Neurodegenerativní onemocnění jsou spojena s patologickými strukturními změnami několika přirozeně neuspořádaných proteinů (IDP). Absence jedné konkrétní terciální struktury znemožňuje strukturní charakterizaci těchto proteinů pomocí X-ray krystalografie nebo kryoelektronové mikroskopie. Na druhou stranu nukleární magnetická rezonance (NMR) umožňuje strukturní analýzu na úrovni jednotlivých aminokyselin. Hlavním cílem této práce bude strukturní charakterizace vybraných přirozeně neuspořádaných proteinů pomocí NMR s využitím metody neuniformního vzorkování při měření některých experimentů. Zaměříme se hlavně na protein tau, který hraje klíčovou úlohu v Alzheimerově nemoci. Budeme analyzovat sklony k zaujmutí určité sekundární struktury, v některých oblastech proteinu, z naměřených chemických posunů, dále také konformační preference s použitím paramagnetického značení proteinu. Nakonec se zaměříme na strukturní změny tau způsobené vybranými postranslačními modifikacemi nebo interakcí s proteiny z rodiny 14-3-3. Diplomová práce může být vypracovaná v českém, slovenském, nebo anglickém jazyce. Literatura: Lippens, G., and Gigant, B. Elucidating Tau function and dysfunction in the era of cryo-EM. J. Biol. Chem. 2019, 294, 9316–9325. Přecechtělová, J.; Mládek, A.; Zapletal, V.; Hritz, J.: Quantum Chemical Calculations of NMR Chemical Shifts in Phosphorylated Intrinsically Disordered Proteins, JCTC 2019, 15, 5642-5658. Melková, K.; Zapletal, V.; Jansen, S.; Nomilner, E.; Zachrdla, M.; Hritz, J.; Novácek, J.; Zweckstetter, M.; Ringkjøbing-Jensen, M.; Blackledge, M. and Žídek, L.: Functionally specific binding regions of microtubule-associated protein 2c exhibit distinct conformations and dynamics. J. Biol. Chem. 2018, 293, 13297-13309. Jansen, S.; Melková, K.; Trošanová, Z.; Hanáková, K.; Zachrdla, M.; Nováček, J.; Župa, E.; Zdráhal, Z.; Hritz, J.; Žídek, L.: Quantitative Mapping of MAP2c Phosphorylation and 14-3-3z Binding Sites Reveals Key Differences Between MAP2c and Tau. J. Biol. Chem. 2017, 292, 6715-6727 Motáčková, V., Nováček, J., Zawadzka-Kazimierczuk, A., Kazimierczuk, K., Žídek, L., Šanderová, H., Krásný, L., Koźmiński, W., and Sklenář, V. Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments. J. Biomol. NMR 2010, 48, 169–177.