Diplomová práce

Využití foton-upkonverzních nanočástic v jednomolekulových imunostanoveních

Application of photon-upconversion nanoparticles in single-molecule immunoassays

Bc. Pavel Špaček
Anotace

Diagnostika řady onemocnění je založena na citlivé detekci klinických biomarkerů. Obzvláště důležitá je v případě nádorových onemocnění, kde umožňuje odhalení rakoviny v časném stádiu a sledování průběhu léčby. Díky vysoké specifitě zajištěné protilátkami jsou imunochemické metody stěžejní pro detekci biomarkerů. Konvenční imunochemické značky však často nedosahují dostatečné citlivosti. Foton-upkonverzní …více

Abstract

The diagnosis of numerous diseases relies on the sensitive detection of clinical biomarkers. It is of the utmost importance especially in the case of tumor diseases, allowing for early-stage cancer diagnosis and treatment response monitoring. Due to their high specificity conferred by antibodies, immunochemical assays have proven indispensable for biomarker detection. However, conventional immunoassay …více

Zadání práce

Schopnost detekovat velmi nízké koncentrace analytů má zásadní význam pro včasnou diagnostiku celé řady onemocnění. Například některé rakovinné biomarkery mohou být přítomny v extrémně malých množstvích, což vytváří požadavky na mimořádně citlivé detekční metody. Snaha dosáhnout co nejlepších limitů detekce vedla k vývoji různých formátů tzv. jednomolekulových (digitálních) stanovení. Jednou z možností je digitální ULISA (upconversion-linked immunosorbent assay) stanovení, které kombinuje specifitu protilátek se značkami na bázi foton-upkonverzních nanočástic (UCNPs). Díky schopnosti anti-Stokesovy luminiscence (absorpce dvou nebo více fotonů v infračervené oblasti vedoucí k vyzářením jednoho fotonu v oblasti viditelné) mohou být tyto nanočástice detekovány bez interferencí optického pozadí, což umožňuje jejich počítání pomocí optické mikroskopie. Konjugace UCNPs s vhodnými biorekogničními molekulami, např. protilátkami nebo streptavidinem, tak umožňuje vizualizaci a následné počítání jednotlivých molekul analytu.

Cílem této diplomové práce bude vývoj jednomolekulových imunostanovení využívajících značek založených na UCNPs. Dojde k vývoji a srovnání několika přístupů pro jednomolekulovou detekci, které budou založeny na počítání imunokomplexů (i) na povrchu jamek mikrotitrační destičky, (ii) na magnetických mikročásticích a (iii) volně v roztoku jako komplexy se dvěma UCNP značkami. Práce bude zahrnovat přípravu biokonjugátů, jejich charakterizaci (metody transmisní elektronové mikroskopie, dynamického rozptylu světla a analýzy trajektorie nanočástic) a vývoj a optimalizaci imunostanovení. Jako analyt bude zvolen klinicky relevantní biomarker, např. prostatický specifický antigen, karcinoembryonální antigen nebo protein p53. Nakonec bude praktický potenciál vyvinutých metod ověřen analýzou reálných vzorků, např. krevního séra.

Práce zkontrolována:
15. 5. 2025 09:36, doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D., učo 357740
Plný text práce
14,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
23. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D., učo 357740
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Ing. Jakub Máčala, Ph.D., učo 514003
Nanobio CSB CEITEC MU

Literatura

  • FARKA, Zdeněk; Matthias J. MICKERT; Antonín HLAVÁČEK; Petr SKLÁDAL a Hans H. GORRIS. Single Molecule Upconversion-Linked Immunosorbent Assay with Extended Dynamic Range for the Sensitive Detection of Diagnostic Biomarkers. Analytical Chemistry. Washington, DC: American Chemical Society, 2017, roč. 89, č. 21, s. 11825-11830. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.7b03542.
  • FARKA, Zdeněk; Matthias Jürgen MICKERT; Matěj PASTUCHA; Zuzana MIKUŠOVÁ; Petr SKLÁDAL a Hans-Heiner GORRIS. Advances in Optical Single-Molecule Detection: En Route to Supersensitive Bioaffinity Assays. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim: Wiley-VCH, 2020, roč. 59, č. 27, s. 10746-10773. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/anie.201913924.
  • HLAVÁČEK, Antonín; Zdeněk FARKA; Matthias Jürgen MICKERT; Uliana KOSTIV; Julian BRANDMEIER; Daniel HORÁK; Petr SKLÁDAL; František FORET a Hans-Heiner GORRIS. Bioconjugates of photon-upconversion nanoparticles for cancer biomarker detection and imaging. Nature Protocols. Springer Nature, 2022, roč. 17, April 2022, s. 1028-1072. ISSN 1754-2189. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41596-021-00670-7.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.