Bi9061 Bioinformatika - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučující
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)
doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Eva Šebestová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie - Biologická sekce - Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi9061/01: Čt 10:00–11:50 A9-316, J. Damborský, R. Pantůček, E. Šebestová
Bi9061/02: Čt 12:00–13:50 A9-316, J. Damborský, R. Pantůček, E. Šebestová
Bi9061/03: Čt 16:00–17:50 A9-316, J. Damborský, R. Pantůček, E. Šebestová
Předpoklady
NOW ( Bi9060 Bioinformatika II ) && NOW ( Bi5000 Bioinformatika I ) && ! C9081 Bioinformatics - practice
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 60 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/60, pouze zareg.: 0/60
Mateřské obory
předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
In practical part of the Bioinformatics course we will demonstrate a number of the programs on the Internet that are used most commonly in DNA and proteomic research.
Osnova
  • I. INTRODUCTION
  • II. INFORMATION NETWORKS
  • III. PROTEIN INFORMATION RESOURCES
  • IV. GENOME INFORMATION RESOURCES
  • V. DNA SEQUENCE ANALYSIS
  • VI. PAIRWISE SEQUENCE ALIGNMENT
  • VII. MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT
  • VIII. SECONDARY DATABASE SEARCHING
  • IX. ANALYSIS PACKAGES
  • X. PROTEIN STRUCTURE MODELLING
Literatura
  • Introduction to Bioinformatics, T.K. Attwood & D.J. Parry-Smith, Longman, Essex, 1999.
Výukové metody
class discussion, group projects
Metody hodnocení
Written test: 50 questions Oral examination: practical
Navazující předměty
Informace učitele
http://loschmidt.chemi.muni.cz/bioinf
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018.