FB820 Strukturní elektronová mikroskopie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2022
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
Mgr. Jiří Nováček, Ph.D. (přednášející)
Dr. Tanvir Shaikh (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Znalosti matematiky a fyziky na středoškolské úrovni
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Anotace
Kurz nabízí úvod do elektronové mikroskopie pro strukturní biologii a vědy o živé přírodě.
Zahrnuje anatomii elektronového mikroskopu, princip tvorby obrazu a úvod do metod přípravy vzorků pro elektronovou mikroskopii. Studenti získají poznatky o analýze obrazů z kryoelektronové mikroskopie, o jednočásticové analýze a elektronové tomografii.
Klíčová témata
    • 1. Historie elektronové mikroskopie, aplikace a současné trendy
    • 2. Uspořádání elektronového mikroskopu a princip vytváření obrazu
    • 3. Transmisní a skenovací mikroskopie
    • 4. Metody přípravy vzorku
    • 5. Negativní barvení a a kryoelektronová mikroskopie makromolekulárních systémů
    • 6. Fourierova transformace
    • 7. Vzorkování a multivariantní analýza
    • 8. Jednočásticová analýza
    • 9. 3D reknostrukční metody
    • 10. Rozlišení a statistika
    • 11. Elektronová tomografie
    • 12. Interpretace EM dat ve strukturní biologii
    • 13. Korelativní přístupy
Studijní zdroje a literatura
  • Annie Cavalier, Daniele Spehner, Bruno M. Humbel: Handbook of Cryo-Preparation Methods for Electron Microscopy (Methods in Visualization), CRC Press; 1st Ed., 2008
  • R. A Crowther: The Resolution Revolution: Recent Advances In cryoEM, Volume 579 (Methods in Enzymology) 1st Edition, Academic Press, 2016
  • John Kuo: Electron Microscopy: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology), Humana Press; 3rd ed. 2014
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Písemná zkouška
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2023, podzim 2024, podzim 2025, podzim 2026.