FB820 Strukturní elektronová mikroskopie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2023
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
Ing. Tibor Füzik, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jiří Nováček, Ph.D. (přednášející)
Ing. Ondřej Sháněl, Ph.D. (přednášející), Ing. Tibor Füzik, Ph.D. (zástupce)
Garance
Mgr. Jiří Nováček, Ph.D.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Znalost angličtiny, matematiky a fyziky na středoškolské úrovni
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
Kurz nabízí úvod do elektronové mikroskopie pro strukturní a buněčnou biologii. Studenti získají praktické znalosti orientované na pochopení problematiky přípravy vzorku, principu funkce elektronového mikroskopu, metod měření a analýzy dat.
Výstupy z učení
Absolvování předmětu studenti získají:
- pochopení principů fungování elektronového mikroskopu
- pochopení principů formování obrazu v el. mikroskopii
- schopnost shodnocení vhodnosti použití elektronové mikroskopie pro řešení problému v biologickém výzkumu
- pochopení způsobů analýzy dat
Osnova
  • 1. Interakce elektronu s hmotou
  • 2. Anatomie elektronového mikroskopu
  • 3. Principy formování obrazu
  • 4. Příprava vzorků pro el. mikroskopii ve vědách o živé přírodě
  • 5. Fourierova transformace
  • 6. Metody 3D el.mik.
  • 7. single particle analysis
  • 8. Elektronová tomografie
  • 9. Interpretace dat
Literatura
    doporučená literatura
  • Annie Cavalier, Daniele Spehner, Bruno M. Humbel: Handbook of Cryo-Preparation Methods for Electron Microscopy (Methods in Visualization), CRC Press; 1st Ed., 2008
  • R. A Crowther: The Resolution Revolution: Recent Advances In cryoEM, Volume 579 (Methods in Enzymology) 1st Edition, Academic Press, 2016
  • John Kuo: Electron Microscopy: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology), Humana Press; 3rd ed. 2014
Výukové metody
Přednášky, diskuze
Metody hodnocení
Semestrální práce, písemná zkouška
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2024.