Masarykova univerzita

Výpis publikací

česky | in English

Filtrování publikací

    2023

    1. Dicer structure and function: conserved and evolving features
      ZAPLETAL, David, Karel KUBÍČEK, Petr SVOBODA a Richard ŠTEFL. Dicer structure and function: conserved and evolving features. EMBO reports. Wiley, 2023, roč. 24, č. 7, s. 1-13. ISSN 1469-221X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15252/embr.202357215.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00132893 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, David (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Dicer; dsRBD; helicase; miRNA; siRNA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 11. 9. 2024 10:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2358654/cs
    2. Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase
      PAPAGEORGIOU, Anna, Michaela POSPÍŠILOVÁ, Jakub CIBULKA, Raghib ASHRAF, Christopher WAUDBY, Pavel KADEŘÁVEK, Volha MAROZ, Karel KUBÍČEK, Zbyněk PROKOP, Lumír KREJČÍ a Konstantinos TRIPSIANES. Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase. Nature Communications. Berlin: Nature, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-19. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-42503-z.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00134740 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Papageorgiou, Anna (300 Řecko, domácí) -- Pospíšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Cibulka, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Ashraf, Raghib (356 Indie, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Maroz, Volha (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Biomolecular polyelectrolyte complexes; DNA helicase Q4; G-quadruplexes; intrinsically disordered regions; RPA protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:27.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2344400/cs

    2022

    1. Cooperation between intrinsically disordered and ordered regions of Spt6 regulates nucleosome and Pol II CTD binding, and nucleosome assembly
      KASILIAUSKAITE, Aiste, Karel KUBÍČEK, Tomáš KLUMPLER, Martina ZÁNOVÁ, David ZAPLETAL, Eliska KOUTNA, Jiří NOVÁČEK a Richard ŠTEFL. Cooperation between intrinsically disordered and ordered regions of Spt6 regulates nucleosome and Pol II CTD binding, and nucleosome assembly. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2022, roč. 50, č. 10, s. 5961-5973. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkac451.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00127507 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kasiliauskaite, Aiste (440 Litva, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Zánová, Martina (703 Slovensko, domácí) -- Zapletal, David (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase II; transcription elongation factor; transcription elongation factor Spt6; unclassified drug
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 14:23.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2240862/cs
    2. Cryo-EM reveals the structural basis for the regulatory function of HEL1 domain in vertebrate DICERs
      ZAPLETAL, David, Karel KUBÍČEK, Martina ZÁNOVÁ, Radek MALIK, Marek ŠEBESTA, Jiří NOVÁČEK, Petr SVOBODA a Richard ŠTEFL. Cryo-EM reveals the structural basis for the regulatory function of HEL1 domain in vertebrate DICERs. In Instruct Biennial Structural Biology ConferenceMuntgebouw, Utrecht, The Netherlands | 19-20 May, 2022. 2022.
      Název česky: Cryo-EM odhaluje strukturní podstatu regulační funkce HEL1 domény DICERu v obratlovcích
      RIV/00216224:14310/22:00126100 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
      Zapletal, David (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Zánová, Martina (703 Slovensko) -- Šebesta, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Svoboda, Petr (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Dicer; RNA interference; RNAi; miRNA; siRNA
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 10. 3. 2023 13:38.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1862096/cs
    3. Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer
      ZAPLETAL, David, Eliska TABORSKA, Josef PASULKA, Radek MALIK, Karel KUBÍČEK, Martina ZÁNOVÁ, Christian MUCH, Marek ŠEBESTA, Valeria BUCCHERI, Filip HORVAT, Irena JENICKOVA, Michaela PROCHAZKOVA, Jan PROCHAZKA, Matyáš PINKAS, Jiří NOVÁČEK, Diego F JOSEPH, Radislav SEDLACEK, Carrie BERNECKY, Donal CARROLL, Richard ŠTEFL a Petr SVOBODA. Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer. Molecular Cell. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2022, roč. 82, č. 21, s. 4064-4079. ISSN 1097-2765. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2022.10.010.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128561 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Zapletal, David (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Zánová, Martina (703 Slovensko, domácí) -- Šebesta, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Pinkas, Matyáš (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CRYO-EM STRUCTUREGUIDE STRAND SELECTIONRNA-BINDINGSTRUCTURE VALIDATIONTRBP COMPLEXMOUSEEXPRESSIONMOLPROBITYSPECIFICITYRECOGNITION
      CHYBA! Počet stran neodpovídá počtu stran uvedenému ve WoS. '16' => '30' CHYBA!
      CHYBA! Počet stran neodpovídá počtu stran uvedenému ve WoS. '16' => '30'
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2023 20:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2252813/cs

    2020

    1. Recognition of RNA Polymerase II C-terminal domain by RPRD2
      LINHARTOVÁ, Kateřina, Jakub MACOŠEK, Veronika JANŠTOVÁ, Eliška ŠMIŘÁKOVÁ, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Recognition of RNA Polymerase II C-terminal domain by RPRD2. In CEITEC PhD Conference. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118409 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Linhartová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Macošek, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Janštová, Veronika (203 Česká republika) -- Šmiřáková, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA Polymerase II C-terminal domain; RPRD2
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 3. 2021 14:47.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1753038/cs
    2. Termination of non-coding transcription in yeast relies on both an RNA Pol II CTD interaction domain and a CTD-mimicking region in Sen1
      HAN, Z., Olga JASNOVIDOVA, N. HAIDARA, A. TUDEK, Karel KUBÍČEK, D. LIBRI, Richard ŠTEFL a O. PORRUA. Termination of non-coding transcription in yeast relies on both an RNA Pol II CTD interaction domain and a CTD-mimicking region in Sen1. EMBO Journal. Hoboken (USA): WILEY-BLACKWELL, 2020, roč. 39, č. 7, s. 101548-101569. ISSN 0261-4189. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15252/embj.2019101548.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114181 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Jasnovidova, Olga (233 Estonsko, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: non-coding transcription; pervasive transcription; RNA polymerase II CTD; Sen1 helicase; transcription termination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2021 18:50.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1662605/cs
    3. Yeast Spt6 Reads Multiple Phosphorylation Patterns of RNA Polymerase II C-Terminal Domain In Vitro
      BRÁZDA, Pavel, Magdaléna KREJČÍKOVÁ, Aiste KASILIAUSKAITE, Eliška ŠMIŘÁKOVÁ, Tomáš KLUMPLER, Robert VÁCHA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Yeast Spt6 Reads Multiple Phosphorylation Patterns of RNA Polymerase II C-Terminal Domain In Vitro. Journal of Molecular Biology. Academic Press, 2020, roč. 432, č. 14, s. 4092-4107. ISSN 0022-2836. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2020.05.007.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114180 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brázda, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krejčíková, Magdaléna (203 Česká republika, domácí) -- Kasiliauskaite, Aiste (440 Litva, domácí) -- Šmiřáková, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CTD; RNA polymerase II; Spt6; NMR structure; phosphorylation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 17. 10. 2024 11:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1662603/cs

    2019

    1. Efficient and robust preparation of tyrosine phosphorylated intrinsically disordered proteins
      BRÁZDA, Pavel, Ondrej ŠEDO, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Efficient and robust preparation of tyrosine phosphorylated intrinsically disordered proteins. BioTechniques. UNITED HOUSE, 2 ALBERT PL, LONDON N3 1QB: FUTURE SCI LTD, 2019, roč. 67, č. 1, s. 16-22. ISSN 0736-6205. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.2144/btn-2019-0033.
      URL
      Název anglicky: Efficient and robust preparation of tyrosine phosphorylated intrinsically disordered proteins
      RIV/00216224:14740/19:00107820 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brázda, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: C-terminal domain; co-expression; CTD; IDP; intrinsically disordered proteins; phosphorylation; purification; RNA polymerase II; TRANSCRIPTION TERMINATION; LARGEST SUBUNIT; CELL-CYCLE; KINASE; STRATEGIES; SEMISYNTHESIS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 14. 10. 2024 13:09.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1585263/cs
    2. Treatment of Surface Plasmon Resonance (SPR) Background in Total Internal Reflection Ellipsometry: Characterization of RNA Polymerase II Film Formation
      HEMZAL, Dušan, Yu Ri KANG, Jan DVOŘÁK, Tomasz KABZINSKI, Karel KUBÍČEK, Kim YOUNG DONG a Josef HUMLÍČEK. Treatment of Surface Plasmon Resonance (SPR) Background in Total Internal Reflection Ellipsometry: Characterization of RNA Polymerase II Film Formation. APPLIED SPECTROSCOPY. Thousand Oaks: SAGE PUBLICATIONS INC, 2019, roč. 73, č. 3, s. 261-270. ISSN 0003-7028. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1177/0003702819826280.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00107427 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Hemzal, Dušan (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kabzinski, Tomasz (616 Polsko, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Humlíček, Josef (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Spectroscopic ellipsometry; surface plasmon resonance; SPR; total internal reflection ellipsometry; TIRE; RNA polymerase II; C-terminal domain; CTD; Rtt103 protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 4. 3. 2020 14:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1535338/cs

    2017

    1. Structural insight into recognition of phosphorylated threonine-4 of RNA polymerase II C-terminal domain by Rtt103p
      JASNOVIDOVA, Olga, Magdaléna KREJČÍKOVÁ, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Structural insight into recognition of phosphorylated threonine-4 of RNA polymerase II C-terminal domain by Rtt103p. EMBO reports. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2017, roč. 18, č. 6, s. 906-913. ISSN 1469-221X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15252/embr.201643723.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094697 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Jasnovidova, Olga (233 Estonsko, domácí) -- Krejčíková, Magdaléna (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; RNA processing; RNAPII CTD code; structural biology
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 2. 2018 13:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1376840/cs
    2. Structure and dynamics of the RNAPII CTDsome with Rtt103
      JASNOVIDOVA, Olga, Tomáš KLUMPLER, Karel KUBÍČEK, Sergei KALYNYCH, Pavel PLEVKA a Richard ŠTEFL. Structure and dynamics of the RNAPII CTDsome with Rtt103. Proceeding of the National Academy of Sciences of the USA. The Academy, 2017, roč. 114, č. 42, s. 11133-11138. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1712450114.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095104 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Jasnovidova, Olga (233 Estonsko, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Kalynych, Sergei (124 Kanada, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CTDsome; SAXS; NMR; X ray; Rtt103; RNA Polymerase II
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2018 15:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1393597/cs

    2016

    1. Combining NMR (Nuclear Magnetic Resonance) and Raman spectroscopy reveals structural and functional features of a new cisplatin derivative
      KREJČÍKOVÁ, Magdaléna, Konstantinos GKIONIS, Dušan HEMZAL, JA PLATTS, P PAPADIA, N MARGIOTTA, J SPONER a Karel KUBÍČEK. Combining NMR (Nuclear Magnetic Resonance) and Raman spectroscopy reveals structural and functional features of a new cisplatin derivative. 2016.
      angličtina.
      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 5. 5. 2022 12:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373319/cs
    2. Recognition of phosphorylated threonine-4 of RNA polymerase II C-terminal domain by 3 '-end processing apparatus
      JASNOVIDOVA, Olga, Magdaléna KREJČÍKOVÁ, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Recognition of phosphorylated threonine-4 of RNA polymerase II C-terminal domain by 3 '-end processing apparatus. In 41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life. 2016. ISSN 1742-464X.
      RIV/00216224:14740/16:00096392 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Jasnovidova, Olga (233 Estonsko, domácí) -- Krejčíková, Magdaléna (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR ; RNA processing; RNAPII; CTD code; structural biology; phosphorylation; Rtt103p
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 8. 11. 2017 16:29.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1376987/cs
    3. What are the key aspects of interaction between RNA polymerase II C-terminal domain phosphorylated on tyrosine-1 and the elongation factors
      KUBÍČEK, Karel, Magdaléna KREJČÍKOVÁ, Pavel BRÁZDA, Eliška ŠMIŘÁKOVÁ, Jiří NOVÁČEK, Patrick CRAMER a Richard ŠTEFL. What are the key aspects of interaction between RNA polymerase II C-terminal domain phosphorylated on tyrosine-1 and the elongation factors. In 41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life. 2016. ISSN 1742-464X.
      RIV/00216224:14740/16:00096391 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Krejčíková, Magdaléna (203 Česká republika, domácí) -- Brázda, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Šmiřáková, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Cramer, Patrick (276 Německo) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase II; CTD; tSH2 Spt6; elongation factor; structural biology; NMR; transcription
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 9. 11. 2017 09:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1376986/cs

    2015

    1. Accurate Fitting SAXS Curves with NMR Structure Ensembles
      KŘENEK, Aleš, Karel KUBÍČEK, Richard ŠTEFL a Jiří FILIPOVIČ. Accurate Fitting SAXS Curves with NMR Structure Ensembles. Online. In Simon Lin, Vicky Huang. Proceedings of International Symposium on Grids and Clouds 2015. Pissa: Proceedings of Science, 2015, s. nestránkováno, 9 s. ISSN 1824-8039.
      URL
      Název anglicky: Accurate Fitting SAXS Curves with NMR Structure Ensembles
      RIV/00216224:14610/15:00083645 Stať ve sborníku. Biochemie. angličtina.
      Křenek, Aleš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: saxs; nmr; ensamble fit
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Alena Mokrá, učo 362754. Změněno: 27. 4. 2018 14:31.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1309251/cs
    2. Biological Small Angle X-ray Scattering at CEITEC-MU
      KLUMPLER, Tomáš, Tereza GERGURI, Olga JASNOVIDOVA, Lumír KREJČÍ, Karel KUBÍČEK, Daniel NĚMEČEK, Vojtěch SEDLÁČEK a Richard ŠTEFL. Biological Small Angle X-ray Scattering at CEITEC-MU. Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. Praha: Krystalografická společnost, 2015, roč. 22, č. 3, s. 127-132. ISSN 1211-5894.
      URL
      Název česky: Biologický maloúhlý rentgenový rozptyl v CEITEC-MU
      Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: saxs, biosaxs, ceitec, services
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 15. 4. 2016 08:54.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1310370/cs
    3. Revisiting the role of TRF2 basic domain in chromatin maintenance with the most recent structural and functional approaches
      NEČASOVÁ, Ivona, Tomáš KLUMPLER, Karel KUBÍČEK a Ctirad HOFR. Revisiting the role of TRF2 basic domain in chromatin maintenance with the most recent structural and functional approaches. In EMBO Workshop Telomeric chromatin and telomere fragility. 2015.
      Změnila: Mgr. Ivona Nečasová, Ph.D., učo 175190. Změněno: 24. 6. 2016 15:38.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1348338/cs

    2014

    1. Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation
      TUDEK, Agnieszka, Odil Porrua FUERTE, Tomasz KABZINSKI, Michael LIDSCHREIBER, Karel KUBÍČEK, Andrea FOŘTOVÁ, Francoise LACROUTE, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Patrick CRAMER, Richard ŠTEFL a Domenico LIBRI. Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation. Molecular Cell. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2014, roč. 55, č. 3, s. 467-481. ISSN 1097-2765. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.031.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073613 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Tudek, Agnieszka (250 Francie) -- Fuerte, Odil Porrua (724 Španělsko) -- Kabzinski, Tomasz (616 Polsko, domácí) -- Lidschreiber, Michael (276 Německo) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Lacroute, Francoise (250 Francie) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Cramer, Patrick (276 Německo) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí) -- Libri, Domenico (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: CRYPTIC UNSTABLE TRANSCRIPTS; POLYMERASE-II TRANSCRIPTS; BINDING PROTEINS NRD1; QUALITY-CONTROL; SACCHAROMYCES-CEREVISIAE; PERVASIVE TRANSCRIPTION; BIDIRECTIONAL PROMOTERS; POLY(A) POLYMERASE; NUCLEAR EXOSOME; TRAMP COMPLEX
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 29. 10. 2014 09:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1182103/cs
    2. Structure and semi-sequence-specific RNA binding of Nrd1
      BAČÍKOVÁ, Veronika, Josef PASULKA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Structure and semi-sequence-specific RNA binding of Nrd1. Nucleic Acids Research. United Kingdom: Oxford University Press, 2014, roč. 42, č. 12, s. 8024-8038. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku446.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073612 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bačíková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: protein Nrd1; RNA; untranslated RNA; fluorescence analysis; RNA processing; transcription termination; RNA surveillance; RNA recognition motif
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 3. 12. 2014 10:24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1182096/cs

    2012

    1. In vivo SELEX reveals novel sequence and structural determinants of Nrd1-Nab3-Sen1 dependent transcription termination
      PORRUA-FUERTE, Odil, Fruzsina HÓBOR, Jocelyne BOULAY, Karel KUBÍČEK, Yves D’AUBENTON-CARAFA, Rajani Kanth GUDIPATI, Richard ŠTEFL a Domenico LIBRI. In vivo SELEX reveals novel sequence and structural determinants of Nrd1-Nab3-Sen1 dependent transcription termination. EMBO Journal. NEW YORK: NATURE PUBLISHING GROUP, 2012, roč. 31, č. 19, s. 3935-3948. ISSN 0261-4189. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/emboj.2012.237.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00057509 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Porrua-Fuerte, Odil (724 Španělsko) -- Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Boulay, Jocelyne (250 Francie) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- D’Aubenton-Carafa, Yves (250 Francie) -- Gudipati, Rajani Kanth (250 Francie) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí) -- Libri, Domenico (250 Francie, garant)
      Klíčová slova anglicky: cryptic unstable transcripts; transcription termination; Nrd1p-Nab3p-Sen1p complex; hidden transcription; transcriptional insulators
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 11. 4. 2013 08:10.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988334/cs
    2. NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      BYSTRICKÝ, Peter, Marie POKORNÁ, Karel KUBÍČEK, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS. In 2nd EAST NMR Young Investigator's meeting. 2012.
      Název anglicky: NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      RIV/00216224:14740/12:00061756 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Slovensko.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Recenzováno: ano
      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 5. 11. 2012 16:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1072360/cs
    3. Platinum-DNA interstrand crosslinks: Molecular determinants of bending and unwinding of the double helix.
      SUCHÁNKOVÁ, Tereza, Karel KUBÍČEK, Jana KAŠPÁRKOVÁ, Viktor BRABEC a Jiří KOZELKA. Platinum-DNA interstrand crosslinks: Molecular determinants of bending and unwinding of the double helix. Journal of Inorganic Biochemistry. New York, USA: Elsevier Science Inc, 2012, roč. 108, č. 1, s. 69-79. ISSN 0162-0134. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2011.09.025.
      RIV/00216224:14310/12:00057206 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Suchánková, Tereza (203 Česká republika) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Kašpárková, Jana (203 Česká republika) -- Brabec, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Kozelka, Jiří (250 Francie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Anticancer drugs; Cisplatin; DNA binding; Interstrand crosslinks; Lone pair-pi interactions; Molecular dynamics simulations
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 11. 4. 2013 14:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/955330/cs
    4. RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY
      BYSTRICKÝ, Peter, Marie POKORNÁ, Karel KUBÍČEK, Michaela WIMMEROVÁ a Lukáš ŽÍDEK. RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY. In 26th Intenational Carbohydrate Symposium 2012 abstracts. 2012.
      Název anglicky: RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY
      RIV/00216224:14740/12:00061753 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Španělsko.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano
      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 5. 11. 2012 15:54.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1072349/cs
    5. Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3
      ŠIKORSKÝ, Tomáš, Fruzsina HÓBOR, Eva KRIŽANOVÁ, Josef PASULKA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2012, roč. 40, č. 22, s. 11748-11755. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gks929.
      URL
      Název česky: Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3
      Název anglicky: Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3
      RIV/00216224:14740/12:00057639 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Šikorský, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Križanová, Eva (703 Slovensko, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: tudor; assymetric dimethylarginine; histone; C-terminal domain of RNA polymerase II; recognition mark; nuclear magnetic resonance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 4. 2013 08:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1068202/cs
    6. Serine phosphorylation and proline isomerization in RNAP II CTD control recruitment of Nrd1
      KUBÍČEK, Karel, Hana ČERNÁ, Peter HOLUB, Josef PASULKA, Dominika HROŠŠOVÁ, Frank LOEHR, Ctirad HOFR, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. Serine phosphorylation and proline isomerization in RNAP II CTD control recruitment of Nrd1. Genes & Development. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012, roč. 26, č. 17, s. 1891-1896. ISSN 0890-9369. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1101/gad.192781.112.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00057508 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Černá, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Holub, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Hroššová, Dominika (703 Slovensko, domácí) -- Loehr, Frank (276 Německo) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase II; CTD code; phosphorylation; proline isomerization; RNA processing and degradation; NMR spectroscopy; structure
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 7. 4. 2013 04:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988332/cs

    2011

    1. NMR STUDY OF INTERACTIONS OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN
      BYSTRICKÝ, Peter, Karel KUBÍČEK, Marie POKORNÁ, Radovan FIALA a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY OF INTERACTIONS OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů Sborník příspěvků. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.
      Název anglicky: NMR STUDY OF INTERACTIONS OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN
      RIV/00216224:14740/11:00053905 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano
      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 3. 4. 2012 14:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957992/cs
    2. NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      BYSTRICKÝ, Peter, Karel KUBÍČEK, Marie POKORNÁ, Radovan FIALA a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS. In EuroCarb 2011 abstracts. 2011.
      Název anglicky: NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      RIV/00216224:14740/11:00053389 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Itálie.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano
      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 3. 4. 2012 14:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/952474/cs
    3. NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      BYSTRICKÝ, Peter, Karel KUBÍČEK, Marie POKORNÁ, Radovan FIALA a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS. 2011. ISBN 978-80-86313-34-4.
      Název česky: NMR studium lektinovych interakcii RALSTONIA SOLANACEARUM
      Název anglicky: NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 13. 2. 2013 13:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1086757/cs
    4. Recognition of transcription termination signal by the nuclear polyadenylated RNA-binding (Nab)3 protein
      HÓBOR, Fruzsina, Roberto PERGOLI, Karel KUBÍČEK, Dominika HROŠŠOVÁ, Veronika BAČÍKOVÁ, Michal ZIMMERMANN, Josef PASULKA, Ctirad HOFR, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. Recognition of transcription termination signal by the nuclear polyadenylated RNA-binding (Nab)3 protein. The Journal of Biological Chemistry. Am. Soc. for Biochem. and Mol. Biol., 2011, roč. 286, č. 5, s. 3645-3657. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M110.158774.
      RIV/00216224:14740/11:00049398 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Pergoli, Roberto (380 Itálie, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Hroššová, Dominika (703 Slovensko, domácí) -- Bačíková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Zimmermann, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; Protein structure; RNA processing; RNA-protein interaction; Transcription termination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 3. 2012 05:35.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/907969/cs
    5. Using NMR spectroscopy for improvement of cisplatin-based drugs
      ŠMIŘÁKOVÁ, Eliška, Paride PAPADIA, Fabio ARNESANO, Giovanni NATILE, Karel KUBÍČEK a Jiří KOZELKA. Using NMR spectroscopy for improvement of cisplatin-based drugs. In Instruments and methods for biology and medicine 2011. 2011. ISBN 978-80-01-04915-0.
      Název anglicky: Using NMR spectroscopy for improvement of cisplatin-based drugs
      RIV/00216224:14310/11:00069209 Konferenční abstrakt. Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Šmiřáková, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Papadia, Paride (380 Itálie) -- Arnesano, Fabio (380 Itálie) -- Natile, Giovanni (380 Itálie) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Kozelka, Jiří (250 Francie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cisplatin; nuclear magnetic resonance; molecular dynamics simulations
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eliška Šmiřáková, učo 269953. Změněno: 9. 9. 2013 10:35.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1121727/cs
    6. 1H, 13C, and 15N resonance assignments for the CTD-Interacting Domain of Nrd1 bound to Ser5-phosphorylated CTD of RNA Polymerase II
      KUBÍČEK, Karel, Josef PASULKA, Hana ČERNÁ, Frank LÖHR a Richard ŠTEFL. 1H, 13C, and 15N resonance assignments for the CTD-Interacting Domain of Nrd1 bound to Ser5-phosphorylated CTD of RNA Polymerase II. Biomolecular NMR Assignments. Netherlands: Springer Netherlands, 2011, roč. 5, č. 2, s. 203-205. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-011-9300-y.
      URL
      Název česky: Přířazení 1H, 13C, 15N rezonančních frekvencí CTD interagující domény proteinu Nrd1 v komplexu s 5pSer CTD RNA polymerázy II
      RIV/00216224:14740/11:00049411 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Černá, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Löhr, Frank (276 Německo) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CTD-interacting domain (CID); CTD; RNA-processing; transcription termination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 28. 3. 2012 00:08.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/927075/cs

    2010

    1. The Tubulin-Bound Structure of the Antimitotic Drug Tubulysin
      KUBICEK, Karel, S. Kaspar GRIMM, Julien ORTS, Florenz SASSE a Teresa CARLOMAGNO. The Tubulin-Bound Structure of the Antimitotic Drug Tubulysin. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim, Spolková republika Německo: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co., 2010, roč. 49, č. 28, s. 4809-4812. ISSN 1433-7851.
      URL
      Název anglicky: The Tubulin-Bound Structure of the Antimitotic Drug Tubulysin
      RIV/00216224:14310/10:00044991 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Německo.
      Kubicek, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Grimm, S. Kaspar (276 Německo) -- Orts, Julien (756 Švýcarsko) -- Sasse, Florenz (276 Německo) -- Carlomagno, Teresa (380 Itálie, garant)
      Klíčová slova anglicky: conformation analysis;cytotoxicity;microtubules;NMR spectroscopy;tubulysin
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 27. 1. 2011 15:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/901496/cs
    2. Unusual Interstrand Pt(S,S-diaminocyclohexane)-GG Crosslink Formed by Rearrangement of a Classical Intrastrand Crosslink Within a DNA Duplex
      KUBÍČEK, Karel, Jordan MONNET, Simone SCINTILLA, Jana KOPEČNÁ, Fabio ARNESANO, Lukáš TRANTÍREK, Claude CHOPARD, Giovanni NATILE a Jiří KOZELKA. Unusual Interstrand Pt(S,S-diaminocyclohexane)-GG Crosslink Formed by Rearrangement of a Classical Intrastrand Crosslink Within a DNA Duplex. Chemistry - An Asian Journal. WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2010, roč. 5, č. 2, s. 244-247. ISSN 1861-4728.
      URL
      Název anglicky: Unusual Interstrand Pt(S,S-diaminocyclohexane)-GG Crosslink Formed by Rearrangement of a Classical Intrastrand Crosslink Within a DNA Duplex
      RIV/00216224:14310/10:00043383 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Německo.
      Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Monnet, Jordan (250 Francie) -- Scintilla, Simone (380 Itálie) -- Kopečná, Jana (203 Česká republika) -- Arnesano, Fabio (380 Itálie) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika) -- Chopard, Claude (250 Francie) -- Natile, Giovanni (380 Itálie) -- Kozelka, Jiří (250 Francie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA structures; interstrand crosslinks; molecular modeling; NMR spectroscopy; platinum
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 27. 1. 2011 15:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/873033/cs
    3. (1)H, (13)C, and (15)N chemical shift assignments for the RNA recognition motif of Nab3.
      PERGOLI, Roberto, Karel KUBÍČEK, Fruzsina HÓBOR, Josef PASULKA a Richard ŠTEFL. (1)H, (13)C, and (15)N chemical shift assignments for the RNA recognition motif of Nab3. Biomolecular NMR Assignments. UNITED STATES: SPRINGER, 2010, roč. 4, č. 1, s. 119-121. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-010-9221-1.
      URL
      Název česky: Přiřazení (1)H, (13)C a (15)N rezonančních frekvencí RNA-rozpoznávacího motivu proteinu Nab3
      Název anglicky: (1)H, (13)C, and (15)N chemical shift assignments for the RNA recognition motif of Nab3.
      RIV/00216224:14310/10:00040504 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Pergoli, Roberto (380 Itálie, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nab3 - RNA-binding motif - RRM - Transcription termination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 17. 1. 2012 16:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878566/cs

    2009

    1. Recognition of phosphorylated CTD of RNA Pol II by Nrd1
      ČERNÁ, Hana, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Recognition of phosphorylated CTD of RNA Pol II by Nrd1. In Recognition of phosphorylated CTD of RNA Pol II by Nrd1. 2009. ISSN 1211-5894.
      Název česky: Recognition of phosphorylated CTD of RNA Pol II by Nrd1
      Název anglicky: Recognition of phosphorylated CTD of RNA Pol II by Nrd1
      RIV/00216224:14310/09:00028837 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Černá, Hana (203 Česká republika) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; CTD; RNA; transcription termination
      Změnil: prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362. Změněno: 25. 3. 2010 18:14.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/877472/cs
    2. Structure and RNA binding of Nab3
      HÓBOR, Fruzsina, Karel KUBÍČEK, Josef PASULKA a Richard ŠTEFL. Structure and RNA binding of Nab3. In Structure and RNA binding of Nab3. 2009. ISSN 1211-5894.
      Název anglicky: Structure and RNA binding of Nab3
      RIV/00216224:14310/09:00028838 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; Nab3; RNA binding ; transcription termination; structure
      Změnil: prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362. Změněno: 25. 3. 2010 18:15.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/877482/cs
    3. Transcription termination of nonpolyadenylated transcripts
      HÓBOR, Fruzsina, Hana ČERNÁ, Veronika BAČÍKOVÁ, Josef PASULKA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Transcription termination of nonpolyadenylated transcripts. In Transcription termination of nonpolyadenylated transcripts. 2009. ISSN 1211-5894.
      Název česky: Transcription termination of nonpolyadenylated transcripts
      Název anglicky: Transcription termination of nonpolyadenylated transcripts
      RIV/00216224:14310/09:00028836 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko) -- Černá, Hana (203 Česká republika) -- Bačíková, Veronika (203 Česká republika) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: RNA; transcription termination; NMR
      Změnil: prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362. Změněno: 25. 3. 2010 18:15.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/877455/cs

    2007

    1. Structural basis of the activity of the microtubule-stabilizing agent epothilone a studied by NMR spectroscopy in solution
      REESE, Marcel, Victor M SANCHEZ-PEDREGAL, Karel KUBÍČEK, Jens MEILER, Marcel J BLOMMERS, Christian GRIESINGER a Teresa CARLOMAGNO. Structural basis of the activity of the microtubule-stabilizing agent epothilone a studied by NMR spectroscopy in solution. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co., 2007, roč. 46, č. 11, s. 1864-1868. ISSN 1433-7851.
      URL
      Název česky: NMR studie strukturní podstaty aktivity epothilonu - ligandu, jenž stabilizuje mikrotubule
      RIV/00216224:14310/07:00032343 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Německo.
      Reese, Marcel (276 Německo) -- Sanchez-Pedregal, Victor M (724 Španělsko) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, garant) -- Meiler, Jens (276 Německo) -- Blommers, Marcel J (276 Německo) -- Griesinger, Christian (276 Německo) -- Carlomagno, Teresa (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: epothilones; NMR spectroscopy; structure elucidation; structure-activity relationships; tubulins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 29. 3. 2010 16:02.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/724898/cs

    2006

    1. The tubulin-bound conformation of discodermolide derived by NMR studies in solution supports a common pharmacophore model for epothilone and discodermolide
      SANCHEZ-PEDREGAL, Victor M, Karel KUBÍČEK, Jens MEILER, Isabelle LYOTHIER, Ian PATERSON a Teresa CARLOMAGNO. The tubulin-bound conformation of discodermolide derived by NMR studies in solution supports a common pharmacophore model for epothilone and discodermolide. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co., 2006, roč. 45, č. 44, s. 7388-7394. ISSN 1433-7851.
      URL
      Název česky: NMR studium konformace discodermolidu vázaném na tubulin podporuje společný model farmakoforu pro epothilone a discodermolid
      RIV/00216224:14310/06:00032342 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Německo.
      Sanchez-Pedregal, Victor M (724 Španělsko) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, garant) -- Meiler, Jens (276 Německo) -- Lyothier, Isabelle (250 Francie) -- Paterson, Ian (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Carlomagno, Teresa (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: conformation analysis; discodermolide; NMR spectroscopy; structure-activity relationships; tubulin
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 29. 3. 2010 16:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/724892/cs

    2005

    1. A copper(I) protein possibly involved in the assembly of CuA center of bacterial cytochrome c oxidase
      BANCI, Lucia, Ivano BERTINI, Simone CIOFI-BAFFONI, Efthalia KATSARI, Nikolaos KATSAROS, Karel KUBÍČEK a Stefano MANGANI. A copper(I) protein possibly involved in the assembly of CuA center of bacterial cytochrome c oxidase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. Washington, 2005, roč. 102, č. 11, s. 3994-3999. ISSN 0027-8424.
      URL
      Název česky: Cu(I) protein mající možná co do činění v uspořádávání CuA střediska bakteriální cytochrom-c oxidázy
      RIV: Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Banci, Lucia (380 Itálie) -- Bertini, Ivano (380 Itálie) -- Ciofi-Baffoni, Simone (380 Itálie) -- Katsari, Efthalia (300 Řecko) -- Katsaros, Nikolaos (300 Řecko) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, garant) -- Mangani, Stefano (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: cytochrome c oxidase assembly protein; copper protein; cupredoxin-like fold
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 12. 9. 2007 15:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/724884/cs

    2003

    1. A further investigation of the cytochrome b5-cytochrome c complex
      BANCI, Lucia, Ivano BERTINI, Isabella C FELLI, Ludwig KRIPPAHL, Karel KUBÍČEK, Jose J MOURA a Antonio ROSATO. A further investigation of the cytochrome b5-cytochrome c complex. Journal of Biological Inorganic Chemistry. Heidelberg: Springer Verlag, 2003, roč. 8, č. 7, s. 777-786. ISSN 0949-8257.
      URL
      Název česky: Další studium komplexu tvořeným cytochromem b5 s cytochromem c
      RIV: Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Německo.
      Banci, Lucia (380 Itálie) -- Bertini, Ivano (380 Itálie) -- Felli, Isabella C (380 Itálie) -- Krippahl, Ludwig (276 Německo) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, garant) -- Moura, Jose J (620 Portugalsko) -- Rosato, Antonio (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: cytochrome b5; cytochrome c; electron transfer; protein-protein interaction; protein recognition
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 12. 9. 2007 15:50.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/724879/cs
Zobrazeno: 7. 11. 2024 03:23