Karcinomy v oblasti hlavy a krku jsou celosvětově šestým nejčastějším nádorovým onemocněním. Přibližně 70 % pacientů má pokročilé stádium onemocnění a část z nich (cca 20 %) špatně reaguje na radioterapii či chemoradioterapii. Bylo zjištěno, že bakterie ústní a střevní mikroflóry mohou přispět k terapeutické odpovědi a faktory jimi produkované, mohou ovlivnit výsledný efekt léčby. Navíc recentní publikace ukazují, že zásadní vliv na progresi ale i terapeutickou odpověď má i intratumorální mikrobiom. V této práci sumarizujeme současné poznatky o mikrobiomu a intestinální integritě a jejich významu ve vzniku, progresi a terapii spinocelulárních karcinomů hlavy a krku.