Bi6710 Taxonomie patogenních bakterií

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021
Rozsah
1/0/0. 1 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 1. 3. až Pá 14. 5. St 17:00–17:50 online_B1
Předpoklady
C3580 Biochemie && ( Bi4020 Molekulární biologie || NOW( Bi4020 Molekulární biologie )) && ( Bi4090 Obecná mikrobiologie || NOW( Bi4090 Obecná mikrobiologie )) && ! Bi6700 Taxonomie prokar.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Limitujici je kapacita cvicebny
Mateřské obory/plány
Anotace
V rámci kurzu se studenti seznámí se základními pojmy z oblasti taxonomie bakterií. Absolventi kurzu budou schopni orientace v současné klasifikaci, nomenklatuře a identifikaci bakterií (doména Bacteria) významných v humánní klinické mikrobiologii.
Výstupy z učení
Na základě získaných poznatků budou absolventi schopni interpretovat údaje získané při typizaci a identifikaci bakteriálních izolátů a tyto zařadit v rámci fylogenetického systému mikroorganismů.
Klíčová témata
V první části kurzu budou probrány základní pojmy z oboru taxonomie bakterií (klasifikace, nomenklatura a identifikace) a dále budou zmíněny aktuální metodické přístupy k popisu bakteriálních druhů a jejich fylogenetického členění do vyšších taxonů (1 přednáška). V následující části kurzu bude podrobně zmíněna taxonomie rodů a druhů bakterií významných z pohledu humánní klinické mikrobiologie. Kurz bude zaměřen především na zástupce kmenů Proteobacteria (5 přednášek), Firmicutes (3 přednášky), Actinobacteria (3 přednášky) a další klinicky významné skupiny (1 přednáška).
Studijní zdroje a literatura
    doporučená literatura
  • SEDLÁČEK, Ivo. Taxonomie prokaryot. Illustrated by Petr Ondrovčík. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2007, 270 s. ISBN 8021042079. info
  • Garrity, G.M., Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T. (eds.). 2005. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Two. The Proteobacteria. Part A Introductory Essays. Springer, USA.
  • Garrity, G.M., Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T. (eds.). 2005. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Two. The Proteobacteria. Part B The Gammaproteobacteria. Springer, USA.
  • Garrity, G.M., Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T. (eds.). 2005. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Two. The Proteobacteria. Part C The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. Springer, USA.
  • De Vos, P., Garrity, G.M., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.H., Whitman, W.B. (eds.). 2009. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Three. The Firmicutes. Springer, USA.
  • Whitman, W., Goodfellow, M., Kampfer, P., Busse, H.-J., Trujillo, M. E., Ludwig, W., Suzuki,K.-i., Parte, A. (eds.). 2012. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Five. The Actinobacteria. Part A. Springer, USA.
  • Whitman, W., Goodfellow, M., Kampfer, P., Busse, H.-J., Trujillo, M. E., Ludwig, W., Suzuki,K.-i., Parte, A. (eds.). 2012. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Five. The Actinobacteria. Part B. Springer, USA.
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
přednášky
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Kurz je ukončen formou online pohovoru prostřednictvím aplikace Microsoft Teams.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
jaro 2021 - přednášky budou realizovány online.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025, jaro 2026.