Práce zkontrolována:
13. 5. 2019 15:52, Mgr. Lucie Grodecká, Ph.D., učo 77720
Plný text práce
1008 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Lucie Grodecká, Ph.D., učo 77720
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Diana Grochová, Ph.D.
abs PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.