Bi9061 Bioinformatika - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2009
Rozsah
0/1/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)
Mgr. Eva Šebestová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie - Biologická sekce - Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi9061/01: St 16:00–17:50 COMPK6,609, J. Damborský, E. Šebestová
Bi9061/02: St 9:00–10:50 COMPK6,609, J. Damborský, E. Šebestová
Předpoklady
( NOW ( Bi9060 Bioinformatics ) || NOW ( Bi5000 Úvod do bioinformatiky )) && ! C9081 Bioinformatics - practice
ability to study in English
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 60 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/60, pouze zareg.: 0/60, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/60
Mateřské obory
předmět má 14 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
In practical part of the Bioinformatics course we will demonstrate a number of the programs on the Internet that are used most commonly in DNA and proteomic research.
Osnova
  • I. INTRODUCTION
  • II. INFORMATION NETWORKS
  • III. PROTEIN INFORMATION RESOURCES
  • IV. GENOME INFORMATION RESOURCES
  • V. DNA SEQUENCE ANALYSIS
  • VI. PAIRWISE SEQUENCE ALIGNMENT
  • VII. MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT
  • VIII. SECONDARY DATABASE SEARCHING
  • IX. ANALYSIS PACKAGES
  • X. PROTEIN STRUCTURE MODELLING
Literatura
  • Introduction to Bioinformatics, T.K. Attwood & D.J. Parry-Smith, Longman, Essex, 1999.
Výukové metody
class discussion, group projects
Metody hodnocení
Written test: 50 questions Oral examination: practical (in Czech or in English)
Navazující předměty
Informace učitele
http://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/loadframe.html?courses.html
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2008, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018.